李自芳（1552年—1609年），字遂甫，号育科，江西抚州府东乡县人。明朝政治人物、进士出身。
万历十三年（1585年）乙酉科江西乡试举人，十七年（1589年）登己丑科进士，授广东新会县知县，擢国子监助教、刑部云南司主事、刑部郎中、汀州府知府[1]。
