美國南達科他州共有66個縣。1862年4月，達科他領地南部共成立14個縣，其中11個縣至今仍然存在。此後20多年間縣份數量迅速上升，州內於1890年時便有多達77個縣。其後部份縣與鄰近的縣合併，使州內的縣份數量逐漸下降。州內最新建立的縣為瓊斯縣，其於1916年11月7日成立，縣政府於1917年1月15日組成。隨着1945年華盛頓縣併入香農縣（今奧格拉拉-拉科塔縣）、1952年阿姆斯特朗縣併入杜威縣、1983年沃沙博縣併入傑克遜縣，州內的縣份數量便維持在66個。
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