孔灵珍（?—?），南北朝时鲁郡人。孔子二十八代孙，孔抚玄孙，孔懿曾孙，孔鲜之孙，孔乘长子。
孔灵珍在北魏做秘书郎，太和十九年（495年），魏孝文帝元宏至阙里祭祀孔子庙，下诏命从孔氏宗子中选取一人封爵，世袭以奉孔子祭祀事。孔灵珍被举荐，孝文帝封他为崇圣侯，食邑一百户。有两个儿子，为孔文泰、孔文僖。
