雁冠状病毒CB17
雁冠状病毒CB17
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病毒分类 
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| （未分级）： | 病毒 Virus |
| 域： | 核糖病毒域 Riboviria |
| 界： | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
| 门： | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
| 纲： | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
| 目： | 套式病毒目 Nidovirales |
| 科： | 冠状病毒科 Coronaviridae |
| 属： | 丙型冠状病毒属 Gammacoronavirus |
| 种： | 雁冠状病毒CB17 Goose coronavirus CB17
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雁冠状病毒CB17（Goose coronavirus CB17；CGCoV）是丙型冠状病毒属的一种病毒，国际病毒分类委员会将其认定为一个物种，为丙型冠状病毒属中Brangacovirus亚属的唯一物种[1]，此病毒是于2017年在加拿大死亡的加拿大雁与雪雁身上发现，于2020年发表[2]。
发现
[编辑]2017年秋季，地近北极圈的加拿大纽纳武特剑桥湾发生加拿大雁与雪雁集体死亡的事件，研究人员从泄殖腔采集样本，在一只加拿大雁的样本发现新种的丙型冠状病毒，并定序出完整基因组，即雁冠状病毒CB17。随后以PCR检测，又在另一只加拿大雁与一只雪雁的样本发现此病毒的序列[2]。
病毒学
[编辑]雁冠状病毒CB17的基因组长28539nt，除冠状病毒皆有的复制酶、刺突蛋白、外膜蛋白、膜蛋白与衣壳蛋白外，此病毒还有10个编码辅助蛋白的开放阅读框，其基因顺序为复制酶1ab－刺突蛋白（S）－3－4a－外膜蛋白（E）－膜蛋白（M）－5b－6－7a－7b－8a－8b－衣壳蛋白（N）－10－11。冠状病毒的复制酶1ab与1a一般可分别被自身蛋白酶切割成11个或15个非结构蛋白（nsp），但此病毒1a的nsp10和nsp11间，以及1ab的nsp10和nsp12间均缺乏切割位点，因此其非结构蛋白总数比其他冠状病毒少一，在nsp10/nsp11和nsp10/nsp12分别形成一个比其他冠状病毒的nsp10和nsp12略大的非结构蛋白[2]。
雁冠状病毒CB17的辅助蛋白总数比同属的禽冠状病毒多了4个，且有6种辅助蛋白是后者没有的，其刺突蛋白与外膜蛋白的基因之间不具有禽冠状病毒和鲸豚冠状病毒皆有的辅助蛋白3a与3b，此病毒在此区虽有3与4a两个辅助蛋白的序列，但此二者及另两个辅助蛋白（6与7b）皆为此病毒特有，不见于其他病毒；辅助蛋白10与11除此病毒外仅见于另一在挪威灰雁身上发现的冠状病毒[3]；5b与7a皆与禽冠状病毒的4b同源，可能是基因重复的结果；8a与8b则分别与禽冠状病毒的5a和5b同源（同属的鲸豚冠状病毒中也有与这两者同源的辅助蛋白）[2]。
此病毒是否直接导致加拿大雁与雪雁的死亡，以及其感染致病机制，皆有待进一步研究阐明[2]。
分类
[编辑]雁冠状病毒CB17与同属其他物种（禽冠状病毒、鲸豚冠状病毒）复制酶保守区的序列相似度皆低于90%，因此被归为一新种，为丙型冠状病毒Brangacovirus亚属中的唯一物种[1]。以复制酶保守区做出的演化树显示此病毒为Igacovirus亚属（包含禽冠状病毒、禽冠状病毒9203与鸭冠状病毒2714等三个物种）的姊妹群[2][4]。
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相关病毒
[编辑]2005年，挪威的灰雁身上也发现有丙型冠状病毒（但未定出完整基因组序列）[3]，雁冠状病毒CB17的结构蛋白序列和禽冠状病毒与火鸡冠状病毒的相似度介于53%至72%之间，与前述灰雁身上的冠状病毒相似度较高，且灰雁病毒亦具有和CB17的辅助蛋白10与11同源的蛋白，其他冠状病毒则无，因此这两种病毒可能关系较为接近[2]。此外白令海峡一带的黑雁身上也发现过丙型冠状病毒，有可能与挪威灰雁的冠状病毒相似，但仍需更多数据阐明[5]。
参考文献
[编辑]- ^ 1.0 1.1 de Groot RJ, Baker SC, Baric R; et al. Coronaviridae 2019 release. International Committee on the Taxonomy of Viruses. 2020.[失效链接]
- ^ 2.0 2.1 2.2 2.3 2.4 2.5 2.6 Papineau, Amber; Berhane, Yohannes; Wylie, Todd N.; Wylie, Kristine M.; Sharpe, Samuel; Lung, Oliver. Genome Organization of Canada Goose Coronavirus, A Novel Species Identified in a Mass Die-off of Canada Geese. Scientific Reports. 2019, 9 (1). ISSN 2045-2322. PMC 6459860
. PMID 30976080. doi:10.1038/s41598-019-42355-y.
- ^ 3.0 3.1 Jonassen, Christine Monceyron; Kofstad, Tone; Larsen, Inger-Lise; Løvland, Atle; Handeland, Kjell; Follestad, Arne; Lillehaug, Atle. Molecular identification and characterization of novel coronaviruses infecting graylag geese (Anser anser), feral pigeons (Columbia livia) and mallards (Anas platyrhynchos). Journal of General Virology. 2005, 86 (6): 1597–1607. ISSN 0022-1317. PMID 15914837. doi:10.1099/vir.0.80927-0.
- ^ Wille, Michelle; Holmes, Edward C. Wild birds as reservoirs for diverse and abundant gamma- and deltacoronaviruses. FEMS Microbiology Reviews. 2020, 44 (5): 631–644. ISSN 0168-6445. PMC 7454673 . PMID 32672814. doi:10.1093/femsre/fuaa026.
- ^ Liu, Ding Xiang; Muradrasoli, Shaman; Bálint, Ádám; Wahlgren, John; Waldenström, Jonas; Belák, Sándor; Blomberg, Jonas; Olsen, Björn. Prevalence and Phylogeny of Coronaviruses in Wild Birds from the Bering Strait Area (Beringia). PLoS ONE. 2010, 5 (10): e13640. ISSN 1932-6203. PMC 2966397 . PMID 21060827. doi:10.1371/journal.pone.0013640.
