演化網絡
外觀
演化網絡(英語:Phylogenetic network)是以圖來表示生物的核酸序列、基因、染色體、基因組、和物種[1]之間演化的關係。[2]演化樹(英語:Phylogenetic tree)的樹狀結構不足以表達生物演化關係中雜交、基因水平轉移、遺傳重組、和基因重複等事件,因此演化網絡容許在圖上存在些混合節點來表達此類關係。演化樹是演化網絡的一個子集。演化網絡可以被推測和被軟件可視化例如SplitsTree[3]以及最近的軟件,Dendroscope。
參見
[編輯]參考資料
[編輯]- ^ D. H. Huson, R. Rupp and C. Scornavacca, Phylogenetic Networks (頁面存檔備份,存於互聯網檔案館), Cambridge University Press (2010).
- ^ Huson, DH and Scornavacca, C (2011). A survey of combinatorial methods for phylogenetic networks Genome Biology and Evolution, 3:23-35.
- ^ D. H. Huson and D. Bryant, Application of Phylogenetic Networks in Evolutionary Studies, Mol. Biol. Evol., 23(2):254-267, 2006.
- Makarenkov, V., Kevorkov, D. and Legendre, P. (2006),Phylogenetic Network Reconstruction Approaches (頁面存檔備份,存於互聯網檔案館), Applied Mycology and Biotechnology, International Elsevier Series, vol. 6. Bioinformatics, 61-97.
- [1] (頁面存檔備份,存於互聯網檔案館), Who is Who in Phylogenetic Networks.
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