Rm1病毒
外观
Rm1病毒 | |
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病毒分类 | |
(未分级): | 病毒 Virus |
域: | 核糖病毒域 Riboviria |
界: | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
门: | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
纲: | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
目: | 套式病毒目 Nidovirales |
科: | 冠状病毒科 Coronaviridae |
属: | 乙型冠状病毒属 Betacoronavirus |
亚属: | SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus |
种: | Rm1病毒 SARSr-CoV
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毒株: | Rm1病毒 Rm1
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蝙蝠冠状病毒Rm1(Bat SARS CoV Rm1/2004)是严重急性呼吸系统综合症相关冠状病毒(SARSr-CoV)的一个病毒株,为SARS-CoV相关病毒,在中国湖北的大耳菊头蝠样本中发现,于2005年发表。
发现
[编辑]2004年3月至11月,研究人员在中国广东、天津、广西与湖北四省市采集蝙蝠样本,在湖北宜昌皮氏菊头蝠的粪便样本中发现SARS相关病毒,即Rm1病毒,于2005年和Rf1病毒与Rp3病毒一起发表[1]。
基因组
[编辑]Rm1病毒的基因组长29749nt[2],序列与SARS-CoV的相似度为88.2%[3],其ORF8和人类以外的大多数SARSr-CoV一样有一段长29nt的插入序列,为一完整的开放阅读框,人类的ORF8则因缺少此序列而被分成8a与8b两个较小的开放阅读框。Rm1的ORF8(121个氨基酸)比人类SARS病毒ORF8辅助蛋白(121个氨基酸)少一个氨基酸,且两者氨基酸序列相似度仅35%[1]。另外Rm1与许多蝙蝠SARSr-CoV一样在刺突蛋白的受体结合结构域(receptor binding domain, RBD)有两段分别长5和12个氨基酸的序列缺失(但不见于WIV1病毒与SHC014病毒)[4]。
参考文献
[编辑]- ^ 1.0 1.1 Li, W. Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses. Science. 2005, 310 (5748): 676–679. ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391.
- ^ Bat SARS coronavirus Rm1, complete genome. NCBI. [2021-01-28]. (原始内容存档于2021-04-13).
- ^ Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; Wu, Li-Jun; Ge, Xing-Yi; Zhang, Yun-Zhi; Daszak, Peter; Wang, Lin-Fa; Shi, Zheng-Li; Perlman, S. Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus. Journal of Virology. 2016, 90 (6): 3253–3256. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.02582-15.
- ^ Lau, Susanna K. P.; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes K. H.; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth S. M.; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; et al. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination. Journal of Virology. 2015, 89 (20): 10532–10547. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.01048-15.