UniProt

聯合的蛋白
內容
有機體	所有
相關資訊
研究中心	英國EMBL-EBI、瑞士SIB（英語：Swiss Institute of Bioinformatics）、美國PIR（英語：Protein Information Resource）
訪問入口
資料格式	Custom flat file, FASTA（英語：FASTA）, GFF（英語：GFF）, RDF, XML.
網站	www.uniprot.org
下載位址	www.uniprot.org/downloads&用於下載完整的數據集ftp.uniprot.org
網路服務位址	是 – JAVA應用程式介面在這裡看到資訊&表現層狀態轉換在這裡看到資訊
工具
Web	高級搜尋，BLAST，ClustalO，批次檢索/下載，ID對映
其他
許可	創作共享署名-禁止改作
版本	是
數據發佈頻率	4周一次
管理政策	是 – 手動和自動。資料庫監護人和計算演算法生成的自動註釋規則。
可否列為書籤	是 – 個別蛋白質條目和搜尋

UniProt（聯合的蛋白）是一個全面的，高品質的，免費使用的蛋白質序列與功能資訊資料庫，許多內容來自基因組計劃，它還包含了大量來自研究文獻的關於蛋白的生物學功能資訊。

UniProt共同體

UniProt共同體由歐洲生物資訊研究所, 瑞士生物資訊研究所（英語：Swiss Institute of Bioinformatics），以及美國Protein Information Resource（英語：Protein Information Resource）組成。歐洲生物資訊研究所坐落於英國茵格斯頓（英語：Hinxton）的Wellcome Trust Genome Campus（英語：Wellcome Trust Genome Campus），擁有大量的生物資訊學資料庫及服務資源。瑞士生物資訊研究所位於瑞士的日內瓦，維持專家蛋白質分析系統（英語：ExPASy）（Expert Protein Analysis System，一個蛋白質組學工具和資料庫資源中心）伺服器的運作。2002年，EBI，SIB和PIR聯合成為UniProt共同體^[1]。

UniProt資料庫的根源

每個共同體成員都積極參與蛋白質資料庫維護和注釋。直到最近，EBI和SIB一起生產了Swiss-Prot和TrEMBL資料庫，而PIR生產了蛋白質序列資料庫（PIR-PSD）^[2]^[3]^[4]。這些資料庫與不同的蛋白質序列覆蓋和注釋優先級共存。

參考文獻

^ 2002 Release: NHGRI Funds Global Protein Database. National Human Genome Research Institute (NHGRI). [14 April 2018]. （原始內容存檔於2015-09-24）.
^ O'Donovan, C.; Martin, M. J.; Gattiker, A.; Gasteiger, E.; Bairoch, A.; Apweiler, R. High-quality protein knowledge resource: SWISS-PROT and TrEMBL. Briefings in Bioinformatics. 2002, 3 (3): 275–284. PMID 12230036. doi:10.1093/bib/3.3.275.
^ Wu, C. H.; Yeh, L. S.; Huang, H.; Arminski, L.; Castro-Alvear, J.; Chen, Y.; Hu, Z.; Kourtesis, P.; Ledley, R. S.; Suzek, B. E.; Vinayaka, C. R.; Zhang, J.; Barker, W. C. The Protein Information Resource. Nucleic Acids Research. 2003, 31 (1): 345–347. PMC 165487 . PMID 12520019. doi:10.1093/nar/gkg040.
^ Boeckmann, B.; Bairoch, A.; Apweiler, R.; Blatter, M. C.; Estreicher, A.; Gasteiger, E.; Martin, M. J.; Michoud, K.; O'Donovan, C.; Phan, I.; Pilbout, S.; Schneider, M. The SWISS-PROT protein knowledgebase and its supplement TrEMBL in 2003. Nucleic Acids Research. 2003, 31 (1): 365–370. PMC 165542 . PMID 12520024. doi:10.1093/nar/gkg095.

外部連結

[1] 2002 Release: NHGRI Funds Global Protein Database. National Human Genome Research Institute (NHGRI). [14 April 2018]. （原始內容存檔於2015-09-24）.

[pmid12230036-2] O'Donovan, C.; Martin, M. J.; Gattiker, A.; Gasteiger, E.; Bairoch, A.; Apweiler, R. High-quality protein knowledge resource: SWISS-PROT and TrEMBL. Briefings in Bioinformatics. 2002, 3 (3): 275–284. PMID 12230036. doi:10.1093/bib/3.3.275.

[pmid12520019-3] Wu, C. H.; Yeh, L. S.; Huang, H.; Arminski, L.; Castro-Alvear, J.; Chen, Y.; Hu, Z.; Kourtesis, P.; Ledley, R. S.; Suzek, B. E.; Vinayaka, C. R.; Zhang, J.; Barker, W. C. The Protein Information Resource. Nucleic Acids Research. 2003, 31 (1): 345–347. PMC 165487 . PMID 12520019. doi:10.1093/nar/gkg040.

[pmid12520024-4] Boeckmann, B.; Bairoch, A.; Apweiler, R.; Blatter, M. C.; Estreicher, A.; Gasteiger, E.; Martin, M. J.; Michoud, K.; O'Donovan, C.; Phan, I.; Pilbout, S.; Schneider, M. The SWISS-PROT protein knowledgebase and its supplement TrEMBL in 2003. Nucleic Acids Research. 2003, 31 (1): 365–370. PMC 165542 . PMID 12520024. doi:10.1093/nar/gkg095.

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閱論編生物資訊學
資料庫	定序資料庫：GenBank、European Nucleotide Archive（英語：European Nucleotide Archive）、日本DNA資料庫(DDBJ) 輔助資料庫：UniProt, database of protein sequences grouping together Swiss-Prot, TrEMBL 和蛋白質資訊資源（英語：Protein Information Resource）其它資料庫：蛋白質資料庫, Ensembl, 和InterPro（英語：InterPro）專項基因組資料庫：酵母基因組資料庫（英語：Saccharomyces Genome Database）、FlyBase（英語：FlyBase）、VectorBase（英語：VectorBase）、PomBase、WormBase（英語：WormBase）、PHI-base（英語：PHI-base）、阿拉伯芥資訊資源（英語：The Arabidopsis Information Resource）與斑馬魚資訊網（英語：Zebrafish Information Network）
軟體	BLAST Bowtie Clustal EMBOSS（英語：EMBOSS） HMMER（英語：HMMER） MUSCLE SAMtools（英語：SAMtools） TopHat（英語：TopHat (bioinformatics)）
其它	伺服器：ExPASy（英語：ExPASy）本體論：基因本體
機構	歐洲生物資訊研究所(EMBL-EBI) 歐洲分子生物學實驗室(EMBL) 美國國家生物技術資訊中心（NCBI）瑞士生物資訊學研究所（英語：Swiss Institute of Bioinformatics）日本國立遺傳學研究所博德研究所（英語：Broad Institute）維康桑格研究所斯克里普斯研究所(TSRI)
檔案格式	FASTA格式 FASTQ格式斯德哥爾摩格式（英語：Stockholm format）
有關議題	計算生物學分子種系發生學定序序列比對
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