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1. 外交部部长 钱其琛 2. 国防部部长 秦基伟（兼） 3. 国家计划委员会主任 姚依林 → 邹家华（兼） 4. 国家经济体制改革委员会主任 李 鹏（兼） → 陈锦华 5. 国家教育委员会主任 李铁映（兼） 6. 国家科学技术委员会主任 宋 健（兼） 7. 国防科学技术工业委员会主任 丁衡高 8. 国家民族事务委员会主任 司马义·艾买提（维吾尔族） 9. 公安部部长 王 芳（兼） → 陶驷驹 10. 国家安全部部长 贾春旺 11. 监察部部长 尉健行 12. 民政部部长 崔乃夫 13. 司法部部长 蔡 诚 14. 财政部部长 王丙干（兼） → 刘仲藜 15. 人事部部长 赵东宛 16. 劳动部部长 罗 干 → 阮崇武 → 17. 地质矿产部部长 朱 训 18. 建设部部长 林汉雄 → 侯 捷 19. 能源部部长 黄毅诚 20. 铁道部部长 李森茂 → 韩杼滨 21. 交通部部长 钱永昌 → 黄镇东
22. 机械电子工业部部长 邹家华（兼） → 何光远 23. 航空航天工业部部长 林宗棠 24. 冶金工业部部长 戚元靖 25. 化学工业部部长 秦仲达 → 顾秀莲（女） 26. 轻工业部部长 曾宪林 27. 纺织工业部部长 吴文英（女） 28. 邮电部部长 杨泰芳 29. 水利部部长 杨振怀 30. 农业部部长 何 康 → 刘中一 31. 林业部部长 高德占 32. 商业部部长 胡 平 33. 对外经济贸易部部长 郑拓彬 → 李岚清 34. 物资部部长 柳随年 35. 文化部部长 王 蒙 → 贺敬之（代） → 刘忠德 36. 广播电影电视部部长 艾知生 37. 卫生部部长 陈敏章 38. 国家体育运动委员会主任 李梦华 → 伍绍祖 39. 国家计划生育委员会主任 彭珮云（女） 40. 中国人民银行行长 李贵鲜（兼） 41. 审计署审计长 吕培俭
