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1. 外交部部長 錢其琛 2. 國防部部長 秦基偉（兼） 3. 國家計劃委員會主任 姚依林 → 鄒家華（兼） 4. 國家經濟體制改革委員會主任 李 鵬（兼） → 陳錦華 5. 國家教育委員會主任 李鐵映（兼） 6. 國家科學技術委員會主任 宋 健（兼） 7. 國防科學技術工業委員會主任 丁衡高 8. 國家民族事務委員會主任 司馬義·艾買提（維吾爾族） 9. 公安部部長 王 芳（兼） → 陶駟駒 10. 國家安全部部長 賈春旺 11. 監察部部長 尉健行 12. 民政部部長 崔乃夫 13. 司法部部長 蔡 誠 14. 財政部部長 王丙乾（兼） → 劉仲藜 15. 人事部部長 趙東宛 16. 勞動部部長 羅 干 → 阮崇武 → 17. 地質礦產部部長 朱 訓 18. 建設部部長 林漢雄 → 侯 捷 19. 能源部部長 黃毅誠 20. 鐵道部部長 李森茂 → 韓杼濱 21. 交通部部長 錢永昌 → 黃鎮東
22. 機械電子工業部部長 鄒家華（兼） → 何光遠 23. 航空航天工業部部長 林宗棠 24. 冶金工業部部長 戚元靖 25. 化學工業部部長 秦仲達 → 顧秀蓮（女） 26. 輕工業部部長 曾憲林 27. 紡織工業部部長 吳文英（女） 28. 郵電部部長 楊泰芳 29. 水利部部長 楊振懷 30. 農業部部長 何 康 → 劉中一 31. 林業部部長 高德占 32. 商業部部長 胡 平 33. 對外經濟貿易部部長 鄭拓彬 → 李嵐清 34. 物資部部長 柳隨年 35. 文化部部長 王 蒙 → 賀敬之（代） → 劉忠德 36. 廣播電影電視部部長 艾知生 37. 衛生部部長 陳敏章 38. 國家體育運動委員會主任 李夢華 → 伍紹祖 39. 國家計劃生育委員會主任 彭珮雲（女） 40. 中國人民銀行行長 李貴鮮（兼） 41. 審計署審計長 呂培儉
