組織蛋白酶F

組織蛋白酶F
已知的結構
PDB	直系同源搜索: PDBe RCSB
PDBID列表
	1M6D
識別號
別名	CTSF；, CATSF, CLN13, cathepsin F
外部ID	OMIM：603539 MGI：1861434 HomoloGene：31194 GeneCards：CTSF
相關疾病
	neuronal ceroid lipofuscinosis 13、adult neuronal ceroid lipofuscinosis
基因位置（人類）
染色體	11號染色體
終止	66,568,879 bp
基因位置（小鼠）
染色體	小鼠19號染色體
終止	4,910,946 bp
RNA表達模式
	查閱更多表達數據
基因本體
分子功能	• 肽酶活性; • 半胱氨酸型肽酶活性; • 水解酶活性; • cysteine-type endopeptidase activity;
細胞組分	• 細胞外囊泡; • 溶酶體; • lysosomal lumen; • 外排體; • 細胞外空間; • collagen-containing extracellular matrix;
生物學過程	• proteolysis involved in cellular protein catabolic process; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; • 蛋白酶解;
	Sources:Amigo / QuickGO
直系同源
	8722
	56464
	ENSG00000174080
	ENSMUSG00000083282
	Q9UBX1
	Q9R013
	NM_003793
	NM_019861
	NP_003784
	NP_063914
	維基數據
檢視/編輯人類	檢視/編輯小鼠

組織蛋白酶F（英文：Cathepsin F）是一種在人體中由CTSF基因編碼的蛋白質。^[6]^[7]^[8]

木瓜樣蛋白酶是半胱氨酸蛋白酶家族，代表溶酶體蛋白水解系統的主要成分。通常，組織蛋白酶包含一個信號肽，然後是一個前肽，再然後是一個催化活性成熟區。組織蛋白酶F前體非常長的（251個氨基酸殘基）前區包含一個與組織蛋白酶L樣酶的前段相似的C端結構域、一個50個殘基的柔性連接肽和N端結構域預計採用胱抑素樣摺疊組織蛋白酶F前區在木瓜蛋白酶家族半胱氨酸蛋白酶中是獨一無二的，因為它包含這個額外的N端片段，預計與胱抑素超家族的半胱氨酸蛋白酶抑制劑具有結構相似性。這種胱抑素樣結構域包含一些已知對抑制活性很重要的元素。CTSF編碼預測的484個氨基酸的蛋白質，其中包含19個殘基信號肽。組織蛋白酶F含有五個潛在的N-連接糖基化位點，它可能通過甘露糖6-磷酸受體途徑靶向內體/溶酶體區室。組織蛋白酶F基因普遍表達，它定位於染色體11q13，接近編碼組織蛋白酶W的基因。^[8]

泰國肝吸蟲的免疫診斷

組織蛋白酶F可用作測試泰國肝吸蟲造成的疾病的替代方法。^[9]近年來，泰國肝吸蟲的診斷一直通過大便檢查來完成，被認為是「金標準」方法。然而，基於糞便的診斷可能是不可靠的^[10]，儘管它是一種非侵入性方法。進行的實驗表明，通過使用重組DNA技術和組織蛋白酶F半胱氨酸蛋白酶，可以產生更可靠的結果。

組織蛋白酶F在蝦夷盤扇貝中的表達

最近的實驗表明在蝦夷盤扇貝中發現了組織蛋白酶F。^[11]在蝦夷盤扇貝的各個胚胎發育階段鑑定組織蛋白酶F基因具有重要意義。組織蛋白酶F基因在先天免疫反應中具有重要作用。蝦夷盤扇貝一直因細菌性疾病而遭受高死亡率。組織蛋白酶F的發現可以領導進一步的研究和解決蝦夷盤扇貝死亡率問題的方法。

參考文獻

^ 與组织蛋白酶F相關的疾病；在維基數據上查看/編輯參考.
^ ^2.0 ^2.1 ^2.2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000174080 - Ensembl, May 2017
^ ^3.0 ^3.1 ^3.2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000083282 - Ensembl, May 2017
^ Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Mouse PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Wang B, Shi GP, Yao PM, Li Z, Chapman HA, Bromme D. Human cathepsin F. Molecular cloning, functional expression, tissue localization, and enzymatic characterization. J Biol Chem. Dec 1998, 273 (48): 32000–8. PMID 9822672. doi:10.1074/jbc.273.48.32000 .
^ Santamaria I, Velasco G, Pendas AM, Paz A, Lopez-Otin C. Molecular cloning and structural and functional characterization of human cathepsin F, a new cysteine proteinase of the papain family with a long propeptide domain. J Biol Chem. Jun 1999, 274 (20): 13800–9. PMID 10318784. doi:10.1074/jbc.274.20.13800 .
^ ^8.0 ^8.1 Entrez Gene: CTSF cathepsin F.
^ Teimoori, Salma; Arimatsu, Yuji; Laha, Thewarach; Kaewkes, Sasithorn; Sereerak, Piya; Tangkawattana, Sirikachorn; Brindley, Paul J; Sripa, Banchob. Immunodiagnosis of opisthorchiasis using parasite cathepsin F. Parasitology Research. December 2015, 114 (12): 4571–4578. ISSN 0932-0113. PMC 4917378 . PMID 26344868. doi:10.1007/s00436-015-4703-9 （英語）.
^ Korkmaz, Huseyin; Findik, Duygu; Ugurluoglu, Ceyha; Terzi, Yuksel. Reliability of stool antigen tests: investigation of the diagnostic value of a new immunochromatographic Helicobacter pylori approach in dyspeptic patients. Asian Pacific Journal of Cancer Prevention. 2015, 16 (2): 657–660. ISSN 2476-762X. PMID 25684503. doi:10.7314/apjcp.2015.16.2.657 .
^ Guo, Haobing; Li, Yangping; Zhang, Meiwei; Li, Ruojiao; Li, Wanru; Lou, Jiarun; Bao, Zhenmin; Wang, Yangfan. Expression of Cathepsin F in response to bacterial challenges in Yesso scallop Patinopecten yessoensis. Fish & Shellfish Immunology. September 2018, 80: 141–147 [2022-10-27]. PMID 29879509. S2CID 47014597. doi:10.1016/j.fsi.2018.06.005. （原始內容存檔於2022-08-06）（英語）.

拓展閱讀

Nägler DK, Sulea T, Ménard R. Full-length cDNA of human cathepsin F predicts the presence of a cystatin domain at the N-terminus of the cysteine protease zymogen.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1999, 257 (2): 313–8. PMID 10198209. doi:10.1006/bbrc.1999.0461.
Wex T, Levy B, Wex H, Brömme D. Human cathepsins F and W: A new subgroup of cathepsins.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1999, 259 (2): 401–7. PMID 10362521. doi:10.1006/bbrc.1999.0700.
Wex T, Wex H, Brömme D. The human cathepsin F gene--a fusion product between an ancestral cathepsin and cystatin gene.. Biol. Chem. 2000, 380 (12): 1439–42. PMID 10661872. S2CID 28469574. doi:10.1515/BC.1999.185.
Shi GP, Bryant RA, Riese R, et al. Role for cathepsin F in invariant chain processing and major histocompatibility complex class II peptide loading by macrophages.. J. Exp. Med. 2000, 191 (7): 1177–86. PMC 2193169 . PMID 10748235. doi:10.1084/jem.191.7.1177.
Deussing J, Tisljar K, Papazoglou A, Peters C. Mouse cathepsin F: cDNA cloning, genomic organization and chromosomal assignment of the gene.. Gene. 2000, 251 (2): 165–73. PMID 10876093. doi:10.1016/S0378-1119(00)00196-7.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. PMC 139241 . PMID 12477932. doi:10.1073/pnas.242603899 .
Oörni K, Sneck M, Brömme D, et al. Cysteine protease cathepsin F is expressed in human atherosclerotic lesions, is secreted by cultured macrophages, and modifies low density lipoprotein particles in vitro.. J. Biol. Chem. 2004, 279 (33): 34776–84. PMID 15184381. doi:10.1074/jbc.M310814200 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 2004, 14 (10B): 2121–7. PMC 528928 . PMID 15489334. doi:10.1101/gr.2596504.
Vazquez-Ortiz G, Pina-Sanchez P, Vazquez K, et al. Overexpression of cathepsin F, matrix metalloproteinases 11 and 12 in cervical cancer.. BMC Cancer. 2006, 5 (1): 68. PMC 1175083 . PMID 15989693. doi:10.1186/1471-2407-5-68.
Kaakinen R, Lindstedt KA, Sneck M, et al. Angiotensin II increases expression and secretion of cathepsin F in cultured human monocyte-derived macrophages: an angiotensin II type 2 receptor-mediated effect.. Atherosclerosis. 2007, 192 (2): 323–7. PMID 16963053. doi:10.1016/j.atherosclerosis.2006.08.001.

外部連結

The MEROPS online database for peptidases and their inhibitors: C01.018

[1] 與组织蛋白酶F相關的疾病；在維基數據上查看/編輯參考.

[refGRCh38Ensembl-2] 2.0 ^2.1 ^2.2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000174080 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-3] 3.0 ^3.1 ^3.2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000083282 - Ensembl, May 2017

[4] Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[5] Mouse PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid9822672-6] Wang B, Shi GP, Yao PM, Li Z, Chapman HA, Bromme D. Human cathepsin F. Molecular cloning, functional expression, tissue localization, and enzymatic characterization. J Biol Chem. Dec 1998, 273 (48): 32000–8. PMID 9822672. doi:10.1074/jbc.273.48.32000 .

[pmid10318784-7] Santamaria I, Velasco G, Pendas AM, Paz A, Lopez-Otin C. Molecular cloning and structural and functional characterization of human cathepsin F, a new cysteine proteinase of the papain family with a long propeptide domain. J Biol Chem. Jun 1999, 274 (20): 13800–9. PMID 10318784. doi:10.1074/jbc.274.20.13800 .

[entrez-8] 8.0 ^8.1 Entrez Gene: CTSF cathepsin F.

[9] Teimoori, Salma; Arimatsu, Yuji; Laha, Thewarach; Kaewkes, Sasithorn; Sereerak, Piya; Tangkawattana, Sirikachorn; Brindley, Paul J; Sripa, Banchob. Immunodiagnosis of opisthorchiasis using parasite cathepsin F. Parasitology Research. December 2015, 114 (12): 4571–4578. ISSN 0932-0113. PMC 4917378 . PMID 26344868. doi:10.1007/s00436-015-4703-9 （英語）.

[10] Korkmaz, Huseyin; Findik, Duygu; Ugurluoglu, Ceyha; Terzi, Yuksel. Reliability of stool antigen tests: investigation of the diagnostic value of a new immunochromatographic Helicobacter pylori approach in dyspeptic patients. Asian Pacific Journal of Cancer Prevention. 2015, 16 (2): 657–660. ISSN 2476-762X. PMID 25684503. doi:10.7314/apjcp.2015.16.2.657 .

[11] Guo, Haobing; Li, Yangping; Zhang, Meiwei; Li, Ruojiao; Li, Wanru; Lou, Jiarun; Bao, Zhenmin; Wang, Yangfan. Expression of Cathepsin F in response to bacterial challenges in Yesso scallop Patinopecten yessoensis. Fish & Shellfish Immunology. September 2018, 80: 141–147 [2022-10-27]. PMID 29879509. S2CID 47014597. doi:10.1016/j.fsi.2018.06.005. （原始內容存檔於2022-08-06）（英語）.

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閱論編蛋白酶類：半胱氨酸蛋白酶類（EC 3.4.22)
胱天蛋白酶	胱天蛋白酶1 胱天蛋白酶2 胱天蛋白酶3 胱天蛋白酶4 胱天蛋白酶5 胱天蛋白酶6 胱天蛋白酶7 胱天蛋白酶8 胱天蛋白酶9 胱天蛋白酶10 胱天蛋白酶11 胱天蛋白酶12 胱天蛋白酶13 胱天蛋白酶14
來自果實	木瓜蛋白酶無花果蛋白酶（英語：Ficain）鳳梨蛋白酶獼猴桃蛋白酶
鈣蛋白酶	CAPN1 CAPN2 CAPN3 CAPN5 CAPN6 CAPN7 CAPN8 CAPN9 CAPN10 CAPN11 CAPN12 CAPN13 CAPN14 CAPNS1 CAPNS2
組織蛋白酶	B C F H K L1/L2 O S T W Z
其它	梭菌蛋白酶癌性促凝物質分離酶（英語：Separase） Autophagin Cruzipain 3C樣蛋白酶
EC 1.1/2/3/4/5/6/7/8/9/10/11/12/13/14/15/16/17/18/19/20/21/22 · 2.1/2/3/4/5/6/7(2.7.10/11-12)/8/9 · 3.1/2/3/4(3.4.21/22/23/24)/5/6/7/8/9/10/11/12/13 · 4.1/2/3/4/5/6 · 5.1/2/3/4/5/99 · 6.1-3（英語：Template:Ligases CO CS and CN）/4/5-6

閱論編酶
活性	活性位點結合位點催化三聯體負氧離子洞酶催化混雜（英語：Enzyme promiscuity）催化最適酶（英語：Catalytically perfect enzyme）輔因子輔酶酶促反應
調節	別構調節協同性（英語：Cooperativity）酶抑制劑酶激活劑
分類	EC編號蛋白質超家族蛋白質家族酶列表
動力學	酶動力學伊迪-霍夫斯蒂圖（英語：Eadie–Hofstee diagram）哈尼斯-伍爾夫圖（英語：Hanes–Woolf plot）雙倒數圖米氏動力學
類型	EC1 氧化還原酶（列表（英語：List of EC numbers (EC 1)）） EC2 轉移酶（列表（英語：List of EC numbers (EC 2)）） EC3 水解酶（列表（英語：List of EC numbers (EC 3)）） EC4 裂合酶（列表（英語：List of EC numbers (EC 4)）） EC5 異構酶（列表（英語：List of EC numbers (EC 5)）） EC6 連接酶（列表（英語：List of EC numbers (EC 6)）） EC7 移位酶（英語：Translocase）（列表（英語：List of EC numbers (EC 7)））