16BO133病毒

16BO133病毒
病毒分類
（未分級）：	病毒 Virus
域：	核糖病毒域 Riboviria
界：	正核糖病毒界 Orthornavirae
門：	小核糖病毒門 Pisuviricota
綱：	小南嵌套病毒綱 Pisoniviricetes
目：	套式病毒目 Nidovirales
科：	冠狀病毒科 Coronaviridae
屬：	乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus
亞屬：	SARS乙型冠狀病毒亞屬 Sarbecovirus
種：	嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒 SARSr-CoV
毒株：	16BO133病毒 16BO133

16BO133病毒是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，在韓國的馬鐵菊頭蝠中發現，於2019年發表，其基因組被完整定序，是首個被完整定序的韓國SARSr-CoV病毒株，在SARSr-CoV中屬於SARS-CoV相關病毒，與其基因組序列相似度為82.8%。

發現

16BO133病毒於2016年在韓國馬鐵菊頭蝠的口腔樣本中被發現，此病毒株的基因組長29075nt。在SARSr-CoV中，16BO133和2016年發表、自中國吉林馬鐵菊頭蝠中發現的JTMC15病毒最為接近，基因組核酸序列相似度為98.3%，與其他SARSr-CoV相較之下，這兩個病毒株因爲ORF7b末端的框移突變而喪失了ORF8^[1]^[2]。16BO133病毒和SARS-CoV的基因組核酸序列相似度則為82.8%^[3]。

過去雖有其他SARSr-CoV病毒株在韓國被發現（B15-21病毒等），但皆無完整序列定序^[4]，16BO133病毒是首個被完整定序的韓國SARSr-CoV病毒株^[1]。

演化樹

截至2021年1月 (2021-01)^[update]，SARS-CoV與相關病毒株的系統發生樹：

16BO133 與SARS-COV相似度82.8 % · 馬鐵菊頭蝠 · 韓國全羅北道（2016年採集、2019年發表）^[1]

	Rf1 87.8 % · 馬鐵菊頭蝠 · 中國湖北宜昌（2004年採集、2005年發表）^[5]

	BtCoV HKU3 87.9 % · 中華菊頭蝠 · 香港、中國廣東（2004年採集、2005年發表、2010年又發表若干新病毒株）^[6]

LYRa11 90.9 % · 中菊頭蝠 · 中國雲南保山（2011年採集、2014年發表）^[7]

Rp3 92.6 % · 皮氏菊頭蝠 · 中國廣西南寧（2004年採集、2005年發表）^[5]

	SL-CoV YNLF_31C 93.5 % · 馬鐵菊頭蝠 · 中國雲南祿豐（2013年採集、2015年發表）^[8]

	SL-CoV YNLF_34C 93.5 % · 馬鐵菊頭蝠 · 中國雲南祿豐（2013年採集、2015年發表）^[8]

	SHC014 95.4 % · 中華菊頭蝠 · 中國雲南昆明（2011年採集、2013年發表）^[9]

	WIV1 95.6 % · 中華菊頭蝠 · 中國雲南昆明（2012年採集、2013年發表）^[9]

WIV16 96.0 % · 中華菊頭蝠 · 中國雲南昆明（2013年採集、2016年發表）^[10]

	果子貍SARS冠狀病毒 99.8 % · 果子狸 · 中國廣東^[6]

	SARS-CoV 100 %

SARS-CoV-2 79 %

蝙蝠病毒

果子狸病毒

人類病毒

參考文獻

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