DNA密码子表
外观
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传统上,遗传密码以RNA密码子表的形式表示;这是因为在细胞核糖体制造蛋白质时,指导合成蛋白质的是信使RNA。信使RNA的序列则由基因组DNA确定。随着计算生物学和基因组学的兴起,现今可在DNA水平上发现大多数基因,因此DNA密码子表变得愈加有用。[1]下表中的DNA密码子存在于有义DNA链上,并以5'端→3'端的方向排列。[2]
氨基酸生化性质 | 非极性 | 极性 | 碱性 | 酸性 | 终止密码子 |
碱基1 | 碱基2 | 碱基3 | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
T | C | A | G | ||||||
T | TTT | (Phe/F) |
TCT | (Ser/S) |
TAT | (Tyr/Y) |
TGT | (Cys/C) |
T |
TTC | TCC | TAC | TGC | C | |||||
TTA | (Leu/L) |
TCA | TAA[B] | 终止(赭石) | TGA[B] | 终止(蛋白石) | A | ||
TTG | TCG | TAG[B] | 终止(琥珀) | TGG | (Trp/W)色氨酸 | G | |||
C | CTT | CCT | (Pro/P) |
CAT | (His/H) |
CGT | (Arg/R) |
T | |
CTC | CCC | CAC | CGC | C | |||||
CTA | CCA | CAA | (Gln/Q) |
CGA | A | ||||
CTG | CCG | CAG | CGG | G | |||||
A | ATT | (Ile/I) |
ACT | (Thr/T) |
AAT | (Asn/N) |
AGT | (Ser/S) |
T |
ATC | ACC | AAC | AGC | C | |||||
ATA | ACA | AAA | (Lys/K) |
AGA | (Arg/R) |
A | |||
ATG[A] | (Met/M) |
ACG | AAG | AGG | G | ||||
G | GTT | (Val/V) |
GCT | (Ala/A) |
GAT | (Asp/D) |
GGT | (Gly/G) |
T |
GTC | GCC | GAC | GGC | C | |||||
GTA | GCA | GAA | (Glu/E) |
GGA | A | ||||
GTG | GCG | GAG | GGG | G |
- A 密码子ATG同时编码甲硫氨酸并作为起始点:在信使RNA的编码区里,首个ATG的出现标志着蛋白质翻译的开始。[3]
- B ^ ^ ^ 标示终止密码子为琥珀、赭石和蛋白石的历史原因可在悉尼·布伦纳(Sydney Brenner)的自传[4]和鲍勃·埃德加(Bob Edgar)的一篇历史性文章中找到。[5]
氨基酸 | 密码子 | 缩写 | 氨基酸 | 密码子 | 缩写 |
---|---|---|---|---|---|
Ala/A | GCT、GCC、GCA、GCG | GCN | Leu/L | TTA、TTG、CTT、CTC、CTA、CTG | YTR、CTN |
Arg/R | CGT、CGC、CGA、CGG、AGA、AGG | CGN、MGR | Lys/K | AAA、AAG | AAR |
Asn/N | AAT、AAC | AAY | Met/M | ATG | |
Asp/D | GAT、GAC | GAY | Phe/F | TTT、TTC | TTY |
Cys/C | TGT、TGC | TGY | Pro/P | CCT、CCC、CCA、CCG | CCN |
Gln/Q | CAA、CAG | CAR | Ser/S | TCT、TCC、TCA、TCG、AGT、AGC | TCN、AGY |
Glu/E | GAA、GAG | GAR | Thr/T | ACT、ACC、ACA、ACG | ACN |
Gly/G | GGT、GGC、GGA、GGG | GGN | Trp/W | TGG | |
His/H | CAT、CAC | CAY | Tyr/Y | TAT、TAC | TAY |
Ile/I | ATT、ATC、ATA | ATH | Val/V | GTT、GTC、GTA、GTG | GTN |
起始 | ATG | 终止 | TAA、TGA、TAG | TAR、TRA |
参见
[编辑]参考文献
[编辑]- ^ Kimball, John. The Genetic Code. Kimball's Biology Pages. 2014-05-01 [2017-02-12]. (原始内容存档于2016-12-22).
- ^ Shu, Jian-Jun. A new integrated symmetrical table for genetic codes. BioSystems. January 2017, 151: 21–26. Bibcode:2017arXiv170303787S. PMID 27887904. arXiv:1703.03787
. doi:10.1016/j.biosystems.2016.11.004.
- ^ Nakamoto T. Evolution and the universality of the mechanism of initiation of protein synthesis. Gene. March 2009, 432 (1–2): 1–6. PMID 19056476. doi:10.1016/j.gene.2008.11.001.
- ^ Brenner S. A Life in Science (2001) Published by Biomed Central Limited ISBN 0-9540278-0-9 see pages 101-104
- ^ The genome of bacteriophage T4: an archeological dig. Genetics. 2004, 168 (2): 575–82. PMC 1448817
. PMID 15514035.