DNA密碼子表
外觀
傳統上,遺傳密碼以RNA密碼子表的形式表示;這是因為在細胞核糖體製造蛋白質時,指導合成蛋白質的是信使RNA。信使RNA的序列則由基因組DNA確定。隨着計算生物學和基因組學的興起,現今可在DNA水平上發現大多數基因,因此DNA密碼子表變得愈加有用。[1]下表中的DNA密碼子存在於有義DNA鏈上,並以5'端→3'端的方向排列。[2]
氨基酸生化性質 | 非極性 | 極性 | 鹼性 | 酸性 | 終止密碼子 |
鹼基1 | 鹼基2 | 鹼基3 | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
T | C | A | G | ||||||
T | TTT | (Phe/F) |
TCT | (Ser/S) |
TAT | (Tyr/Y) |
TGT | (Cys/C) |
T |
TTC | TCC | TAC | TGC | C | |||||
TTA | (Leu/L) |
TCA | TAA[B] | 終止(赭石) | TGA[B] | 終止(蛋白石) | A | ||
TTG | TCG | TAG[B] | 終止(琥珀) | TGG | (Trp/W)色氨酸 | G | |||
C | CTT | CCT | (Pro/P) |
CAT | (His/H) |
CGT | (Arg/R) |
T | |
CTC | CCC | CAC | CGC | C | |||||
CTA | CCA | CAA | (Gln/Q) |
CGA | A | ||||
CTG | CCG | CAG | CGG | G | |||||
A | ATT | (Ile/I) |
ACT | (Thr/T) |
AAT | (Asn/N) |
AGT | (Ser/S) |
T |
ATC | ACC | AAC | AGC | C | |||||
ATA | ACA | AAA | (Lys/K) |
AGA | (Arg/R) |
A | |||
ATG[A] | (Met/M) |
ACG | AAG | AGG | G | ||||
G | GTT | (Val/V) |
GCT | (Ala/A) |
GAT | (Asp/D) |
GGT | (Gly/G) |
T |
GTC | GCC | GAC | GGC | C | |||||
GTA | GCA | GAA | (Glu/E) |
GGA | A | ||||
GTG | GCG | GAG | GGG | G |
- A 密碼子ATG同時編碼甲硫氨酸並作為起始點:在信使RNA的編碼區里,首個ATG的出現標誌着蛋白質轉譯的開始。[3]
- B ^ ^ ^ 標示終止密碼子為琥珀、赭石和蛋白石的歷史原因可在悉尼·布倫納(Sydney Brenner)的自傳[4]和鮑勃·埃德加(Bob Edgar)的一篇歷史性文章中找到。[5]
氨基酸 | 密碼子 | 縮寫 | 氨基酸 | 密碼子 | 縮寫 |
---|---|---|---|---|---|
Ala/A | GCT、GCC、GCA、GCG | GCN | Leu/L | TTA、TTG、CTT、CTC、CTA、CTG | YTR、CTN |
Arg/R | CGT、CGC、CGA、CGG、AGA、AGG | CGN、MGR | Lys/K | AAA、AAG | AAR |
Asn/N | AAT、AAC | AAY | Met/M | ATG | |
Asp/D | GAT、GAC | GAY | Phe/F | TTT、TTC | TTY |
Cys/C | TGT、TGC | TGY | Pro/P | CCT、CCC、CCA、CCG | CCN |
Gln/Q | CAA、CAG | CAR | Ser/S | TCT、TCC、TCA、TCG、AGT、AGC | TCN、AGY |
Glu/E | GAA、GAG | GAR | Thr/T | ACT、ACC、ACA、ACG | ACN |
Gly/G | GGT、GGC、GGA、GGG | GGN | Trp/W | TGG | |
His/H | CAT、CAC | CAY | Tyr/Y | TAT、TAC | TAY |
Ile/I | ATT、ATC、ATA | ATH | Val/V | GTT、GTC、GTA、GTG | GTN |
起始 | ATG | 終止 | TAA、TGA、TAG | TAR、TRA |
參見
[編輯]參考文獻
[編輯]- ^ Kimball, John. The Genetic Code. Kimball's Biology Pages. 2014-05-01 [2017-02-12]. (原始內容存檔於2016-12-22).
- ^ Shu, Jian-Jun. A new integrated symmetrical table for genetic codes. BioSystems. January 2017, 151: 21–26. Bibcode:2017arXiv170303787S. PMID 27887904. arXiv:1703.03787 . doi:10.1016/j.biosystems.2016.11.004.
- ^ Nakamoto T. Evolution and the universality of the mechanism of initiation of protein synthesis. Gene. March 2009, 432 (1–2): 1–6. PMID 19056476. doi:10.1016/j.gene.2008.11.001.
- ^ Brenner S. A Life in Science (2001) Published by Biomed Central Limited ISBN 0-9540278-0-9 see pages 101-104
- ^ The genome of bacteriophage T4: an archeological dig. Genetics. 2004, 168 (2): 575–82. PMC 1448817 . PMID 15514035.