RAN翻译

本页使用了标题或全文手工转换
维基百科,自由的百科全书
亨丁顿舞蹈症病患的Htt英语Huntingtin基因的CAG重复数目较一般人多,可进行RAN翻译产生致病蛋白

RAN翻译全称为重复区关联的非AUG翻译(英语:Repeat Associated Non-AUG translation),是真核生物细胞中一种异常的mRNA翻译机制,发生在具简单重复序列(微卫星)的mRNA上,不需起始密码子AUG即可翻译重复序列,产生由一或两种(少数案例为数种)氨基酸组成的重复蛋白。此翻译机制最早于2011年在第八型小脑萎缩症(SCA8)与第一型强直性肌肉失养症(DM1)患者中发现[1][2],上述两种疾病与亨丁顿舞蹈症肌萎缩性脊髓侧索硬化症等数种神经退化性疾病患者的某些基因中皆有三核苷酸重复序列扩增,在神经组织中由RAN翻译生成重复蛋白,可能与其致病原因有关。目前对RAN翻译的详细过程与调控机制尚不清楚。

机制[编辑]

绝大多数的真核翻译是始于起始密码子AUG,其中多数依赖5′端帽(少数病毒mRNA则是使用内部核糖体进入位点),翻译起始时eIF4F复合体与mRNA的5′端帽结合,核糖体小次单元英语Eukaryotic small ribosomal subunit (40S)、起始tRNAeIF1等蛋白组成43S前起始复合物,并从mRNA的5′往3′扫描,直到发现AUG后开始翻译[3]。RAN翻译则发生在一些具有简单重复序列(微卫星)的mRNA,不使用AUG作为起始密码子,可能自重复序列上游近似AUG的密码子(如CUG)起始,也可能自重复序列开始翻译[4],通常没有固定的开放阅读框,可产生多种可能对细胞具毒性的单氨基酸重复蛋白或二肽重复蛋白(DPR)[5]。简单重复序列可能位于mRNA的5′非翻译区编码区内含子[6],有些案例中与基因互补的另一股DNA也会被转录成mRNA反义RNA),且两者的重复序列均能以所有开放阅读框进行RAN翻译,因此最多能产生6种重复蛋白[7]。除人类细胞外,已知酵母菌也可进行RAN翻译[8]

许多神经退化性疾病与基因中微卫星序列重复数异常有关,通称三核苷酸重复序列疾病英语trinucleotide repeat disorder,过去多认为此突变表现的RNA或蛋白为致病主因,近年则有观点认为RAN翻译可能为这些疾病的致病机制之一[4],但也有研究结果不支持此结论[9]。RAN翻译的详细机制有待更多研究阐明,尚不清楚此过程较近似一般的5′端帽依赖型翻译或内部核糖体进入位点依赖型翻译,有证据显示此过程需5′端帽,翻译起始时可能核糖体也有从mRNA5′往3′扫描的过程,也有证据显示其起始和重复序列形成的二级结构有关[6]。RAN翻译也受到一些细胞反应调控,例如整合应激反应英语integrated stress response时会抑制一般翻译,但可能促进RAN翻译的进行[4];另外有研究发现核糖体蛋白RPS25英语RPS25对RAN翻译相当重要[8]。目前对RAN翻译的了解大多局限于其在神经退化性疾病中扮演的角色,对正常状态下(序列重复数正常的个体中)的RAN翻译了解甚少,有研究结果显示FMR1英语FMR1基因中的RAN翻译可抑制正常FMR1蛋白(FMRP)的表现,因而有类似上游开放阅读框(uORF)的功能[10]

案例[编辑]

RAN翻译已在数种神经退化性疾病患者中发现,包括第八型小脑萎缩症(SCA8)患者ATXN8英语Twinkle (protein)基因的CAG重复与ATXN8OS英语ATXN8OS的CTG重复、第31型小脑萎缩症(SCA31)患者BEAN基因的TGGAA重复与SCA31-AS的TTCCA重复、额颞叶失智症(FTD)与肌萎缩性脊髓侧索硬化症(ALS)患者C9ORF72英语C9ORF72基因的GGGGCC重复与C9orf72-AS的GGCCCC重复、第一型强直性肌肉失养症(DM1)患者DMPK基因基因的CTG重复与DM1-AS的CAG重复、第二型强直性肌肉失养症(DM2)患者CNBP英语CNBP基因中的CCTG重复与DM2-AS的CAGG重复、亨丁顿舞蹈症患者Htt1英语Huntingtin基因的CAG重复与HTT-AS1英语HTT-AS1的CTG重复、福斯氏角膜内皮失养症英语Fuchs endothelial corneal dystrophy(FECD)患者TCF4英语TCF4基因的CTG重复与TCF4-AS的CAG重复等[4]

C9ORF72[编辑]

人类神经组织中表现的C9ORF72英语C9ORF72基因一般有20至30个GGGGCC的短重复序列[11][12] ,少数人在此位点发生突变而具有上百个短重复序列[13] ,可能导致额颞叶失智症(FTD)或肌萎缩性脊髓侧索硬化症(ALS),其致病机制可能为影响和一些蛋白英语RNA-binding protein的结合能力,降低正常C9ORF72蛋白的表现量,或者是RAN翻译所致,此位点的三个开放阅读框分别可翻译出数种二肽重复蛋白,包括多甘氨酸-丙氨酸(poly GA)、多甘氨酸-脯氨酸(poly GP)、多甘氨酸-精氨酸(poly GR)等,可能在神经元中具有毒性而致病[14][15],有约40%的FTD和约10%的ALS患者具有此突变[16],且与此基因互补的另一股DNA也会转录成mRNA并进行RAN翻译,因此共能产生六种重复蛋白[4]。C9ORF72进行RAN翻译可能使用上游的CUG密码子作为起始,此起始不只可翻译出GA重复蛋白,还可能藉G-四联体介导的翻译连读英语ribosome frameshifting翻译出GP与GR重复蛋白。另外此基因内含子中有一个上游开放阅读框(uORF)可抑制RAN翻译[17]

X染色体脆折症运动失调综合症[编辑]

X染色体脆折症运动失调综合症英语Fragile X-associated tremor/ataxia syndromeFMR1英语FMR1基因的CGG重复序列有关,多数人在此区域的重复少于50个,而此症病患大多有超过200个重复[18],此位点可翻译出由甘氨酸组成的重复多肽,且其翻译始于重复序列上游的一个特殊起始密码子ACG[19][20]

亨丁顿舞蹈症[编辑]

亨丁顿舞蹈症是Htt1基因中的CAG重复序列扩增造成,可以所有开放阅读框进行RAN翻译产生多谷氨酰胺、多丙氨酸和多丝氨酸三种重复蛋白,且与其互补的DNA也会转录成mRNA(具CUG重复序列),亦可以所有开放阅读框进行RAN翻译产生多亮氨酸、多半胱氨酸和多丙氨酸等三种重复蛋白,具突变的老鼠模型显示这些重复蛋白在前额叶小脑的脑区累积,可能造成神经发炎等损伤[21]

参考文献[编辑]

  1. ^ Zu, T.; Gibbens, B.; Doty, N. S.; Gomes-Pereira, M.; Huguet, A.; Stone, M. D.; Margolis, J.; Peterson, M.; Markowski, T. W.; Ingram, M. A. C.; Nan, Z.; Forster, C.; Low, W. C.; Schoser, B.; Somia, N. V.; Clark, H. B.; Schmechel, S.; Bitterman, P. B.; Gourdon, G.; Swanson, M. S.; Moseley, M.; Ranum, L. P. W. Non-ATG-initiated translation directed by microsatellite expansions. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2010, 108 (1): 260–265. ISSN 0027-8424. PMC 3017129可免费查阅. PMID 21173221. doi:10.1073/pnas.1013343108. 
  2. ^ Copenhaver, Gregory P.; Pearson, Christopher E. Repeat Associated Non-ATG Translation Initiation: One DNA, Two Transcripts, Seven Reading Frames, Potentially Nine Toxic Entities!. PLOS Genetics. 2011, 7 (3): e1002018. ISSN 1553-7404. PMC 3053344可免费查阅. PMID 21423665. doi:10.1371/journal.pgen.1002018. 
  3. ^ Hershey, J.W.B. and W.C. Merrick. The pathway and mechanism of initiation of protein synthesis. N. Sonenberg, J. W. B. Hershey, M. B. Mathews (编). Translational Control of Gene Expression. Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2000: 185-243. 
  4. ^ 4.0 4.1 4.2 4.3 4.4 Nguyen L, Cleary JD, Ranum LPW. Repeat-Associated Non-ATG Translation: Molecular Mechanisms and Contribution to Neurological Disease.. Annu Rev Neurosci. 2019, 42: 227–247. PMC 6687071可免费查阅. PMID 30909783. doi:10.1146/annurev-neuro-070918-050405. 
  5. ^ Green KM, Glineburg MR, Kearse MG, Flores BN, Linsalata AE, Fedak SJ; et al. RAN translation at C9orf72-associated repeat expansions is selectively enhanced by the integrated stress response.. Nat Commun. 2017, 8 (1): 2005. PMC 5722904可免费查阅. PMID 29222490. doi:10.1038/s41467-017-02200-0. 
  6. ^ 6.0 6.1 Green KM, Linsalata AE, Todd PK. RAN translation-What makes it run?. Brain Res. 2016, 1647: 30–42. PMC 5003667可免费查阅. PMID 27060770. doi:10.1016/j.brainres.2016.04.003. 
  7. ^ Zu T, Liu Y, Bañez-Coronel M, Reid T, Pletnikova O, Lewis J; et al. RAN proteins and RNA foci from antisense transcripts in C9ORF72 ALS and frontotemporal dementia.. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013, 110 (51): E4968–77. PMC 3870665可免费查阅. PMID 24248382. doi:10.1073/pnas.1315438110. 
  8. ^ 8.0 8.1 Yamada SB, Gendron TF, Niccoli T, Genuth NR, Grosely R, Shi Y; et al. RPS25 is required for efficient RAN translation of C9orf72 and other neurodegenerative disease-associated nucleotide repeats.. Nat Neurosci. 2019, 22 (9): 1383–1388. PMC 6713615可免费查阅. PMID 31358992. doi:10.1038/s41593-019-0455-7. 
  9. ^ Yang S, Yang H, Huang L, Chen L, Qin Z, Li S; et al. Lack of RAN-mediated toxicity in Huntington's disease knock-in mice.. Proc Natl Acad Sci U S A. 2020, 117 (8): 4411–4417. PMC 7049130可免费查阅. PMID 32029588. doi:10.1073/pnas.1919197117. 
  10. ^ Rodriguez CM, Wright SE, Kearse MG, Haenfler JM, Flores BN, Liu Y; et al. A native function for RAN translation and CGG repeats in regulating fragile X protein synthesis.. Nat Neurosci. 2020, 23 (3): 386–397. PMC 7668390可免费查阅. PMID 32066985. doi:10.1038/s41593-020-0590-1. 
  11. ^ Bigio EH. C9ORF72, the new gene on the block, causes C9FTD/ALS: new insights provided by neuropathology. Acta Neuropathologica. December 2011, 122 (6): 653–5. PMC 3262229可免费查阅. PMID 22101324. doi:10.1007/s00401-011-0919-7. 
  12. ^ Fong JC, Karydas AM, Goldman JS. Genetic counseling for FTD/ALS caused by the C9ORF72 hexanucleotide expansion. Alzheimer's Research & Therapy. 2012, 4 (4): 27. PMC 3506941可免费查阅. PMID 22808918. doi:10.1186/alzrt130. 
  13. ^ Khan BK, Yokoyama JS, Takada LT, Sha SJ, Rutherford NJ, Fong JC, et al. Atypical, slowly progressive behavioural variant frontotemporal dementia associated with C9ORF72 hexanucleotide expansion. Journal of Neurology, Neurosurgery, and Psychiatry. April 2012, 83 (4): 358–64. PMC 3388906可免费查阅. PMID 22399793. doi:10.1136/jnnp-2011-301883. 
  14. ^ Mori K, Weng SM, Arzberger T, May S, Rentzsch K, Kremmer E, et al. The C9orf72 GGGGCC repeat is translated into aggregating dipeptide-repeat proteins in FTLD/ALS. Science. March 2013, 339 (6125): 1335–8. Bibcode:2013Sci...339.1335M. PMID 23393093. doi:10.1126/science.1232927. 
  15. ^ Ash PE, Bieniek KF, Gendron TF, Caulfield T, Lin WL, Dejesus-Hernandez M, et al. Unconventional translation of C9ORF72 GGGGCC expansion generates insoluble polypeptides specific to c9FTD/ALS. Neuron. February 2013, 77 (4): 639–46. PMC 3593233可免费查阅. PMID 23415312. doi:10.1016/j.neuron.2013.02.004. 
  16. ^ Babić Leko M, Župunski V, Kirincich J, Smilović D, Hortobágyi T, Hof PR, Šimić G. C9orf72 Hexanucleotide Repeat Expansion. Behavioural Neurology. 2019, 2019: 2909168. PMC 6350563可免费查阅. PMID 30774737. doi:10.1155/2019/2909168. 
  17. ^ Tabet R, Schaeffer L, Freyermuth F, Jambeau M, Workman M, Lee CZ; et al. CUG initiation and frameshifting enable production of dipeptide repeat proteins from ALS/FTD C9ORF72 transcripts.. Nat Commun. 2018, 9 (1): 152. PMC 5764992可免费查阅. PMID 29323119. doi:10.1038/s41467-017-02643-5. 
  18. ^ Technical Standards and Guidelines for Fragile X. American College of Medical Genetics英语American College of Medical Genetics. 2000-10-02 [2013-03-29]. (原始内容存档于2018-06-17). 
  19. ^ Sellier C, Buijsen RAM, He F, Natla S, Jung L, Tropel P; et al. Translation of Expanded CGG Repeats into FMRpolyG Is Pathogenic and May Contribute to Fragile X Tremor Ataxia Syndrome.. Neuron. 2017, 93 (2): 331–347. PMC 5263258可免费查阅. PMID 28065649. doi:10.1016/j.neuron.2016.12.016. 
  20. ^ Gao FB, Richter JD. Microsatellite Expansion Diseases: Repeat Toxicity Found in Translation.. Neuron. 2017, 93 (2): 249–251. PMID 28103472. doi:10.1016/j.neuron.2017.01.001. 
  21. ^ Tarentino AL, Maley F. A comparison of the substrate specificities of endo-beta-N-acetylglucosaminidases from Streptomyces griseus and Diplococcus Pneumoniae.. Biochem Biophys Res Commun. 1975, 67 (1): 455–62. doi:10.1016/0006-291x(75)90337-x.