菌根指的是高等植物与真菌类生物的共生现象,发生于植物的根部。可分为两类:内生菌根和外生菌根。
微生物通过根毛到表皮皮层间隙,在皮层中繁殖,皮层细胞受刺激而分裂。真菌菌丝起到根毛的作用,吸收土壤中水分,矿物质和有机物质,并将之分解成更有利于宿主吸收的形式。真菌还能合成维生素供给宿主。而宿主则会提供氨基酸等物质供应真菌。
真菌在植物根部外形成以鞘层,成为菌丝罩,菌丝外露。只有少部分的真菌进入到根的皮层。