群特異性抗原
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群特異性抗原(Gag) | |
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標識 | |
生物 | |
符號 | gag |
UniProt | P04591 |
其他數據 |
群特異性抗原(英語:Group-specific antigen,縮寫:Gag)是包含逆轉錄病毒目(花椰菜病毒科除外)核心結構蛋白的多聚蛋白質。之所以這樣命名,是因為科學家曾經認為它具有抗原性。現在知道是它構成了內殼,而不是暴露在外面的外殼。它構成了病毒構象的所有結構單元,並為成熟的病毒粒子提供支持框架。
所有正逆轉錄病毒Gag蛋白都被蛋白酶加工成MA(基質)、CA(衣殼)、NC(核衣殼)部分,有時甚至更多。[1]如果Gag無法切割成其亞基,則病毒體無法成熟並保持無感染性。
它包含部分Gag-onc融合蛋白。
在HIV里的Gag
[編輯]![](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/fa/7ash.jpg/300px-7ash.jpg)
![](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c6/HIV-genome.png/300px-HIV-genome.png)
編號系統
[編輯]HIV基因組是根據HIV-1 M組B亞型參考毒株HXB2進行編號的。[2]
轉錄和mRNA加工
[編輯]病毒進入靶細胞後,病毒基因組被整合到宿主細胞的染色質中。接著,RNA聚合酶II轉錄9181核苷酸全長病毒RNA。HIV Gag蛋白由HIV Gag基因編碼,HXB2核苷酸790-2292。[2]
MA(基質,Matrix protein)
[編輯]HIV p17基質蛋白(MA)是一種17kDa的蛋白質,由132個胺基酸組成,包含Gag多聚蛋白質的N末端。它負責通過其高鹼性區域(HBR)與磷脂醯肌醇二磷酸(PI(4,5)P2)產生相互作用,將Gag多聚蛋白質靶向細胞膜。[3]HIV MA還與組裝病毒中的HIV跨膜糖蛋白Gp41接觸。的確,它可能在將包膜糖蛋白募集到病毒出芽位點方面發揮關鍵作用。[來源請求]
一旦Gag在核糖體上被翻譯,Gag多聚蛋白質就會被N-肉豆蔻醯轉移酶1在其N末端甘氨酸殘基上進行豆蔻醯化。這是細胞膜靶向的關鍵修改。在膜未結合形式中,MA肉豆蔻醯脂肪酸尾被隔離在MA蛋白核心的疏水口袋中。[3]
MA HBR對細胞膜PI(4,5)P2的識別激活了「肉豆蔻醯開關」,其中肉豆蔻醯基從MA疏水口袋中擠出並嵌入細胞膜中。[3]與肉豆蔻醯開關激活平行(或可能伴隨),PI(4,5)P2的花生四烯酸部分從細胞膜中提取並結合在MA表面的通道中(這與之前被MA肉豆蔻醯基團占據的通道不同)。[3]
然後,HIV Gag通過三種相互作用緊密結合到膜表面:
CA(衣殼,Capsid)
[編輯]P24衣殼蛋白(CA)是一種24kDa的蛋白質,融合到未加工的HIV Gag多聚蛋白質中MA的C末端。病毒成熟後,CA會形成病毒衣殼。CA有兩個公認的結構域,即C端結構域(C-terminal domain)和N端結構域(N-terminal domain)。CA C端結構域和N端結構域在HIV出芽和衣殼結構中具有不同的作用。[來源請求]
當使用西方墨點法檢測HIV感染時,p24是測試的三種主要蛋白質之一,另外還有Gp120和Gp41。
雖然MA、IN、VPR和cPPT之前曾被認為是影響HIV靶向非分裂細胞能力的因素,但CA已被證明是非分裂細胞中逆轉錄病毒感染性的主要決定因素,這對於幫助避免基因治療中的慢病毒載體的插入式突變。[4]
SP1(間隔肽1,Spacer peptide 1)
[編輯]間隔肽1(SP1)是一種介於CA和NC之間的14胺基酸多肽。CA-SP1連接處的切割是病毒成熟的最後一步,它允許CA凝結成病毒衣殼。SP1在溶液中是非結構化的,但在極性較低的溶劑或高多肽濃度下,它變成α螺旋結構。[5]在科學研究中,CA(24kDa)的蛋白質印跡可以通過25kDa條帶(未切割的CA-SP1)的高相對存在來指示成熟缺陷。SP1在HIV粒子組裝中起著關鍵作用,[5]儘管其作用的確切性質和SP1結構動力學的生理相關性尚不清楚。
NC(核衣殼,Necleocapsid)
[編輯]HIV核衣殼蛋白(NC)是Gag多聚蛋白質中的7kDa鋅指蛋白,在病毒成熟後形成病毒核衣殼。NC將全長病毒基因組RNA募集到新生病毒顆粒中。[來源請求]
SP2(間隔肽2,Spacer peptide 2)
[編輯]間隔肽2(SP2)是一種功能未知的16胺基酸多肽,可分隔Gag蛋白NC和p6。
P6
[編輯]HIV P6是位於Gag多聚蛋白質C端的6kDa多肽。[6]它募集細胞蛋白腫瘤易感基因101(運輸所需的內體分選複合物-1的一個組成部分)和ALIX蛋白以啟動病毒顆粒從細胞膜出芽。P6在成熟病毒中沒有已知功能。[來源請求]
在內源性逆轉錄病毒中
[編輯]人內源性逆轉錄病毒K和人內源性逆轉錄病毒W拷貝里都攜帶廣泛表達的Gag基因,這些基因通常都是受損的。推測它們與多發性硬化症和其他神經系統疾病有關的歷史由來已久。[7]
在其他病毒中
[編輯]泡沫病毒Gag蛋白 | |||||||||
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鑑定 | |||||||||
標誌 | Gag_spuma | ||||||||
Pfam | PF03276(舊版) | ||||||||
InterPro | IPR004957 | ||||||||
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泡沫逆轉錄病毒亞科(例如UniProt P14349)和轉座病毒科(例如UniProt Q86TG7)的Gag基因只有一個可識別的核殼部分。 它還缺少豆蔻醯化序列。[8]
泡沫逆轉錄病毒Gag與正逆轉錄病毒Gag相關,經結構研究表明,N端結構域的一部分與典型的衣殼蛋白具有功能和結構同源性。[9]泡沫逆轉錄病毒Gag不像正逆轉錄病毒Gag那樣處理, 只需要在C端進行微小的3kDa切割,其他切割位點通常效率低下。[10]
轉座病毒Gag也是已知具有結構上同源的衣殼蛋白。每個衣殼由540種蛋白質組裝而成。與正逆轉錄病毒CA蛋白不同,它不需要顯著成熟。[11]動物活性調節的細胞骨架相關蛋白(ARC)基因是從轉座病毒屬Gag中重新利用的。[12]該基因負責在神經細胞之間轉運mRNA,這是神經可塑性的關鍵部分。它獨立出現在四足動物和果蠅中。[13]
花椰菜病毒科成員很少對其包含衣殼的ORF進行Gag分配,但CP-PRO-POL布局確實顯示了與規範的Gag-Pol設置的類比。這些部分是否粘在一起形成多聚蛋白質取決於花椰菜病毒科的屬。[來源請求]
參見
[編輯]參考文獻
[編輯]- ^ Coffin JM, Hughes SH, Varmus HE. Genetic Organization. Retroviruses. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 1997 [2022-12-12]. (原始內容存檔於2021-03-08) (英語).
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.
外部連結
[編輯]- Diagram at stanford.edu (頁面存檔備份,存於網際網路檔案館)
- 醫學主題詞表(MeSH):gag+Protein
- 醫學主題詞表(MeSH):gag+Genes
- 醫學主題詞表(MeSH):gag+Gene+Products,+Human+Immunodeficiency+Virus
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