代謝網路

代謝網路（英語：metabolic network）是完整的一決定細胞生理學和生物化學屬性的整套代謝與物質過程。這些網絡包含了代謝的化學反應以及指導這些反應的調整性相互作用。

隨著基因組定序完成，重建從細菌到人類的有機體中的生化反應網絡現已成為可能。一些代謝網路已經上線：京都基因與基因組百科全書（KEGG）^[1]，EcoCyc ^[2]，BioCyc ^[3]與metaTIGER ^[4]。對於學習及代謝建模來說，代謝網路是十分強大的工具。

用途

代謝網路可用於檢測患病患者的合併症模式（comorbidity patterns）^[5]。某些疾病，如肥胖和糖尿病，可同時存在於同一個體中，有時一種疾病是另一種疾病的重要危險因素^[6] 。疾病表型本身通常是細胞不能分解或產生必需受質的結果。然而，一個反應中的酶缺陷可能影響其他後續反應的通量。這些級聯效應將與隨後反應相關的代謝疾病聯繫起來，從而導致合併症效應。因此，代謝疾病網絡可用於確定兩種疾病是否由於其相關反應而相關聯^[5]。

參見

代謝網路建模（英語：Metabolic network modelling）
代謝途徑

參考資料

^ GenomeNet. www.genome.ad.jp. [2019-10-22]. （原始內容存檔於2009-02-24）.
^ EcoCyc: Encyclopedia of E. coli Genes and Metabolic Pathways. www.ecocyc.org. [2020-12-16]. （原始內容存檔於2006-05-09）.
^ BioCyc Pathway/Genome Database Collection. biocyc.org. [2020-12-16]. （原始內容存檔於2020-11-27）.
^ metaTIGER - Home. www.bioinformatics.leeds.ac.uk. [2011-02-12]. （原始內容存檔於2012-03-04）.
^ ^5.0 ^5.1 Lee, D.- S.; Park, J.; Kay, K. A.; Christakis, N. A.; Oltvai, Z. N.; Barabasi, A.- L. The implications of human metabolic network topology for disease comorbidity. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2008, 105 (29): 9880–9885. PMC 2481357 . PMID 18599447. doi:10.1073/pnas.0802208105.
^ Ross, R.; Dagnone, D.; Jones, P. J.; Smith, H.; Paddags, A.; Hudson, R.; Janssen, I. Reduction in obesity and related comorbid conditions after diet-induced weight loss or exercise-induced weight loss in men. A randomized, controlled trial. Annals of Internal Medicine. 2000, 133 (2): 92–103. PMID 10896648.

[1] GenomeNet. www.genome.ad.jp. [2019-10-22]. （原始內容存檔於2009-02-24）.

[2] EcoCyc: Encyclopedia of E. coli Genes and Metabolic Pathways. www.ecocyc.org. [2020-12-16]. （原始內容存檔於2006-05-09）.

[3] BioCyc Pathway/Genome Database Collection. biocyc.org. [2020-12-16]. （原始內容存檔於2020-11-27）.

[4] taTIGER - Home. www.bioinformatics.leeds.ac.uk. [2011-02-12]. （原始內容存檔於2012-03-04）.

[pmid18599447-5] 5.0 ^5.1 Lee, D.- S.; Park, J.; Kay, K. A.; Christakis, N. A.; Oltvai, Z. N.; Barabasi, A.- L. The implications of human metabolic network topology for disease comorbidity. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2008, 105 (29): 9880–9885. PMC 2481357 . PMID 18599447. doi:10.1073/pnas.0802208105.

[6] Ross, R.; Dagnone, D.; Jones, P. J.; Smith, H.; Paddags, A.; Hudson, R.; Janssen, I. Reduction in obesity and related comorbid conditions after diet-induced weight loss or exercise-induced weight loss in men. A randomized, controlled trial. Annals of Internal Medicine. 2000, 133 (2): 92–103. PMID 10896648.

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