莽草酸途徑

莽草酸途徑（英語：shikimic acid pathway，又叫做分支酸途徑，Chorismate pathway）是一個存在於細菌、真菌、藻類以及寄生生物和植物中的代謝途徑，用於芳香族氨基酸（苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸）的生物合成。

這個代謝途徑在動物中不存在，因此對於動物而言這些氨基酸是必需氨基酸，無法自己製造（但這三者的有些氨基酸可以另闢途徑合成，如酪氨酸是在人體由苯丙氨酸合成的方法所得，雖然酪氨酸不是必需氨基酸之一，他的合成來源苯丙氨酸則是必需氨基酸之一，因此依然要先有必需氨基酸的攝取才能合成出來），要通過食物中的細菌或者植物（或者吃細菌或者植物的動物）攝取。

參與莽草酸途徑的七種酶是DAHP合酶（英語：DAHP synthase），3-脫氫奎尼酸合酶（英語：3-dehydroquinate synthase），3-脫氫奎尼酸脫水酶（英語：3-dehydroquinate dehydratase），莽草酸脫氫酶，莽草酸激酶（英語：shikimate kinase），EPSP合酶（英語：EPSP synthase），和分支酸合酶（英語：chorismate synthase）。

莽草酸的合成

莽草酸合成的兩種初始底物是糖酵解與糖異生途徑中的磷酸烯醇式丙酮酸和卡爾文循環與磷酸戊糖途徑中的赤蘚糖-4-磷酸，它們由DAHP合酶（英語：DAHP synthase）催化合成為3-脫氧-D-阿糖基庚糖酮酸-7-磷酸（DAHP），並釋放一個磷酸。DAHP再由3-脫氫奎尼酸合酶（英語：3-dehydroquinate synthase）環化為3-脫氫奎尼酸（DHQ）。^[1]

3-脫氫奎尼酸再由3-脫氫奎尼酸脫水酶（英語：3-dehydroquinate dehydratase）脫水形成3-脫氫莽草酸，之後在脫氫莽草酸還原酶作用下，3-脫氫莽草酸消耗一個NADPH還原為莽草酸。

從莽草酸到芳香族氨基酸

莽草酸合成後的第一個酶是莽草酸激酶（英語：shikimate kinase），消耗ATP催化莽草酸磷酸化為莽草酸-3-磷酸（英語：shikimate 3-phosphate）^[2]。莽草酸-3-磷酸再由EPSP合酶（英語：EPSP synthase）催化與磷酸烯醇式丙酮酸結合形成5-烯醇式丙酮酸莽草酸-3-磷酸（EPSP）。

5-烯醇式丙酮酸莽草酸-3-磷酸再通過分支酸合酶（英語：chorismate synthase）轉化為分支酸。

分支酸在分支酸變位酶（英語：Chorismate mutase）催化下進行克萊森重排形成預苯酸^[3]^[4]

到酪氨酸

預苯酸在預苯酸脫氫酶（英語：Prephenate dehydrogenase）催化下發生氧化脫羧（但保留羥基）形成對羥基苯丙酮酸（p-hydroxyphenylpyruvate，又叫4-羥苯丙酮酸）。再通過酪氨酸轉氨酶（英語：Tyrosine aminotransferase）與穀氨酸發生轉氨基作用生成酪氨酸和α-酮戊二酸。

到苯丙氨酸

預苯酸由預苯酸脫水酶（英語：Prephenate dehydratase）催化脫羧（不保留羥基）形成苯丙酮酸，再與穀氨酸發生轉氨基作用生成苯丙氨酸。^{[來源請求]}

到色氨酸

分支酸支路

從分支酸開始，有多條支路合成以下多種有機化合物，分支酸也因此得名。^[5]

泛醌和質體醌
生育酚（維生素E成分之一）、維生素K、葉酸（維生素B₉）
部分鐵載體（英語：Siderophore）
木質素
苯丙素類化合物
異黃酮、花色素苷、木酚素（英語：Lignane）、二苯基乙烯
肉桂酸衍生物
香豆素、香草醛
苯甲酸衍生物（水楊酸、沒食子酸、對氨基苯甲酸）
一些生物鹼（嗎啡、秋水仙素）

前酪氨酸途徑

在部分植物^[6]與細菌^[7]中，酪氨酸和苯丙氨酸的合成途徑與以上有所不同，稱為「前酪氨酸途徑」（arogenate pathway），它先由預苯酸在轉氨後形成L-前酪氨酸（L-arogenate），再通過前酪氨酸脫氫酶（英語：Arogenate dehydrogenase）形成酪氨酸或通過前酪氨酸脫水酶（英語：Arogenate dehydratase）形成苯丙氨酸（如圖）。

參考文獻

引用

^ D. E. Metzler: Biochemistry. The Chemical Reactions of Living Cells. Volume 2. Elsevier Science, 2003; S. 1420–1471 ; ISBN 0-12-492541-3.
^ Klaus M. Herrmann, Lisa M. Weaver. THE SHIKIMATE PATHWAY. Annual Review of Plant Physiology and Plant Molecular Biology. 1999-6, 50: 473–503 [2019-02-12]. ISSN 1040-2519. PMID 15012217. doi:10.1146/annurev.arplant.50.1.473. （原始內容存檔於2019-09-30）. 請檢查|date=中的日期值 (幫助)
^ Helmut Goerisch. On the mechanism of the chorismate mutase reaction. Biochemistry. 1978, 17 (18): 3700. doi:10.1021/bi00611a004.
^ Peter Kast, Yadu B. Tewari, Olaf Wiest, Donald Hilvert, Kendall N. Houk, and Robert N. Goldberg. Thermodynamics of the Conversion of Chorismate to Prephenate: Experimental Results and Theoretical Predictions. J. Phys. Chem. B. 1997, 101 (50): 10976–10982. doi:10.1021/jp972501l.
^ P. M. Dewick: Medicinal Natural Products: A Biosynthetic Approach. 3. Auflage, John Wiley & Sons Ltd., 2009; S. 137–186; ISBN 978-0-470-74167-2.
^ Cho, Man-Ho; Corea, Oliver R. A.; Yang, Hong; Bedgar, Diana L.; Laskar, Dhrubojyoti D.; Anterola, Aldwin M.; et al. Phenylalanine biosynthesis in Arabidopsis thaliana-- identification and characterization of arogenate dehydratases. J. Biol. Chem. 2007, 282 (42): 30827–35. PMID 17726025. doi:10.1074/jbc.m702662200.
^ Zhao, G; Xia, T; Fischer, RS; Jensen, RA. Cyclohexadienyl dehydratase from Pseudomonas aeruginosa. Molecular cloning of the gene and characterization of the gene product. J. Biol. Chem. 1992, 267 (4): 2487–2493. PMID 1733946.

來源

Brown, Stewart A.; Neish, A. C. Shikimic Acid as a Precursor in Lignin Biosynthesis. Nature. 1955, 175 (4459): 688–689. ISSN 0028-0836. doi:10.1038/175688a0.
Weinstein, L. H.; Porter, C. A.; Laurencot, H. J. Role of the Shikimic Acid Pathway in the Formation of Tryptophan in Higher Plants : Evidence for an Alternative Pathway in the Bean. Nature. 1962, 194 (4824): 205–206. ISSN 0028-0836. doi:10.1038/194205a0.
Wilson, D J; Patton, S; Florova, G; Hale, V; Reynolds, K A. The shikimic acid pathway and polyketide biosynthesis. Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology. 1998, 20 (5): 299–303. ISSN 1367-5435. doi:10.1038/sj.jim.2900527.

[Metzler-1] D. E. Metzler: Biochemistry. The Chemical Reactions of Living Cells. Volume 2. Elsevier Science, 2003; S. 1420–1471 ; ISBN 0-12-492541-3.

[2] Klaus M. Herrmann, Lisa M. Weaver. THE SHIKIMATE PATHWAY. Annual Review of Plant Physiology and Plant Molecular Biology. 1999-6, 50: 473–503 [2019-02-12]. ISSN 1040-2519. PMID 15012217. doi:10.1146/annurev.arplant.50.1.473. （原始內容存檔於2019-09-30）. 請檢查|date=中的日期值 (幫助)

[3] Helmut Goerisch. On the mechanism of the chorismate mutase reaction. Biochemistry. 1978, 17 (18): 3700. doi:10.1021/bi00611a004.

[4] Peter Kast, Yadu B. Tewari, Olaf Wiest, Donald Hilvert, Kendall N. Houk, and Robert N. Goldberg. Thermodynamics of the Conversion of Chorismate to Prephenate: Experimental Results and Theoretical Predictions. J. Phys. Chem. B. 1997, 101 (50): 10976–10982. doi:10.1021/jp972501l.

[5] P. M. Dewick: Medicinal Natural Products: A Biosynthetic Approach. 3. Auflage, John Wiley & Sons Ltd., 2009; S. 137–186; ISBN 978-0-470-74167-2.

[:2-6] Cho, Man-Ho; Corea, Oliver R. A.; Yang, Hong; Bedgar, Diana L.; Laskar, Dhrubojyoti D.; Anterola, Aldwin M.; et al. Phenylalanine biosynthesis in Arabidopsis thaliana-- identification and characterization of arogenate dehydratases. J. Biol. Chem. 2007, 282 (42): 30827–35. PMID 17726025. doi:10.1074/jbc.m702662200.

[7] Zhao, G; Xia, T; Fischer, RS; Jensen, RA. Cyclohexadienyl dehydratase from Pseudomonas aeruginosa. Molecular cloning of the gene and characterization of the gene product. J. Biol. Chem. 1992, 267 (4): 2487–2493. PMID 1733946.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]