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人類冠狀病毒HKU1

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人類冠狀病毒HKU1
被HKU1病毒感染的人類第二型肺泡細胞，可見病毒感染造成了細胞間的融合，產生合胞體。綠色部分為病毒刺突蛋白的染色，藍色則為細胞核
病毒分類 編輯
（未分級）： 病毒 Virus
域： 核糖病毒域 Riboviria
界： 正核糖病毒界 Orthornavirae
門： 小核糖病毒門 Pisuviricota
綱： 小南嵌套病毒綱 Pisoniviricetes
目： 套式病毒目 Nidovirales
科： 冠狀病毒科 Coronaviridae
屬： 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus
種：
人類冠狀病毒HKU1 Human coronavirus HKU1

人類冠狀病毒HKU1（Human coronavirus HKU、HCoV-HKU1），是乙型冠狀病毒屬的一種病毒，可能是源於感染鼠類的病毒[1]，於2005年1月由香港大學的研究團隊發表，在香港兩名肺炎患者的鼻咽分泌物中發現[2]。

HKU1病毒與同屬的人類冠狀病毒OC43以及甲型冠狀病毒屬的人類冠狀病毒229E和人類冠狀病毒NL63同為造成人類普通感冒的四種冠狀病毒[3]，也是四種病毒中最晚被發現的。此病毒與OC43病毒一樣以9-O-乙醯基唾液酸（9-O-acetylated sialic acids、9-O-Ac-Sias）為受體感染細胞[1][4]。

發現

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2004年一月，一名從深圳返回香港的71歲的男子，因咳嗽有痰與發燒而入院治療，經胸部X光檢查證實有肺炎症狀，其鼻咽分泌物的數種病毒檢測均呈陰性，經檢驗發現新型的冠狀病毒HKU1。該名男子在入院五天後因症狀緩解而出院。後來研究人員檢查樣本發現另一名35歲、有肺炎症狀的婦人鼻咽分泌物中亦有此病毒[5]。

由於HCoV-HKU1的檢出率低，導致學界對其認知有限。巴西研究人員於2011年宣布在一名於1995年冷凍的兒童鼻咽拭子樣本中找到HCoV-HKU1，使得HCoV-HKU1的記錄提前到1995年，並且研究人員通過進化樹分析認為病毒早期可能存在其它分支[6] 。

基因組

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人類冠狀病毒HKU1的基因組約長30000nt，其GC含量僅32%，是冠狀病毒中GC比最低者。其基因組編碼冠狀病毒皆有的複製酶（1a/1b）和刺突蛋白（S）、膜蛋白（M）、外膜蛋白（E）與衣殼蛋白（N）等四種結構蛋白，此外還有血凝素酯酶（英語：hemagglutinin esterase）（HE）與ORF4和ORF8兩個開放閱讀框編碼輔助蛋白，其基因順序為1ab-HE-S-ORF4-E-M-N-ORF8，其中ORF8的開放閱讀框位於衣殼蛋白的開放閱讀框之內[5]。

感染

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冠狀病毒感染細胞之前，其刺突蛋白一般需被宿主細胞的蛋白酶切割，使其介導病毒外膜和細胞膜融合的結構域露出以利感染。HKU1病毒刺突蛋白中具有一S1/S2切割位點，可能可以被弗林蛋白酶切割[7]。此病毒感染的潛伏期為2–4天[8]，在冬季較多[2]，造成的症狀通常包括流鼻水、發燒、咳嗽與喘息等，嚴重者可造成肺炎或細支氣管炎（英語：bronchiolitis），另外有研究人員認為此病毒可能造成腸道症狀[7][9]。還有研究顯示被HKU1病毒感染的兒童發生熱性痙攣的比例高於被其他呼吸道病毒感染者[2][10]。

分類

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乙型冠狀病毒屬中，人類冠狀病毒HKU1與乙型冠狀病毒1型、兔冠狀病毒HKU14、中國鼠冠狀病毒HKU24與鼠冠狀病毒等共同組成一演化支支系A（lineage A），此演化支的病毒基因組中皆編碼血凝素酯酶（HE），其他冠狀病毒則無[11][12]。上述病毒中HKU1病毒可能與鼠冠狀病毒的關係較為接近，互為姊妹群，序列分析顯示HKU1病毒曾與鼠肝炎病毒（鼠冠狀病毒的一型）發生重組，另外不同基因型的HKU1病毒間亦有重組發生[8]。

參考文獻

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  1. ^ 1.0 1.1 Lim, Yvonne Xinyi; Ng, Yan Ling; Tam, James P.; Liu, Ding Xiang. Human Coronaviruses: A Review of Virus–Host Interactions. Diseases. 2016-07-25, 4 (3) [2020-03-06]. ISSN 2079-9721. PMC 5456285 可免費查閱. PMID 28933406. doi:10.3390/diseases4030026. （原始內容存檔於2020-06-04）. See Table 1. 
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 Lau, S. K. P.; Woo, P. C. Y.; Yip, C. C. Y.; Tse, H.; Tsoi, H.-w.; Cheng, V. C. C.; Lee, P.; Tang, B. S. F.; Cheung, C. H. Y.; Lee, R. A.; So, L.-y.; Lau, Y.-l.; Chan, K.-h.; Yuen, K.-y. Coronavirus HKU1 and Other Coronavirus Infections in Hong Kong. Journal of Clinical Microbiology. 2006, 44 (6): 2063–71. PMC 1489438 可免費查閱. PMID 16757599. doi:10.1128/JCM.02614-05. 
  3. ^ Human Coronavirus Types. Centers for Disease Control and Prevention. 2020-02-15 [2020-03-25]. （原始內容存檔於2020-02-04）. 
  4. ^ Hulswit, Ruben J. G.; Lang, Yifei; Bakkers, Mark J. G.; Li, Wentao; Li, Zeshi; Schouten, Arie; Ophorst, Bram; van Kuppeveld, Frank J. M.; Boons, Geert-Jan; Bosch, Berend-Jan; Huizinga, Eric G.; de Groot, Raoul J. Human coronaviruses OC43 and HKU1 bind to 9-O-acetylated sialic acids via a conserved receptor-binding site in spike protein domain A. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2019, 116 (7): 2681–2690. ISSN 0027-8424. doi:10.1073/pnas.1809667116. 
  5. ^ 5.0 5.1 Woo, P. C. Y.; Lau, S. K. P.; Chu, C.-m.; Chan, K.-h.; Tsoi, H.-w.; Huang, Y.; Wong, B. H. L.; Poon, R. W. S.; Cai, J. J.; Luk, W.-k.; Poon, L. L. M.; Wong, S. S. Y.; Guan, Y.; Peiris, J. S. M.; Yuen, K.-y. Characterization and Complete Genome Sequence of a Novel Coronavirus, Coronavirus HKU1, from Patients with Pneumonia. Journal of Virology. 2004, 79 (2): 884–95. PMC 538593 可免費查閱. PMID 15613317. doi:10.1128/JVI.79.2.884-895.2005. 
  6. ^ 劉培林; 史蕾; 顧大勇; 胡龍飛. 人冠状病毒HCoV-HKU1研究进展. 中國公共衛生. 2017, 33 (8) [2020-04-07]. （原始內容存檔於2020-04-07）. 
  7. ^ 7.0 7.1 Pyrc, K.; Berkhout, B.; van der Hoek, L. The Novel Human Coronaviruses NL63 and HKU1. Journal of Virology. 2006, 81 (7): 3051–3057. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.01466-06. 
  8. ^ 8.0 8.1 Su, Shuo; Wong, Gary; Shi, Weifeng; Liu, Jun; Lai, Alexander C.K.; Zhou, Jiyong; Liu, Wenjun; Bi, Yuhai; Gao, George F. Epidemiology, Genetic Recombination, and Pathogenesis of Coronaviruses. Trends in Microbiology. 2016, 24 (6): 490–502. ISSN 0966-842X. doi:10.1016/j.tim.2016.03.003. 
  9. ^ Vabret, A.; Dina, J.; Gouarin, S.; Petitjean, J.; Corbet, S.; Freymuth, F. Detection of the New Human Coronavirus HKU1: A Report of 6 Cases. Clinical Infectious Diseases. 2006, 42 (5): 634–639. ISSN 1058-4838. doi:10.1086/500136. 
  10. ^ Kelvin K. W. To, Ivan F. N. Hung, Jasper F. W. Chan, Kwok-Yung Yuen. From SARS coronavirus to novel animal and human coronaviruses 5. Journal of Thoracic Disease. 2013. doi:10.3978/j.issn.2072-1439.2013.06.02. 
  11. ^ Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung. Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis. Viruses. 2010-08-24, 2 (8): 1804–1820. ISSN 1999-4915. PMC 3185738 可免費查閱. PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1). 
  12. ^ Lau, Susanna K. P.; Woo, Patrick C. Y.; Li, Kenneth S. M.; Tsang, Alan K. L.; Fan, Rachel Y. Y.; Luk, Hayes K. H.; Cai, Jian-Piao; Chan, Kwok-Hung; Zheng, Bo-Jian; Wang, Ming; Yuen, Kwok-Yung; Sandri-Goldin, R. M. Discovery of a Novel Coronavirus, China Rattus Coronavirus HKU24, from Norway Rats Supports the Murine Origin of Betacoronavirus 1 and Has Implications for the Ancestor of Betacoronavirus Lineage A. Journal of Virology. 2015, 89 (6): 3076–3092. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.02420-14. 
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