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溶菌酶

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溶菌酶
溶菌酶的單晶
識別
符號 LYZ
Entrez 4069
HUGO 6740
OMIM 153450
RefSeq NM_000239
UniProt P61626
其他資料
EC編號 3.2.1.17
基因座 12 [1]
Lysozyme
PDB rendering based on 132l.
有效結構
PDB 直系同源檢索:PDBe, RCSB
標識
代號 LYZ; LZM
擴展標識 遺傳學153450 鼠基因96897 同源基因121490 GeneCards: LYZ Gene
EC編號 3.2.1.17
RNA表達模式
更多表達數據
直系同源體
物種 人類 小鼠
Entrez 4069 n/a
Ensembl ENSG00000090382 n/a
UniProt P61626 n/a
mRNA序列 NM_000239 n/a
蛋白序列 NP_000230 n/a
基因位置 Chr 12:
69.74 – 69.75 Mb
n/a
PubMed查詢 [2] n/a

溶菌酶(英文名稱:Lysozyme,又譯溶解酶)是一個分子量為14.4kDa的抗菌,屬於先天免疫系統的一員,它可經由催化細菌細胞壁肽聚糖中的N-乙酰胞壁酸N-乙酰葡糖胺殘基間的1,4-β-糖苷鍵水解,而破壞細菌的細胞壁。由於革蘭氏陽性菌的肽聚糖層遠厚於革蘭氏陰性菌,且為其細胞壁主成分,此酶主要針對革蘭氏陽性菌。

一些人體細胞分泌液中含有溶菌酶在,如唾液眼淚鼻涕;溶菌酶也存在於粒線體中的細胞質顆粒體和蛋清中。

歷史

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1909年,Laschtschenko發現蛋清中有殺菌物質。1922年,亞歷山大·弗萊明在研究鼻腔粘液的抗菌作用時發現並命名了溶菌酶。[1]

1965年,大衛·菲利浦X射線衍射技術研究溶菌酶晶體,解析出了2分辨率的晶體結構。[2][3]這是第二個使用X射線衍射技術得到的蛋白質結構,也是第一個解析出的酶結構。大衛·菲利浦根據次結構提出了溶菌酶催化的機理,該催化機理最近得到了修正。[4]

生理學功能

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溶菌酶是體內免疫系統的一部分,可殺滅革蘭氏陽性菌。溶菌酶結合到細菌表面,減少負電荷並協助對細菌的吞噬作用。新生兒缺乏溶菌酶會導致肺支氣管發育不良(bronchopulmonary dysplasia)。食用缺乏溶菌酶的配方奶粉會使嬰兒腹瀉的概率提高三倍。眼淚中缺乏溶菌酶會導致結膜炎。

某些癌細胞會分泌過量的溶菌酶,導致血液中溶菌酶含量過高,造成腎衰竭和低血鉀。

催化機制

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溶菌酶進攻肽聚糖(細菌細胞壁的組分,特別在革蘭氏陽性菌的細胞壁中含量豐富)水解連接N-乙酰胞壁酸和N-乙酰葡糖胺第四位碳原子的糖苷鍵。整個過程是,首先溶菌酶通過其兩個結構域之間的「溝」結合到肽聚糖分子上;隨後其底物在酶中形成過渡態的構象。根據Phillips機制,溶菌酶與葡聚六糖結合。然後溶菌酶將葡聚六糖上的第四個糖扭曲為半椅形構象。在這種扭曲狀態(能量較高)中,糖苷鍵很容易就發生斷裂。

位於溶菌酶蛋白序列35位的穀氨酸(Glu35)和52位的天冬氨酸(Asp52)的側鏈被發現對於溶菌酶的活性非常關鍵。Glu35作為糖苷鍵的質子供體,剪切底物的C-O鍵;而Asp52作為親核試劑參與生成糖基酶中間體。隨後,糖基酶中間體與水分子發生反應,水解生成產物,而酶保持不變。

相關疾病

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在一些遺傳性澱粉樣變中發現,病人編碼的溶菌酶基因中含有一個突變,從而導致溶菌酶在體內多個組織中聚集。[5]

應用

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溶菌酶被廣泛用於實驗室中對細菌所進行的細胞破碎

由於溶菌酶易於結晶,常被用於各種晶體學相關的研究。

參見

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參考文獻

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  1. ^ Fleming, Alexander; Wright, Almroth Edward. On a remarkable bacteriolytic element found in tissues and secretions. Proceedings of the Royal Society of London. Series B, Containing Papers of a Biological Character. 1922-05-01, 93 (653) [2022-08-28]. doi:10.1098/rspb.1922.0023. (原始內容存檔於2022-10-21). 
  2. ^ Blake, C. C. F.; Koenig, D. F.; Mair, G. A.; North, A. C. T.; Phillips, D. C.; Sarma, V. R. Structure of Hen Egg-White Lysozyme: A Three-dimensional Fourier Synthesis at 2 Å Resolution. Nature. 1965-05, 206 (4986) [2022-08-28]. ISSN 1476-4687. doi:10.1038/206757a0. (原始內容存檔於2022-11-21) (英語). 
  3. ^ Johnson, Louise N.; Phillips, D. C. Structure of Some Crystalline Lysozyme-Inhibitor Complexes Determined by X-Ray Analysis At 6 Å Resolution. Nature. 1965-05, 206 (4986) [2022-08-28]. ISSN 1476-4687. doi:10.1038/206761a0. (原始內容存檔於2022-08-28) (英語). 
  4. ^ Vocadlo, David J.; Davies, Gideon J.; Laine, Roger; Withers, Stephen G. Catalysis by hen egg-white lysozyme proceeds via a covalent intermediate. Nature. 2001-08, 412 (6849) [2022-08-28]. ISSN 0028-0836. doi:10.1038/35090602. (原始內容存檔於2022-10-08) (英語). 
  5. ^ OMIM 105200

外部連結

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