严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2缪变异株

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2019冠状病毒病疫情
科学准确的 SARS-CoV-2 外部结构原子模型。 每个“球”都是一个原子。
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变异株
高关注变异株(VOC)

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反应与影响
  • 社会经济影响
  • 对行业影响
  • 文化娱乐
  • 互联网
2019冠状病毒病主题

严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2-缪变异株（英语：SARS-CoV-2 Mu variant），别名B.1.621谱系 （英语：Lineage B.1.621），是严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）的一种变异株。于2021年七月在哥伦比亚被发现并在同年8月30日被WHO标示为“需留意变异株”（VOI）。[1]WHO称这个变种拥有可能使疫苗失效的突变，并表示必须深入研究以彻底了解此种变异株。[2]缪变异株已被通报在南美洲与欧洲扩散。[3]

B.1.621谱系拥有一个子谱系，依PANGO命名规则编号为B.1.621.1， 目前已被发现散布到全世界20余国。[4]

命名[编辑]

2021年一月，此变异株首度在哥伦比亚被发现，并被命名为 B.1.621。[5]

7月1日，英国公共卫生部（英语：Health Protection Agency）将 B.1.621 命名为VUI-21JUL-1。[6]

8月30日，世界卫生组织将 B.1.621 命名为缪变异株。[1]

变异[编辑]

缪变异株的基因体拥有21个突变位，包括9个氨基酸突变，棘蛋白编号分别为: T95I、Y144S、Y145N、R346K、E484K，以及逃脱变异N501Y、D614G、P681H、以及D950N。[7]病毒突变并不罕见。每一种病毒，包括SARS-CoV-2，每隔一段时间就会变化。 大部分的突变是无关紧要的，但一些突变可以增强病毒的威力或对药物、疫苗产生免疫逃避（英语：antigenic escape）。[3] 一项在罗马一间实验室进行的研究[8]测试了辉瑞-BioNTech疫苗对缪变异株的疗效，并发现: 虽然缪变异株在棘蛋白上有许多突变，辉瑞疫苗仍能有效将其消灭。而相较于其他变种株，辉瑞疫苗虽然有效，但其诱发的抗体消灭缪变异株的效果大大减弱。[5]

  • SARS-CoV-2 缪变异株基因体棘蛋白部分的氨基酸变异图[9]
    SARS-CoV-2 缪变异株基因体棘蛋白部分的氨基酸变异图[9]
缪变异株变异特征[7]
基因编号 突变之氨基酸编号
ORF1a T1055A
T1538I
T3255I
Q3729R
ORF1b P314L
P1342S
棘蛋白(S) T95I
Y144S
Y145N
R346K
E484K
N501Y
D614G
P681H
D950N
ORF3a Q57H
del257/257
ORF8 T11K
P38S
S67F
核壳蛋白(N) T205I

历史[编辑]

2021年8月[编辑]

8月30日，日本宣布确诊境内首两例缪变异株患者，分别是一名40岁左右的女性，于8月26日自阿拉伯联合酋长国入境。另一名为50多岁女性，于7月5日由英国入境。此两例皆为无症状感染者。[10]

2021年9月[编辑]

9月2日:

  • 中华民国中央流行疫情指挥中心宣布发现台湾第一例缪变种株确诊个案，为一位60多岁本国籍女性，自美国入境，且已接种2剂辉瑞疫苗。她在7月5日于美国接种第一剂辉瑞疫苗，并于7月26日接种第二剂。当她于8月3日返国时，起先并未回报有任何症状，后于机场检疫时确诊COVID-19。[11][12]
  • 危地马拉通报境内首两例女性缪变异株患者，分别为19及25岁。两名患者皆无旅游史与疫苗接种史。病人随即被安置在位于危地马拉城的医院。[13]

9月3日:

  • 希腊通报境内首六例缪变异株确诊案例。其中四例为境外移入。[14]
  • 香港通报境内首三例缪变异株确诊案例。其中两例为19岁男性与22岁女性，曾入境危地马拉，确认在六月初时就已感染缪变异株，另一26岁女性，自美国入境，于7月24日确诊。香港同时也新增了四例境外移入COVID-19病例，皆为由菲律宾入境之移工。[15]
  • 韩国通报境内首三例缪变异株确诊案例。疾病管理厅宣布确诊3例由墨西哥、美国及哥伦比亚入境之境外移入病例。[16]

9月4日:

  • 爱尔兰健康保护监测中心(HPSC)通报境内四例缪变异株确诊案例。其中两例病例与 B.1.621.1 有关。[17]


统计数据[编辑]

各国确诊个案(截至2021年9月6日)
国家 病例数
来自GISAID[18] 来自outbreak.info[7] 来自其他来源
 美国 2,400 2,216
 哥伦比亚 965 877
 西班牙 512 512
 墨西哥 367 357
 厄瓜多尔 170 170
 阿鲁巴 84 84
 意大利 82 77
 智利 84 73
 荷兰 75 72 44[19]
 英国 61 55 53[20]
 波多黎各 – 51
 奥地利 49 49
 哥斯达黎加 49 49
 瑞士 48 48
 加拿大 114 69
 多米尼加 46 46
 比利时 36 36
 葡萄牙 24 24
 英属维尔京群岛 21 21
 库拉索 20 20
 德国 14 14
 秘鲁 14 14
 法国 21 16
 巴西 11 11
 荷兰加勒比区 8 8
 丹麦 7 7
 波兰 6 6
 委内瑞拉 5 5
 爱尔兰 4 4 4[17]
 芬兰 3 3
 荷属圣马丁 3 3
 斯洛伐克 3 3
 瑞典 4 4
 开曼群岛 2 2
 香港 2 2 3[15]
 日本 2 2 2[10]
 土耳其 2 2
 巴巴多斯 1 1
 直布罗陀 1 1
 以色列 1 1
 列支敦士登 1 1
 卢森堡 2 2
 马耳他 1 1
 罗马尼亚 1 1
 韩国 1 1 3[16]
 特克斯和凯科斯群岛 1 1
 希腊 – – 6[14]
 危地马拉 – – 2[13]
 台湾 – – 1[11]
共计: 5,328 5,022 118

参见[编辑]

参考文献[编辑]

  1. ^ 1.0 1.1 Tracking SARS-CoV-2 variants. who.int. World Health Organization. [September 1, 2021]. （原始内容存档于2021-06-18） （英语）. 
  2. ^ WHO monitoring new coronavirus variant named 'Mu'. france24.com. September 1, 2021 [September 1, 2021]. （原始内容存档于2021-09-01） （英语）. 
  3. ^ 3.0 3.1 Why Has WHO Designated 'Mu' A Variant Of Concern? Find Out All About It. ndtv.com. September 1, 2021 [September 1, 2021]. （原始内容存档于2021-09-01） （英语）. 
  4. ^ Lineage B.1.621.1. cov-lineages.org. [September 1, 2021]. （原始内容存档于2021-08-31） （英语）. 
  5. ^ 5.0 5.1 Mu COVID variant: All you need to know about the new UK coronavirus strain. BBC Science Focus Magazine. [2021-09-01]. （原始内容存档于2021-09-01） （英语）. 
  6. ^ Variants: distribution of cases data. gov.uk. Government Digital Service. [September 1, 2021]. （原始内容存档于2021-06-07）. 
  7. ^ 7.0 7.1 7.2 Mu Lineage Report. outbreak.info. [September 1, 2021]. （原始内容存档于2021-09-01）. 
  8. ^ Messali, S., Bertelli, A., Campisi, G., Zani, A., Ciccozzi, M., Caruso, A. and Caccuri, F.(2021). A cluster of the new SARS-CoV-2 B.1.621 lineage in Italy and sensitivity of the viral isolate to the BNT162b2 vaccine.. Journal of Medical Virology. [2020-09-04]. 
  9. ^ SARS-CoV-2 variants - Stanford Coronavirus Antiviral & Resistance Database. covdb.stanford.edu. Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database. [September 1, 2021]. （原始内容存档于2021-06-30）. 
  10. ^ 10.0 10.1 Japan confirms first cases of mu variant of COVID-19. thebharatexpressnews.com. September 2, 2021 [September 2, 2021]. （原始内容存档于September 2, 2021）. 
  11. ^ 11.0 11.1 Taiwan reports its 1st imported case of Mu COVID variant. Taiwan News. September 3, 2021 [September 3, 2021]. （原始内容存档于2021-11-27）. 
  12. ^ 疾管署. 新增19例COVID-19確定病例，分別為16例本土及3例境外移入. 2021-08-03 [2021-09-04]. 
  13. ^ 13.0 13.1 The “MU” variant is already in Guatemala. Is it immune to vaccines?. bullfrag.com. [September 4, 2021]. （原始内容存档于2021-11-27） （英语）. 
  14. ^ 14.0 14.1 Κορονοϊός - Μετάλλαξη Mu: Έξι κρούσματα στην Ελλάδα - Πού εντοπίστηκαν. ethnos.gr. [September 3, 2021]. （原始内容存档于2021-09-03） （希腊语）. 
  15. ^ 15.0 15.1 Coronavirus: three cases of new Mu variant found in Hong Kong arrivals, authorities reveal. South China Morning Post. [September 3, 2021]. （原始内容存档于2021-11-27） （英语）. 
  16. ^ 16.0 16.1 3 Mu variant cases detected in South Korea. malaysianow.com. September 3, 2021 [September 4, 2021]. （原始内容存档于2021-09-04） （英语）. 
  17. ^ 17.0 17.1 Neville, Steve. Four Covid cases associated with Mu variant identified in Ireland. Irish Examiner. 4 September 2021 [5 September 2021]. （原始内容存档于2021-11-27）. 
  18. ^ Tracking of Variants. gisaid.org. [September 5, 2021]. （原始内容存档于2021-06-23）. 
  19. ^ Variants of the coronavirus SARS-CoV-2. rivm.nl. [September 4, 2021]. （原始内容存档于2021-07-09）. 
  20. ^ Variants: distribution of case data, 3 September 2021. gov.uk. Government Digital Service. [September 4, 2021]. （原始内容存档于2021-09-03）. 
SARSr-CoV
SARS-CoV-1相关病毒
人类病毒
蝙蝠病毒
HKU3 · Rm1 · Rf1 · Rp3 · Rs672 · SHC014 · WIV1 · LYRa11 · YNLF 31C · YNLF 34C · WIV16 · 16BO133
其他
SARS-CoV-2相关病毒
人类病毒
变异株
需要关注的变异株（英语：SARS-CoV-2 variant of concern）（VOC）
奥密克戎（B.1.1.529）
子谱系：BA.1、BA.1.1、BA.2、BA.2.10.1、BA.2.12、BA.2.12.1、BA.2.75、BA.2.75.2、BA.2.86、BA.3、BA.4、BA.5、BA.5.2.1、BF.7、BQ.1、BQ.1.1、CH.1.1、EG.5、EG.5.1、JN.1、XBB、XBB.1、XBB.1.5、XBB.1.9.2、XBB.1.16、XBF、XE（西班牙语：Variante XE del SARS-CoV-2）
原需要关注的变异株
阿尔法（B.1.1.7）（带E484K版本）（书面挪威语：Lineage B.1.1.7 with E484K） · 贝塔（B.1.351） · 伽马（P.1） · 德尔塔（B.1.617.2）
原需要留意的变异株（阿拉伯语：متحور مثير للاهتمام）（VOI）
及监视下的变异株（阿拉伯语：متحور قيد المراقبة）（VUM）
泽塔（英语：SARS-CoV-2 Zeta variant）（P.2） · 西塔（英语：SARS-CoV-2 Theta variant）（P.3） · 艾普西隆（英语：SARS-CoV-2 Epsilon variant）（B.1.427、B.1.429（书面挪威语：Lineage B.1.429）、CAL.20C） · 卡帕（B.1.617.1） · 约塔（英语：SARS-CoV-2 Iota variant）（B.1.526） · 埃塔（英语：SARS-CoV-2 Eta variant）（B.1.525） · 拉姆达（C.37） · 缪（B.1.621）
曾监视的变异株（FMV）
AV.1 · AT.1 · R.1（西班牙语：Variante R.1 del SARS-CoV-2） · B.1.466.2 · B.1.1.519 · C.36.3 · B.1.214.2 · B.1.1.523（西班牙语：B.1.1.523） · B.1.619 · B.1.620（书面挪威语：Lineage B.1.620） · B.1.1.318（书面挪威语：Lineage B.1.1.318）/AZ.5 · C.1.2（他加禄语：SARS-CoV-2 Lineage C.1.2） · B.1.630 · B.1.640 · XD
其他变种
B.1.1.207（书面挪威语：Lineage B.1.1.207） · B.1.1.317 · B.1.616（书面挪威语：Den bretonske koronavarianten） · B.1.618（书面挪威语：Lineage B.1.618） · B.1.640.2（德语：B.1.640.2） · 德尔塔cron（书面挪威语：«Deltacron»） · XF · Cluster 5（英语：Cluster 5）（已消亡）
错义突变
del 69-70 · RSYLTPGD246-253N · N440K · G446V · L452R（书面挪威语：Mutasjon L452R） · Y453F · S477G/N · E484Q（书面挪威语：Mutasjon E484Q） · E484K（书面挪威语：Mutasjon E484K） · F490S · N501Y（书面挪威语：Mutasjon N501Y） · N501S · D614G（书面挪威语：Mutasjon D614G） · Q677P/H · P681H（书面挪威语：Mutasjon P681H） · P681R（书面挪威语：Mutasjon P681R） · A701V（书面挪威语：Mutasjon A701B og mutasjon A701V）
蝙蝠病毒
RaTG13 · RmYN02 · RacCS203（英语：RacCS203） · RshSTT182 · RshSTT200 · ZC45 · ZXC21 · Rc-o319
其他
穿山甲冠状病毒（GD · GX · Pangolin-CoV-2020）
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