感染：修订间差异

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我對 Infection 所作的翻譯，把前手的資料幾乎完全覆蓋過去。原文中的 Society and culture 未予翻譯，主要是因為對 pathogen load的了解需要花太多的時間，加上原作者引用的參考文獻，必須付費，才能閱讀，暫時不必（但這個區塊很有趣，將來我另外找得到治療的話，會設法補充）。 我自己的印象，對於會傳染的病，中文通常用[傳染病]來表達，但是所謂的 contagious ，和 infectious 是有分別的，因此譯文中只有一小部分會用傳染病來表達，其他的，就用感染病，或感染性疾病來表達。敬請批評指教。
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{{short description|Invasion of an organism's body tissues by disease-causing agents}}
{{Expand language|time=2020-02-01}}
{{Infobox medical condition (new)
{{expert-subject|time=2013-08-23T04:50:00+00:00}}
| name = 感染
{{Medical}}
| image = Malaria.jpg
'''感染'''是指由[[病原體]][[物種]]在身為宿主的[[個體]]內進行有害的[[複製]]、[[繁殖]]過程，一般而言造成感染的病原體包含4類:細菌、病毒、黴菌、寄生蟲。感染三角為：宿主-病原體-環境，欲中斷感染三角，唯一的方法就是破壞三者其中一。
| caption = [[假色]]的[[電子顯微鏡]]圖片，顯示瘧原蟲孢子體正穿過[[大鼠屬|老鼠]]的{{link-en|中腸|midgut}}[[上皮組織]]
具傳染性的[[生物體]]會尋找並且利用[[宿主]]體內資源，以利自身生存，但這個過程一旦干擾了宿主正常的[[生理]]運作，可能造成[[慢性]]症狀、[[急性]]症狀、[[壞疽]]（gangrene）、[[器官]]及[[组织 (生物学)|組織]]被吞噬、甚至[[死亡]]，因此這類物種又稱為[[病原體]]，通常是[[微生物]]，但事實上感染的定義可以更廣，包括[[細菌]]、[[病毒]]、[[寄生蟲]]、[[真菌]]、[[類病毒]]，甚或是具有致病能力、但並非[[生物]]的傳染性物質，例如[[普恩蛋白]]。由於[[醫學]]領域[[研究]]的[[疾病]]多由傳染而來，[[傳染病]]因此成為醫學中重要的一個學術分支。
| field = {{link-en|感染性疾病學|Infectious disease (medical specialty)}}
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'''感染'''指的是疾病的[[病原體]]侵入[[生物]]的[[組織 (生物學)|組織]]，然後病原體開始繁殖，以及[[宿主]]的組織對這些病原體，及病原體所產生[[毒素]]產生的反應。<ref>[http://medical-dictionary.thefreedictionary.com/infection Definition of "infection" from several medical dictionaries] – Retrieved on 2012-04-03</ref><ref name="News Ghana">{{cite news | url=http://newsghana.com.gh/?p=853675 | title=Utilizing antibiotics agents effectively will preserve present day medication| publisher=News Ghana | date=21 November 2015 | accessdate=21 November 2015}}</ref> 感染性疾病，('''infectious disease'''，也稱為 '''transmissible disease''' ，或者 '''communicable disease'''），是由感染而引起的[[疾病]]。
引起感染的病原體有：
*[[病毒]]，和相關病原體，如[[類病毒]]，和[[朊毒體]]
*[[病原細菌]]
*[[真菌]]，進一步細分為：
**[[子囊菌門]]，包括[[酵母]]（例如''[[念珠菌屬]]''），[[菌絲|絲狀真菌]]（例如''[[麴菌屬]]''，''[[肺孢子菌綱]]''）和[[皮癬菌病]]（一組導致人類皮膚和其他表面組織感染的[[生物]]）。<ref>{{Cite web|url=https://www.cdc.gov/fungal/diseases/index.html|title=Types of Fungal Diseases {{!}} Fungal Diseases {{!}} CDC|date=2019-06-27|website=www.cdc.gov|language=en-us|access-date=2019-12-09}}</ref>
**[[擔子菌門]]，包括導致人類感染的''[[隱球菌屬]]''。<ref>{{Citation|last1=Mada|first1=Pradeep Kumar|title=Cryptococcus (Cryptococcosis)|date=2019|url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK431060/|work=StatPearls|publisher=StatPearls Publishing|pmid=28613714|access-date=2019-12-09|last2=Jamil|first2=Radia T.|last3=Alam|first3=Mohammed U.}}</ref>
*[[線蟲動物門]]，通常分為：<ref>{{Cite web|url=https://www.cdc.gov/parasites/about.html|title=CDC - Parasites - About Parasites|date=2019-02-25|website=www.cdc.gov|language=en-us|access-date=2019-12-09}}</ref>
**[[單細胞生物]]（例如[[瘧疾]]，''[[弓形蟲]]''，''[[巴倍蟲屬]]''）
**大型寄生物<ref>{{Cite journal |jstor = 656401|title = Microparasites and Macroparasites|journal = Cultural Anthropology|volume = 2|issue = 1|pages = 155–171|last1 = Brown|first1 = Peter J.|year = 1987|doi = 10.1525/can.1987.2.1.02a00120}}</ref>（{{link-en|寄生蠕蟲|Parasitic worms}}），包括[[線蟲動物門|線蟲]]，例如圓蟲和[[蟯蟲屬]]，[[絛蟲綱]]，和[[吸蟲綱]]（例如[[血吸蟲病]]）
*[[節肢動物]]（例如[[蜱|壁蝨]]，[[蟎]]，[[跳蚤]]，和[[蝨毛目|蝨子]]）也可引起人類生病，從概念上講，它們類似於感染，但是這些大型寄生物對人體或動物的侵害通常被稱為“{{link-en|侵擾|infestation}}”。 （由寄生蠕蟲（大寄生物）引起的疾病，有時被稱為侵擾，但有時也被稱為感染。）
宿主可利用自身的[[免疫系統]]來對抗感染。[[哺乳動物]]的[[先天免疫系統]]先對感染發生反應（通常會有[[炎症|發炎]]現象），之後會發展出[[後天免疫系統]]。<ref>{{cite journal |author=Alberto Signore|title=About inflammation and infection |journal=EJNMMI Research |volume=8 |issue=3 |year=2013 |url=http://www.ejnmmires.com/content/pdf/2191-219X-3-8.pdf}}</ref>
用於治療感染的藥物有[[抗細菌藥|抗生素]]，[[抗病毒藥物]]，[[抗真菌藥]]，{{link-en|抗原蟲劑|Antiprotozoal}}，和{{link-en|驅蟲藥|antihelminthics}}。 2013年，全球因感染性疾病所導致的死亡人數為 920萬人（約佔所有當時死亡人數的 17％）。<ref name=GDB2013>{{cite journal|last1=GBD 2013 Mortality and Causes of Death|first1=Collaborators|title=Global, regional, and national age-sex specific all-cause and cause-specific mortality for 240 causes of death, 1990-2013: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2013|journal=Lancet|date=17 December 2014|pmid=25530442|doi=10.1016/S0140-6736(14)61682-2|volume=385|issue=9963|pages=117–71|pmc=4340604}}</ref> [[醫學]]領域中專注於處置感染的分支被稱為{{link-en|感染性疾病學|Infectious disease (medical specialty)}}
。<ref>{{cite web |url=https://www.aamc.org/cim/specialty/list/us/339608/infectious_disease_-internal_medicine.html |title=Infectious Disease, Internal Medicine |publisher=Association of American Medical Colleges |access-date=2015-08-20 |quote=Infectious disease is the subspecialty of internal medicine dealing with the diagnosis and treatment of communicable diseases of all types, in all organs, and in all ages of patients. |url-status=dead |archiveurl=https://web.archive.org/web/20150206201010/https://www.aamc.org/cim/specialty/list/us/339608/infectious_disease_-internal_medicine.html |archivedate=2015-02-06 |df= }}</ref>
==分類==
===亞臨床感染 vs 臨床感染（潛伏 vs 明顯）===
感染有症狀時，稱為''明顯''的''臨床''症狀，而感染活躍，但不產生明顯症狀，可稱為''不明顯感染''（英文表達字眼有 ''inapparent'', ''silent, ''subclinical'', 或 occult）。非活躍或蟄伏的感染稱為 ''潛伏感染 ''。<ref>{{cite book |author1=Kayser, Fritz H |author2=Kurt A Bienz |author3=Johannes Eckert |author4=Rolf M Zinkernagel | title = Medical microbiology | publisher = Georg Thieme Verlag | location = Stuttgart | year = 2005 | page = 398 | isbn = 978-3-13-131991-3 | oclc = }}</ref> 潛伏性細菌感染的一個例子是{{link-en|潛伏性肺結核| latent tuberculosis}}。一些病毒感染也可能是潛伏性的，被{{link-en|潛伏性病毒|Virus latency}}感染的例子是受到[[皰疹病毒科]]裡面的任何一種入侵的情況。<ref>{{Cite journal|last=Grinde|first=Bjørn|date=2013-10-25|title=Herpesviruses: latency and reactivation – viral strategies and host response|journal=Journal of Oral Microbiology|volume=5|pages=22766|doi=10.3402/jom.v5i0.22766|issn=0901-8328|pmc=3809354|pmid=24167660}}</ref>
''感染''一詞，用以表示某種特定病原體的存在（無論少到何種程度），但經常指的就是''明顯''的''臨床''感染（換句話說，就是感染到傳染病）。<ref name="Dorlands">{{Citation |author=Elsevier |authorlink=Elsevier |title=Dorland's Illustrated Medical Dictionary |publisher=Elsevier |url=http://dorlands.com/ |postscript=.}}</ref> 這情況有時會引起歧義，或產生用字上的討論；為了解決這個問題，對[[醫事人員]]來說，當他們表示某些病原體存在，但沒有臨床上明顯的感染（無疾病）顯現時，通常會用到''{{link-en|移生|colonization}}''，而不用''感染''來表達。
對於感染，又有不同的名詞。首先是急性感染。急性感染是指一種迅速發展的症狀，過程或者是迅速的，或者是拖得久的。<ref>{{Cite web|url=https://mpkb.org/home/pathogenesis/microbiota/acute_infections|title=Acute infections (MPKB)|website=mpkb.org|access-date=2019-12-09}}</ref> 接下來是慢性感染。慢性感染是指症狀要花幾週，或幾個月，逐漸發展，並且不易治療。<ref>{{Citation|last1=Boldogh|first1=Istvan|title=Persistent Viral Infections|date=1996|url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK8538/|work=Medical Microbiology|editor-last=Baron|editor-first=Samuel|edition=4th|publisher=University of Texas Medical Branch at Galveston|isbn=978-0-9631172-1-2|pmid=21413348|access-date=2020-01-23|last2=Albrecht|first2=Thomas|last3=Porter|first3=David D.}}</ref> 亞急性感染，與急性感染相比，發展時間較長，但又比慢性感染發展的快。潛伏性感染是急性發作後的一種感染；病原體存在，但沒症狀；隔一段時間，疾病又重新出現。局灶性感染的定義是，病原體從感染的初始部位開始，經由血液流傳到身體的其他部位，而發病（請參考：{{link-en|局灶性感染理論|Focal infection theory}}）。<ref name=":0">{{Cite book|title=Microbiology|last=Foster|first=John|publisher=Norton|year=2018|isbn=978-0-393-60257-9|location=New York|pages=39}}</ref>
===原發性病原體 vs 機會性病原體===
另請參閱：{{link-en|共同感染|Coinfection}}


在多種[[微生物]]中，只有極少數會對健康的人體引起疾病​​。<ref name=Baron>This section incorporates [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=mmed public domain] materials included in the text: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?call=bv.View..ShowTOC&rid=mmed.TOC&depth=10 Medical Microbiology] Fourth Edition: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=mmed.chapter.594 Chapter 8] (1996). Baron, Samuel MD. The University of Texas Medical Branch at Galveston. {{cite book|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=mmed |title=Medical Microbiology |accessdate=2013-11-27 |url-status=bot: unknown |archiveurl=https://web.archive.org/web/20090629132331/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=mmed |archivedate=June 29, 2009 |isbn=9780963117212 |publisher=University of Texas Medical Branch at Galveston |year=1996 }}</ref> 傳染病是由這幾種病原體與宿主的防禦系統之間，相互作用所造成。由任何病原體引起的疾病症狀，及嚴重程度，取決於病原體損害宿主的能力，以及宿主抵抗力的有效性。但是，宿主的免疫系統，因為要控制感染，也有可能對宿主本身造成傷害。因此，臨床醫生根據宿主抵抗力狀態，把感染性微生物分類為''原發性病原體''，或者是''[[機會性感染|機會性]]病原體''：
'''傳染'''在[[中文]]定義上不同於感染，[[傳染]]乃是指[[疾病]]或[[病原體]]由一[[個體]]轉移至另一個體上的過程。但由於一般可感染[[生物體]]的疾病，也通常具有傳染力，因此兩者常混用。
;原發性病原體
原發性病原體在正常且健康的宿主體內存在，或者它們的活動，而引起疾病，其固有的[[病毒性]]（引起疾病的嚴重程度）在某種程度上，是病原體繁殖和傳播的必然結果。人類許多常見的原發性病原體僅會感染人類，但是，也有許多嚴重的疾病是人類由從環境中，或者是從非人類的宿主，所碰到的病原體所引起。
;機會性病原體
主條目：[[機會性感染]]


機會性病原體可以對抵抗力低下（[[免疫缺陷]]）的宿主，或者經由異常管道進入身體內部（例如，通過[[創傷]]），導致感染性疾病。機會性感染可能是由與宿主接觸的微生物引起（例如[[消化道]]或上[[呼吸道]]中的[[病原細菌]]或者[[真菌]]），也可能是從其他宿主得來（無害的）微生物所造成（例如[[偽膜性結腸炎]] ），或由於外傷導致的結果（如[[外科學|手術]]的傷口感染，或者複合性骨折）。機會性感染會發生在宿主的抵抗力受到損害 - 由於{{link-en|遺傳缺陷|genetic defect}}（例如[[慢性肉芽腫病]]），接觸到{{link-en|抗菌劑|antimicrobial}}，或者接觸到[[免疫抑制]]化學物質（如中毒，或癌症[[化學療法]]後），接觸到[[游離輻射]]，或者罹患具有免疫抑制活性的傳染病（例如[[麻疹]]，[[瘧疾]]，或者[[人類免疫缺乏病毒|愛滋病毒]]）。與抵抗力強的宿主相比，原發性病原體有可能會在抵抗力低下的宿主中，引起更嚴重的疾病。<ref name=Sherris/>
== 参考文献 ==
{{Reflist}}
;繼發性感染
原發性感染可被視為個人健康發生問題的[[根本原因]]，繼發性感染是這項根本原因的{{link-en|後遺症|sequela}}，或稱[[併發症]]。例如，[[肺結核]]通常是原發性感染，但是僅由於[[灼傷]]或{{link-en|穿透性創傷|Penetrating trauma}}（根本原因）讓結核菌不尋常地進入深部組織而發生的感染，則是繼發性感染。原發性病原體引起的是原發性感染，也常會引起繼發性感染。通常機會性感染被視為繼發性感染（因為免疫缺陷，或[[創傷]]是誘發因素）。
;其他類型的感染
其他類型的感染包括混合感染，[[醫源病|醫源性]]感染，[[醫療照顧相關感染]]，和社區感染。混合感染是由兩種，或多種病原體引起的感染。一個例子是[[闌尾炎]]，它是由{{link-en|脆若性桿菌|Bacteroides fragilis}}和[[大腸桿菌]]共同所引起。第二是醫源性感染。這是一種從醫護人員傳播給患者的感染。醫療照顧相關感染是在醫療機構中發生的感染，指的是住院期間罹患的感染。最後，社區感染是指從社區之內得到的感染。<ref name=":0" />
===有感染性與否===
要證明疾病是否具有感染性的一種方法是得符合[[柯霍氏法則]]（首度由 [[羅伯·柯霍]] 提出），第一，僅在患有特定疾病的患者中有這種感染原，而在健康對照組中則沒有；第二，，接觸到感染病原體的人也會患上這種疾病。這些法則首度使用時，發現[[分枝桿菌屬]]是引起[[結核病]]的原因。
但是，基於道德上的原因，在現代的做法，不會這樣的採用柯霍氏法則來檢測 - 把純培養的病原體用在健康的個體身上做實驗。反過來，縱然是明顯的感染病也不總是能符合感染的標準。例如，導致[[梅毒]]的{{link-en|梅毒螺旋體|Treponema pallidum}}無法透過試管培養，但可以在兔子的[[睾丸]]中培養。與純粹從培養皿培養出來的微生物相比，從動物宿主培養出來的微生物就沒那麼純粹了。
[[流行病學]]，用於研究和分析，對誰，為何，在何處，發生疾病，以及什麼是不同人群患有某種疾病的決定因素，是用於了解感染病的另一重要工具。流行病學家可以確定人群中不同組別間的差異，例如某些年齡層的感染率是高，或是低。居住在不同社區的人群是否更容易受到感染；以及其他因素，例如性別和種族。研究人員還可以評估{{link-en|疾病暴發|Disease outbreak}}，是零星陸續發生，還只是一次偶然事件。[[地方性流行]]的意思是區域內經常發生的常規病例；[[流行病]]的意思是一個地區中的病例迅速增加，而且異常多；而[[瘟疫|大流行]]則是一種全球流行病。如果對於感染病，不知其原因，則可利用流行病學來協助追踪感染源。
===傳染性===
當疾病很容易經由與病人或其分泌物接觸，而發生傳播時（例如[[流行性感冒]]），就被稱為傳染病。因此，傳染病（contagious disease）是特別是具有傳染性或易於傳播的感染性疾病（infectious disease）之下的子集型態。具有更專門感染途徑的其他類型的感染病，例如要透過[[載體|媒介]]傳播，或者性行為來傳播的，通常不被視為具有“傳染性（contagious）”，並且通常不需要對患者進行[[隔離 (醫療)|隔離]]（有時簡稱為[[隔離檢疫]]）。但是，在“傳染性（contagious）” 和 “傳染病（contagious disease）”這種詞的特殊含義被大眾使用之時，就沒那麼那麼的有專用性。感染性疾病（ Infectious diseases）通常是通過直接接觸，在人與人之間傳播。而接觸的類型有飛沫傳播。而間接接觸，例如透過空氣，受污染的物體，食物和飲用水等的傳播，人和動物接觸，經由動物宿主，昆蟲叮咬，和[[自然宿主]]等，都是感染性疾病傳播的另類別的方式。<ref>(Higurea & Pietrangelo 2016)</ref>
===按感染部位分類===
感染可根據感染部位或[[生物系統]]來做分類：
*[[泌尿道感染]]
*{{link-en|皮膚感染|Skin infection}}
*[[呼吸道感染]]
*{{link-en|齒源性感染|Odontogenic infection}}（源自牙齒或緊密周圍組織的感染）
*[[陰道炎|陰道感染]]
*{{link-en|絨毛膜羊膜炎|Chorioamnionitis}}（絨毛膜羊膜感染）
另外，人體很通常發炎的部位有肺部的[[肺炎]]，腦部的[[腦膜炎]]，和輸卵管的{{link-en|輸卵管炎|salpingitis}}。
==跡象和症狀==
感染的症狀由疾病的類型而定。某些跡象通常會影響到整個身體，例如疲勞，食慾不振，體重減輕，發燒，盜汗，發冷，隱痛，和疼痛。其他的則發生在身體的特定部位，例如皮膚[[疹|出疹子]]，[[咳嗽]]，或[[鼻漏|流鼻涕]]。
在某些情況下，感染性疾病在特定宿主中的大部分甚至全部病程中可能是{{link-en|無症狀|asymptomatic}}的。與無症狀者接觸後，繼而患病的人的 “疾病” 才會被定義為生病。感染本身不是感染疾病的同義詞，因為某些感染不會在宿主中發病​​。<ref name=Sherris/>
===細菌性或病毒性===
由於細菌和病毒感染均可引起患者相同類型的症狀，因此很難區分是哪種所引起。<ref name=nipa>[http://www.antibiotics-info.org/bact02.asp "Bacterial vs. Viral Infections – Do You Know the Difference?"] National Information Program on Antibiotics</ref> 但是把兩者區分出來很重要，因為病毒感染無法用抗生素治療，而細菌感染則可。<ref>{{cite book| title =The Truth About Illness and Disease|author1=Robert N. Golden |author2=Fred Peterson |publisher= Infobase Publishing, 2009|page=181|isbn= 978-1438126371|year=2009 }}</ref>
{|class="wikitable"
|+病毒性感染和細菌性感染比較
|-
! 性質
! [[病毒性疾病|病毒性感染]]
! [[病原細菌|細菌性感染]]
|-
|| 典型症狀
| 通常，病毒性感染是全身性的。發生流鼻涕，[[鼻竇]]充血，咳嗽，身體疼痛等。有時也會是局部性，如[[結膜炎]]（或稱“紅眼症”）和皰疹。只有少數病毒感染會像皰疹一樣讓患者痛苦不堪。病毒性感染所引起的不適通常會被描述成發癢或灼痛。<ref name="nipa"/>
| 細菌性感染的典型症狀是身體局部發紅，發熱，腫脹，和疼痛。這種感染的標誌之一是局部疼痛（身體特定部位的疼痛）。例如，如果是割傷而被細菌感染，感染部位會疼痛。細菌性喉嚨痛通常是喉嚨的部位特別疼痛。如果只有一耳發生疼痛，則這種耳朵感染{{link-en|耳炎|Otitis}}通常就是細菌性所導致。<ref name=nipa/> 會流出膿液和乳白色液體的傷口很可能是受到細菌感染。[澄清請求]<ref>{{cite web|publisher=Rencare |url=http://www.rencareltd.com/conditions/infections/ |title=Infection |accessdate=4 July 2013 |url-status=dead |archiveurl=https://web.archive.org/web/20120305023556/http://www.rencareltd.com/conditions/infections/ |archivedate=March 5, 2012 }}</ref>
|-
| 導致原因 || [[病毒]] || [[病原細菌]]
|}
==病理生理學==
對於感染，發展過程是一連串事件的鏈接而成。<ref>[http://www.infectioncycle.com/ Infection Cycle] – Retrieved on 2010-01-21 {{webarchive |url=https://web.archive.org/web/20140517095153/http://www.infectioncycle.com/ |date=May 17, 2014 }}</ref> 所涉及的步驟是 - 傳染原，帶病原宿主，進入易受感染宿主，再傳播給新宿主。每個鏈接會按照時間順序排列而完成感染。醫事人員能夠了解這些步驟，將有助於鎖定感染，然後在第一時間阻止它往下一步發展。<ref>[http://science.education.nih.gov/supplements/nih1/diseases/guide/understanding1.htm Understanding Infectious Diseases] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20090924155111/https://science.education.nih.gov/supplements/nih1/diseases/guide/understanding1.htm |date=2009-09-24 }} Science.Education.Nih.Gov article – Retrieved on 2010-01-21</ref>
===移生===
[[File:Dit del peu gros infectat.jpg|thumb|{{link-en|趾甲內生症|ingrown nail}}，有黃色的膿，以及發炎（趾甲周圍紅腫）。]]
當病原體成功進入人體，生長並繁殖時，感染即算開始。這稱為移生（colonization）。大多數人不容易受到感染。那些免疫系統受損，或減弱的人，就成了慢性或持續感染的[[易感個體]]。免疫系統受到抑制的人特別容易受到機會性感染的侵害。病原體通過宿主的{{link-en|宿主-病原體界面|host-pathogen interaction}}進入身體，這些界面通常就是[[口腔]]，鼻子，眼睛，生殖器，肛門等[[身體孔口]]上的[[粘膜]]，或者微生物也可透過開放性傷口進入身體。有少數微生物可以在進入人體的初始位置上生長，但許多生物會遷移，並在不同器官中引起器官系統的感染。一些病原體在宿主細胞內（[[胞內]]）生長，而其他病原體則在體液中自由生長。
傷口移生是指傷口之內尚未有複製的微生物，而在感染的傷口上，則存在複製中的微生物，傷口的組織受到損傷。<ref>{{Cite journal|last1=Negut|first1=Irina|last2=Grumezescu|first2=Valentina|last3=Grumezescu|first3=Alexandru Mihai|date=2018-09-18|title=Treatment Strategies for Infected Wounds|journal=Molecules |volume=23|issue=9|doi=10.3390/molecules23092392|issn=1420-3049|pmc=6225154|pmid=30231567|page=2392}}</ref> 所有[[多細胞生物]]都在某種程度上被外來生物所移生，其中絕大多數與宿主之間存有[[互利共生]]的關係，或者是[[偏利共生]]的關係。前者的一個例子是[[厭氧生物]]菌種，它們定居在哺乳動物的[[大腸]]中，後者的例子是人類皮膚上存在各種[[葡萄球菌屬]]菌種。這些移生都不被認為是感染。感染和移生之間的差異通常僅是環境不同的問題。在特定條件下，非致病性細菌會成為致病細菌，即使是最具病毒性的微生物也需要在某些環境之下才會導致嚴重的感染。有些移生細菌，例如''{{link-en|棒狀桿菌屬|Corynebacterium}}''，和''[[草綠色鏈球菌]]''，可預防病原菌的粘附和移生，因此與宿主具有[[共生]]關係，可防止宿主的感染並加速傷口癒合。
[[File:Pathogenic Infection.png|thumb|<ref>{{Cite journal|last1=Duerkop|first1=Breck A|last2=Hooper|first2=Lora V|date=2013-07-01|title=Resident viruses and their interactions with the immune system|journal=Nature Immunology|language=en|volume=14|issue=7|pages=654–59|doi=10.1038/ni.2614|pmc=3760236|pmid=23778792}}</ref><ref>{{Cite web|url=https://www.studyblue.com/notes/note/n/bacterial-pathogenesis/deck/11094651|title=Bacterial Pathogenesis at Washington University |location= St. Louis|website=StudyBlue|access-date=2016-12-02}}</ref><ref>{{Cite web|url=http://www.lifeextension.com/magazine/2014/6/the-dangers-of-using-antibiotics-to-prevent-urinary-tract-infections/page-01?p=1|title=Print Friendly|website=www.lifeextension.com|access-date=2016-12-02|archive-url=https://web.archive.org/web/20161202235200/http://www.lifeextension.com/magazine/2014/6/the-dangers-of-using-antibiotics-to-prevent-urinary-tract-infections/page-01?p=1|archive-date=2016-12-02|url-status=dead}}</ref> 本圖顯示病原體感染的步驟。]]
宿主受到病原體入侵之後，能產生最終結果的變數包括：
*病原體進入身體的途徑，和通往宿主體內可逗留的區域
*特定微生物的既有病毒性
*初始入侵微生物的數量
*被移生的宿主本身的免疫狀態
例如，幾種葡萄球菌對皮膚無害，但是當它們進入{{link-en|無菌|Asepsis}}的空間後，例如說在[[關節囊]]或[[腹膜]]中，就會大肆繁殖，並造成傷害。
有趣的事是，在近幾十年來，利用[[氣相色譜法-質譜聯用]]，[[16S 核糖體RNA]]分析，[[組學]]和其他先進技術所得的結果，越來越清楚的顯示，就在人類認為幾乎無菌的環境中，微生物的移生也十分普遍。由於細菌移生算是正常，因此很難知道哪些慢性傷口可歸類為已受感染，存有多少惡化的風險。雖然人們在臨床上已處理過大量傷口感染，但可用來評估症狀和跡象的，具有有良好品質的數據，仍然有限。在《[[美國醫學會]]》雜誌中的“理性臨床檢查叢書（Rational Clinical Examination Series）”中，對慢性傷口做審查後，把患者身上疼痛的加劇程度予以量化，作為重要的感染指標。<ref>{{cite journal |vauthors=Reddy M, Gill SS, Wu W | date = Feb 2012 | title = Does this patient have an infection of a chronic wound? | url = | journal = JAMA | volume = 307 | issue = 6| pages = 605–11 | doi = 10.1001/jama.2012.98 | pmid = 22318282 |display-authors=etal}}</ref>這份審查顯示，最有用的發現是疼痛程度的增加[可能性比（likelihood ratio）範圍在 11–20]，則顯示感染的可能性增強，但是沒有疼痛（負面可能性比範圍在 0.64–0.88）也不能排除患者是受到感染（總結可能性比範圍在 0.64–0.88）。
===疾病===
疾病的發生，是宿主的免疫機制受損，接著病原體對宿主造成損害。微生物可利用釋放多種[[毒素]]或破壞性的[[酶]]來造成組織損傷。例如，[[破傷風梭菌]]會釋放讓肌肉麻痺的毒素，而[[葡萄球菌屬]]會釋放產生[[休克]]和[[敗血症]]的毒素。並非所有傳染原都會引發宿主生病​​。例如，少於 5％的[[脊髓灰質炎|小兒麻痺症]]感染者會發病。<ref>http://www.immunize.org/catg.d/p4215.pdf</ref> 另一方面，某些傳染源具有高病毒性。譬如引起[[牛海綿狀腦病|狂牛症]]和[[克雅二氏病]]的朊毒體，會讓所有被感染的動物，以及人類死亡。
持續性感染的發生是因為初始感染後，身體內病原體無法被清除乾淨。持續性感染的特徵是病原體的持續存在，通常是潛伏性感染狀態，偶爾會復發成為活躍性感染。有些病毒可以透過感染人體的不同細胞來維持持續性感染。曾經進入人體的某些病毒會永遠存在。典型的例子是皰疹病毒，它隱藏在神經中，並在特定情況出現時重新被激活。
持續性感染每年在全球造成數百萬人死亡。<ref>[http://www.persistentinfection.net/ Chronic Infection Information] Retrieved on 2010-01-14 {{webarchive |url=https://web.archive.org/web/20150722065612/http://www.persistentinfection.net/ |date=July 22, 2015 }}</ref> 在許多落後的國家中，寄生蟲引起的慢性感染，導致甚高的發病率和死亡率。
===傳播===
主要文章：[[傳播途徑]]


[[File:CulexNil.jpg|thumb|220px|left|熱帶家蚊 {{link-en|Culex quinquefasciatus|Culex quinquefasciatus}}是一種疾病媒介，會傳播[[西尼羅河熱]]，{{link-en|禽類瘧疾|avian malaria}}等疾病。]]
== 參見 ==
感染性微生物為了生存，並引起其他宿主的感染，它們（或其後代）必須離開現有的宿主，到其他地方引起感染。各種潛在的感染傳播途徑有：
{{Portal|医学}}
* [[感染症]]/[[傳染病]]
*'''飛沫傳播'''，也稱為呼吸道感染途徑，由此引起的疾病感染可稱為[[空氣傳播疾病]]。如果感染者咳嗽，或對者他人打噴嚏，包含在溫暖潮濕的小水滴中的微生物就會通過對方的鼻子，嘴巴或眼睛表面進入人體。
* [[院內感染]]
*'''[[糞口途徑]]傳播'''，食物或水受到污染（由於人們在烹調食物前不洗手，或未經處理的污水滲入到飲用水中），而攝取這些食物和飲水的人受到感染。常見的糞口途徑傳播病原體包括，''[[霍亂弧菌]]''，''{{link-en|蘭氏賈第鞭毛蟲|Giardia}}屬''，''[[輪狀病毒]]''，''[[溶組織內阿米巴]]''，''[[大腸桿菌]]''，和[[絛蟲綱|絛蟲]]。<ref>[http://www.fungusfocus.com/html/flukes.htm Intestinal Parasites and Infection] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20101028013944/http://fungusfocus.com/html/flukes.htm |date=2010-10-28 }} fungusfocus.com – Retrieved on 2010-01-21</ref> 這些病原體大多數會引起[[腸胃炎]]。
* [[人畜共通病]]
*'''性行為傳播'''，由此產生的疾病稱為{{link-en|性行為感染疾病|sexually transmitted disease}}。
* [[自體感染]]
*'''口腔傳播'''：透過直接的口腔接觸（例如接吻）或間接接觸（例如共享水杯或香煙）而發生感染。
*'''直接接觸傳播'''，某些直接接觸傳播的疾病包括[[足癬|香港腳]]，[[膿痂疹]]，和[[疣]]。
*'''載體傳播'''，經由非生物載體（食物，水，土壤）傳播。<ref>{{Cite web|url=http://www.microbiologybook.org/Infectious%20Disease/Infectious%20Disease%20Introduction.htm|title=Clinical Infectious Disease – Introduction|website=www.microbiologybook.org|access-date=2017-04-19}}</ref>
*'''{{link-en|垂直感染|vertically transmitted infection}}'''，在[[妊娠|懷孕]]或[[分娩]]時直接從母親傳播到[[胚胎]]，[[胎兒]]，或者嬰兒。當母親在懷孕期間感染到{{link-en|妊娠期併發症|Intercurrent disease in pregnancy}}時，就會發生這種情況。
*'''[[醫源病|醫源性]]傳播'''，歸因於在執行醫療程序時，例如[[注射]]或[[器官移植]]，受到感染的材料，器官所傳播。
*'''[[載體 (生物學)|媒介]]傳播'''，生物媒介本身不會引起疾病，但它們會將病原體從一個宿主傳播到另一個宿主，而傳播感染。<ref>[http://www.metapathogen.com/ Pathogens and vectors]. ''MetaPathogen.com''.</ref>
病毒性相對於可傳播性之間的關係很複雜。如果疾病有迅速的致命性，宿主可能會在病原體傳給另一宿主之前就已死亡。
==診斷==
診斷感染病，牽涉到用直接或間接的方式去識別感染原。大多數輕微的感染病，例如疣，皮膚[[膿瘍]]，呼吸系統感染，和腹瀉，都是憑臨床症狀來做診斷，並且是在並不知道實際病因的情況下就做治療。判斷病因，會根據患者接觸到特定的病原，社區中存有某種疾病微生物，或者其他流行病學上的可能。雖說只要努力，通常就可找出感染原，鑑定確實病因是有好處，但是通常成本會很高，如果不需用特定的治療方法，或致病原因明顯，或者患者病情不算嚴重，就不需如此做。
對感染病的診斷，都由患者的[[病史]]和實際檢查開始。更詳細的鑑定方法則涉及從患者採檢，培養出的傳染原。通過顯微鏡檢查微生物的特徵，檢測病原體產生的物質，以及利用[[基因型]]來直接鑑定。其他技術（例如[[X射線]]，[[X射線電腦斷層掃描|電腦斷層掃描]]，[[正子斷層照影]]，或者 [[核磁共振]]）則用於因為感染原生長引起的內部異常，所產生的圖像。這種圖像方式可有效檢測出例如朊毒體引起的骨骼[[膿瘍]]或[[傳染性海綿狀腦病]]等病症。
===症狀診斷===
人在受到感染後，可憑症狀來判斷，但仍需要其他診斷技術來輔助確認。一些體徵具有的特徵，是某些疾病所獨有，叫做{{link-en|特異病徵|pathognomonic}}，但此並非常見。所有感染並不一定有症狀。<ref name=Sternak>{{cite journal|last1=Ljubin-Sternak|first1=Suncanica|last2=Mestrovic|first2=Tomislav|title=Review: Clamydia trachonmatis and Genital Mycoplasmias: Pathogens with an Impact on Human Reproductive Health|journal=Journal of Pathogens|page=3 |date=2014|volume=2014|issue=183167|doi=10.1155/2014/183167|pmid=25614838|pmc=4295611}}</ref>
在兒童中，出現[[發紺]]，呼吸急促，末梢血液循環不良，或[[紫癜]]，則有嚴重感染的風險會增加 5倍以上。<ref name=Lancet10>{{cite journal |vauthors=Van den Bruel A, Haj-Hassan T, Thompson M, Buntinx F, Mant D | title = Diagnostic value of clinical features at presentation to identify serious infection in children in developed countries: a systematic review | journal = Lancet | volume = 375 | issue = 9717 | pages = 834–45 | date = March 2010 | pmid = 20132979 | doi = 10.1016/S0140-6736(09)62000-6 | url = }}</ref> 其他重要參考指標包括，父母的擔憂，臨床直覺，和患者體溫高過攝氏 40度。<ref name=Lancet10/>
===微生物培養診斷===
[[File:K pneumoniae M morganii providencia styphimuriuma.JPG|thumb|200px|四個裝載有營養瓊脂的培養皿，培養革蘭氏陰性菌菌落。]]
微生物培養是用於感染病診斷的主要工具。在微生物培養物時，會使用到[[培養基]]。從患者的組織或體液中取得樣本，放在培養基中，看能否發現傳染原。大多數病原細菌很容易在[[營養瓊脂]]上生長，營養瓊脂是一種固體培養基，可提供細菌生長所需的碳水化合物和蛋白質，以及充足的水份。單個細菌可在培養皿表面上長成可見的小丘，稱為[[菌落]]，與其他菌落分離或融合在一起，形成“菌苔”。細菌的種類，基因組成（[[分型]]），以及生長環境，會讓菌落有其特殊的大小，顏色，形狀，和組成。
為幫助識別病原體，會有其他成分添加到培養皿中。培養皿中可能含有只允許某些細菌生長的物質，或因為某些特定細菌的生長而改變顏色的物質。此類的培養方式常見於臨床鑑定用。培養也可以用來鑑定[[病毒]]：在這種情況下，培養基是在培養物中生長的細胞，病毒可以感染這些細胞，然後改變，或殺死細胞。在做病毒鑑定時，因病毒生長而死亡的細胞區域，被稱為“{{link-en|噬菌斑|viral plaque}}”。[[真核生物]]也可以培養，是用來鑑定這類特定病原體的方法。
在缺乏合適的培養皿技術的情況下，某些微生物需要在活體動物中培養。雖然[[血清學]]和顯微鏡技術讓運用活體動物培養成為不必要，但細菌（例如[[痲瘋桿菌]]和{{link-en|梅毒螺旋體|Treponema pallidum}}）必須在活體動物中培養。在培養物或動物體內生長之外，也有替代的方法來鑑定病毒。有些病毒可在{{link-en|受精|embryonated}}卵中培養。另一種有用的鑑定方法是{{link-en|異種接種診斷法|Xenodiagnosis}}，使用載體來培養傳染原。[[恰加斯病]]異種接種診斷法是個重要的例子，因為不容易直接證明病原體{{link-en|克魯氏錐蟲|Trypanosoma cruzi}}在患者體內存在，碰到這種情況，可用異種接種診斷法 - 從疑似受感染者取得的{{link-en|血粉|blood meal}}餵食給未受感染的{{link-en|接吻蟲|Triatominae}} （克魯氏錐蟲的載體），然後檢查接吻蟲的腸道，看是否有克魯氏錐蟲的存在。
===顯微鏡學診斷===
診斷感染病的另一個重要工具是顯微鏡。實際上，上面討論的所有培養，都會在某個時點，利用到顯微鏡檢查，來確定感染原。顯微鏡檢查可以用簡單型的，例如複合[[光學顯微鏡]]，也可以使用複雜型的，像[[電子顯微鏡]]。從患者那裡取得的樣本可以直接在光學顯微鏡下觀察，迅速取得結果。
顯微鏡還可與[[生物化學]][[染色 (生物學)|染色]]技術結合使用，在與具有[[抗體]]的技術結合使用時，更有特色。例如，使用具有人造[[螢光]]的抗體（有螢光標記的抗體）和病原體上存在的特定[[抗原]]結合，然後使用[[熒光顯微鏡|螢光顯微鏡]]檢測，看臨床樣品或培養的細胞內有無螢光標記的抗體。這種技術在病毒性疾病的診斷中特別有用，光學顯微鏡則無法用來直接識別病毒。
其他顯微鏡的使用方式也可識別傳染原。由於帶負電荷的細胞分子與具有的正電荷的染料會互相吸引，幾乎所有細胞都可被[[染料]]染色。細胞通常在顯微鏡下是透明的，使用染料可以增加細胞與背景的對比度。用如[[吉姆薩染液]]或[[結晶紫]]的染料對細胞作染色，可讓[[顯微鏡學]]技術人員描述細胞大小，形狀，內部和外部組成，以及與其他細胞的相互關係。細菌對不同染色程序的反應也被用在微生物的[[生物分類學|生物分類]]。[[革蘭氏染色]]和{{link-en|耐酸性染色|acid-fast stain}}兩種，是用在細菌分類和診斷疾病的標準方法。[[革蘭氏染色]]可以偵測到[[厚壁菌門]]和[[放線菌門]]菌群，這些菌群包含許多重要的人類病原體。耐酸性染色程序可辨識出放線菌門[[屬]]的''[[分枝桿菌屬]]''和''{{link-en|諾卡氏菌屬|Nocardia}}''的存在。
===生化檢驗診斷===
用於鑑定感染原的生化檢驗方式，包括檢測特定傳染原[[代謝]]或[[酶]]產物的存在。由於細菌會用其[[屬]]和[[物種]]的特定模式來對[[糖類|碳水化合物]]做發酵，因此可透過檢測[[發酵]]產物而找出細菌。當細菌在特定的液體或固體介質中生長時，通常可以檢測到[[酸]]，[[酒精]]，和[[氣體]]。
從受感染的組織中分離出[[酶]]，也是診斷出感染的一種方式。例如，人體既不能製造[[RNA複製酶]]，也不能產生[[逆轉錄酶]]，那麼有這些酶就是有特定類型的病毒感染發生。病毒蛋白[[血球凝集素]]將[[紅血球]]結合，成為一種可檢測的基質，在生化檢驗中，也表示有病毒感染。嚴格說來，血球凝集素不是''酶''，也沒有代謝的功能。
[[血清學]]檢測方法是高度靈敏，特定的，通常可非常快速檢測出微生物。這些測試是利用抗體特異性結合抗原的能力。抗原通常是由感染原產生的蛋白質或碳水化合物，與抗體結合。然後，這種結合將觸發一系列事件，這些事件可以通過各種方式清楚顯示，就看用的是哪種測試方法。例如，“[[鏈球菌性咽炎]]”，用棉籤從患者的喉嚨中取得樣本，檢測出"{{link-en|化膿性鏈球菌|S. pyogenes}}"的抗原時，很快就確診。血清學檢測通常是鑑定的首選方法，但是檢測的成本很高，並且檢測使用的試劑通常需要冷藏。有些血清學方法非常昂貴，但有些經常使用的，例如“ [[鏈球菌快速檢測]]”，就很便宜。<ref name=Sherris/>
複雜的血清學檢驗已經發展成為所謂的{{link-en|免疫測定法|Immunoassay}}。免疫測定法可以使用基本的抗體-抗原結合時所產生[[電磁學]]或[[粒子輻射]]信號，可利用儀器檢測到。不明的信號可以與已有標準作比較，從而可對特定抗原做量化。為了幫助診斷感染病，免疫測定法可以檢測或測量來自感染原的抗原，或被感染生物體對外來物質產生的蛋白質抗原。例如，免疫測定法 A 可以檢測來自病毒顆粒的表面蛋白的存在。另一方面，免疫測定法 B 可以檢測或測量由生物體免疫系統產生的抗體，這些抗體可以中和並破壞病毒。
這種儀器在讀取抗體-抗原結合時，相關的次級反應所產生出來的極小信號。儀器可以對採樣，[[反應物]]的使用，反應的時間，信號的檢測，計算結果這些方面做控制，並做數據管理，以產生具有[[成本效益]]的自動化感染病檢驗流程。
===聚合酶連鎖反應診斷===
由於好幾樣原因，[[聚合酶連鎖反應]]診斷技術可能會在不久後成為處處可見的診斷標準。首先，感染原的目錄已經發展到幾乎包括所有人類重要的感染原。其次，感染源必須在人體內生長才會引起疾病。本質上，它必須擴增自己的[[核酸]]才能致病。感染組織中核酸的擴增，提供利用聚合酶連鎖反應檢測的機會。第三，導引聚合酶連鎖反應的基本工具，[[引物]]，就是從感染原的[[基因組]]衍生而來，那些基因組，長久而言，終究會被人們所解密。
因此，當前已經具備能迅速且具體的檢測感染原的能力。使用聚合酶連鎖反應方法，作為標準用法的唯一障礙是在成本，但也並非無法克服。某些疾病的診斷,例如一些{{link-en|梭菌病屬|clostridial}}疾病（[[破傷風]]和[[肉毒桿菌中毒]]）。就無法透過聚合酶連鎖反應來達成。這些疾病是由少量會產生極強[[神經毒素]]的細菌所引起的生化中毒。這類感染原不會顯著的增殖，因此聚合酶連鎖反應方法檢測的能力在此受到限制。
===宏基因組學測序診斷===
鑑於造成身體虛弱和威脅生命的細菌，病毒和其他病原體種類繁多，因此擁有快速的確定感染原因的能力變得很重要，但不一定容易達成。例如，雖然使用最先進的臨床實驗室方法做測試，但仍有超過一半的[[腦炎]]沒被診斷出來。[[宏基因組學]]目前正被用在臨床研究，有望成為一種靈敏，而且能迅速診斷出感染的單一全能方法。這種測試與當前的聚合酶連鎖反應測試相似；但是，利用擴增的遺傳材料，而不是使用特定感染因子的[[引物]]來做測試，不容易產生誤差。在利用擴增遺傳材料之後，再使用包含數千個生物和病毒基因組的大型數據庫，來做更新一代的[[測序]]和[[序列比對]]，結果會更準確。
當患者有[[免疫缺陷]]時，使用宏基因組測序來做診斷特別有用。有廣泛的傳染原會對有免疫能力缺陷的人造成嚴重傷害，因此臨床篩檢更須廣泛的運用。另外，患者症狀通常是不一定是典型，易查覺的，這會讓憑症狀來檢測的臨床診斷更加困難。第三，依賴檢測抗體的診斷方法不容易成功。因此，對於病原體進行廣泛，更靈敏的檢測，以檢測出感染性物質（而非抗體）的需求就更殷切。
===測試結果指證===
診斷能協助制定有效的治療，或採取預防措施，但是在發展出療程或者預防措施之前，增進對疾病進程的了解，會產生對傳染原特定診斷的{{link-en|指證|Indication (medicine)}}。例如，在 1980年代初期，在利用[[齊多夫定]]治療[[愛滋病]]之前，利用密切監測疾病的進程，檢驗患者的血液樣本成分，縱然所得結果無法為患者提供任何進一步的治療。但是對於愛滋病出現在特定社群中的研究，在某種程度上發展出病毒傳播途徑的[[假說]]。了解疾病的傳播方式，就可以把資源投往風險最大的社群，以減少新的感染病例。
針對愛滋病的特異性血清學診斷鑑定，以及後來的[[基因型]]，或分子鑑定，讓人們能夠建立關於病毒的[[時間]]和[[地理學]]起源的假說，以及其他甚多的假說。<ref name=Sherris/> 利用分子診斷的發展，讓醫生和研究人員能夠監測[[抗反轉錄病毒藥物]]的治療成效。現在，分子診斷法通常早在疾病發作之前，就已用於一般健康人群中鑑定是否有愛滋病毒的感染，並已證明是有人群，他們對病毒感染是具有遺傳的抗性。因此，雖然目前仍然無法根治愛滋病，但對於感染者做鑑定病毒和監測他們血液中的病毒水準，仍對患者本身以及社區，都具有巨大的醫療和預測的效益。
==預防==
主要文章：[[公共衛生]]與{{link-en|感染預防與控制|Infection prevention and control}}

[[File:OCD handwash.jpg|thumb|right|洗手，可以有效防止感染性疾病的傳播。<ref name=handhygiene>{{cite journal|vauthors=Bloomfield SF, Aiello AE, Cookson B, O'Boyle C, Larson EL|url=http://www.ajicjournal.org/article/S0196-6553(07)00595-0/fulltext|title=The effectiveness of hand hygiene procedures including hand-washing and alcohol-based hand sanitizers in reducing the risks of infections in home and community settings|journal=American Journal of Infection Control|year=2007|volume=35|issue=10|pages=S27–S64|doi=10.1016/j.ajic.2007.07.001|pmc=7115270}}</ref>]]
洗手，穿著防護衣，戴口罩等，可以防止人與人之間的感染。在 19世紀後期，[[無菌]]技術被引入醫學和外科手術中，大幅降低因手術所引起的感染發生率。經常[[洗手]]仍然是最重要的防止感染擴散預防手段。<ref>{{cite web|url=http://science.education.nih.gov/supplements/nih1/diseases/guide/fig4-longdesc.htm|title="Generalized Infectious Cycle" Diagram Illustration|website=science.education.nih.gov|accessdate=2010-01-21|archiveurl=https://web.archive.org/web/20090924155114/https://science.education.nih.gov/supplements/nih1/diseases/guide/fig4-longdesc.htm|archivedate=2009-09-24}}</ref> 其他的預防措施，例如避免使用違禁藥物，使用[[避孕套]]，戴手套，以及保持均衡飲食，和定期運動的健康生活方式。熟食，和避免吃長期曝露在外的食物也很重要。
用於防止感染傳播的{{link-en|抗菌物|Antimicrobial}}包括：
*[[消毒藥水]]，應用於活體[[組織 (生物學)|組織]]/[[皮膚]]
*[[消毒]]劑，可消滅非生物體上的微生物。
*[[抗細菌藥|抗生素]]，在做感染預防時被稱為[[預防醫學|預防]]劑。但是，長期使用抗生素會產生細菌的[[耐藥性]]。人類無法對抗生素產生免疫力，但細菌卻可以。因此，避免非必要性的長時間使用抗生素，有助於防止細菌形成耐藥性的突變。
要預防或減慢感染病傳播的方法之一，是去了解各種疾病的不同特徵。<ref name=Watts>{{cite book |author=Watts, Duncan |title=Six degrees: the science of a connected age |publisher=William Heinemann |location=London |year=2003 |pages= |isbn=978-0-393-04142-2 |url-access=registration |url=https://archive.org/details/sixdegrees00dunc }}</ref> 應評估的一些關鍵特徵包括病毒性，患者的活動範圍，以及感染性。例如，[[伊波拉出血熱|伊波拉病毒]]極快的讓受害者病倒，並很快死亡。結果，受害者沒機會遠離他們最初的感染地點。<ref>{{cite book |author=Preston, Richard |title=The hot zone |publisher=Anchor Books |location=Garden City, N.Y. |year=1995 |pages= |isbn=978-0-385-49522-6 }}</ref>
而且，這種病毒必須通過皮膚的病變，或者諸如眼睛的可滲透膜傳播。伊波拉病毒的初始階段感染性不高，受害者僅發生內部出血。由於前述特徵，伊波拉病毒的傳播雖然非常迅速，但是通常只發生在相對狹小的地理範圍之內。相反的，愛滋病病毒透過攻擊受害者的免疫系統，緩慢地殺死受害者。<ref name=Sherris>{{cite book |veditors=Ryan KJ, Ray CG | title = Sherris Medical Microbiology | edition = 4th | publisher = McGraw Hill | year = 2004 | isbn = 978-0-8385-8529-0 }}</ref> 結果，它的許多受害者甚至在沒有意識到自己罹患這種疾病之前就將病毒傳播給其他人。而且，愛滋病相對較低的病毒性讓受害者能夠長途跋涉，增加成為[[流行病]]的機率。
降低感染病傳播率的另一種有效方法是，認識到[[小世界網路]]的影響。<ref name=Watts/> 在流行病中，感染者的地理集點或群體之內通常互動頻繁，而且和離散集點內的易感個體有其他互動。雖然離散集點之間的互動不強，但疾病仍可以跳傳給離散集點中易感的人。因此，如果把受感染集點內個人間的互動消除，小世界網絡中的感染率就可降低。但是，如果把重點放在防止集點間的疾病跳傳，則可大幅降低感染率。在患有愛滋病吸毒者密度高的地區，使用換新針頭的措施，是成功實施這種降低傳染措施的一個示例。 [完整來源請求] 另一個例子是在 2001年英國[[諾森伯蘭郡]]，對鄰近農場中的潛在易感牲畜撲殺或作疫苗接種，以防止[[口蹄疫]]病毒的傳播。<ref>{{cite journal |vauthors=Ferguson NM, Donnelly CA, Anderson RM | title = The foot-and-mouth epidemic in Great Britain: pattern of spread and impact of interventions | journal = Science | volume = 292 | issue = 5519 | pages = 1155–60 | date = May 2001 | pmid = 11303090 | doi = 10.1126/science.1061020 | bibcode = 2001Sci...292.1155F | url = https://semanticscholar.org/paper/d996865b2e6ac1ee4d5931ce0ca6d43d84879c9b }}</ref>
防止[[載體 (生物學)|病媒]]傳播病原體的一般做法是做[[病蟲害防治]]。
如果僅僅是懷疑有感染，可以做個體[[隔離檢疫]]，直到[[疾病潛伏期]]過去，讓疾病發生，或者證明個體仍然健康無恙為止。團體可能要做檢疫隔離，如果是發生在社區，就會劃定{{link-en|防疫線|cordon sanitaire}}，限制社區居民的行動，以防止感染擴散到社區之外，或者用{{link-en|保護性隔離|protective sequestration}}，防止在社區內傳播。公共衛生當局可以實施其他形式的[[保持社交距離]]，例如關閉學校，以控制，不讓流行病形成。
===免疫===
[[File:Mallon-Mary 01.jpg|thumb|[[瑪莉·馬龍]]（又稱傷寒瑪麗），是[[傷寒]]病菌的[[帶原者]]。在她擔任廚子的期間，把傷寒傳染給 53人，其中 3人因而過世。]]
導致感染的大多數病原體不會導致宿主死亡，並且在疾病痊癒後，侵害性生物最終會被清除。<ref name= Baron/> 這個過程需要[[免疫系統]]來殺死病原體，或者利用[[疫苗接種]]來鈍化病原體的作用。對感染性疾病的特定性[[免疫]]可以透過[[抗體]]和/或[[T細胞]]介導而取得。這兩個介導的免疫力可表現為：
*對病原體的直接影響，例如抗體引發的[[補體系統]]依賴性溶菌作用，[[調理素]]作用，[[吞噬作用]]，和殺滅作用，對某些細菌有用，
*中和病毒，讓這些生物無法進入細胞，
*或者是讓 T細胞把被微生物寄生的細胞殺死。
免疫系統對微生物的反應，通常會引起諸如[[發熱|發高燒]]和[[炎症|發炎]]等症狀，有時候這些反應比微生物引起的損害更具破壞性。<ref name=Sherris/>
對疾病的抵抗力（免疫力）可透過幾種方式獲得 - 疾病痊癒後，成為病原體的[[帶原者]]，通過攜帶具有相似結構的生物（{{link-en|交叉反應|Cross-reactivity}}），或者接種[[疫苗]]。人類目前對主要病原體的保護性抗原，和特定獲得宿主免疫因子的知識，所了解的程度，比對[[機會性感染|機會性]]病原體的更為完整。還有一種[[群體免疫]]的現象 - 當足夠多的人口已經具有對某些感染的免疫力時，就可以為那些本來就很脆弱的人們提供一定程度的保護。
當宿主遇到病原體時，對感染病的免疫抵抗力就需要達到臨界高度的抗原特異性抗體和/或 T細胞來提供。雖然某些人很少或根本沒有接觸過某些病原體的表面[[多醣]]，但他們仍會產生針對這些病原體表面多醣的天然[[血清]]抗體，這些天然抗體可提供成年人特異性保護，這種{{link-en|被動免疫|Passive immunity}}會傳播給新生兒。
===宿主遺傳因素===
受到特定感染原所感染的生物稱為宿主。宿主身上的病原體處於成熟或性活躍階段的，稱為最終宿主。[[中間宿主]]體內的病原體是在在幼蟲階段。宿主可以是任何活著的東西，並讓病原體做無性和有性繁殖。<ref>{{cite journal|vauthors=Barreto ML, Teixeira MG, Carmo EH|year=2006|title=Infectious diseases epidemiology|journal=Journal of Epidemiology and Community Health|volume=60|issue=3|pages=192–95|doi=10.1136/jech.2003.011593|pmc=2465549|pmid=16476746}}</ref> 患者體內病原體的清除，無論是經過治療的，還是人體自發的，都會受到各個患者自身遺傳變異的影響。
例如，對於用{{link-en|聚乙二醇化干擾素-α-2a|Pegylated interferon alfa-2a}}，或者{{link-en|聚乙二醇化干擾素-α-2b|Pegylated interferon-alpha-2b}}（前者商標名為 Pegasys，後者商標名 PegIntron）與[[利巴韋林]]合併治療的基因型1型 C 型肝炎，已證明人類 IL28B 基因附近的遺傳[[多態性]]{{link-en|干擾素λ3編碼|interferon lambda 3}}，會在治療時對病毒的清除率有顯著的差異。最初在《[[自然(期刊)|自然]]雜誌》上發表的這一發現<ref>{{cite journal |vauthors=Ge D, Fellay J, Thompson AJ, Simon JS, Shianna KV, Urban TJ, Heinzen EL, Qiu P, Bertelsen AH, Muir AJ, Sulkowski M, McHutchison JG, Goldstein DB | title = Genetic variation in IL28B predicts hepatitis C treatment-induced viral clearance | journal = Nature | volume = 461 | issue = 7262 | pages = 399–401 | year = 2009 | pmid = 19684573 | doi = 10.1038/nature08309 | bibcode = 2009Natur.461..399G }}</ref> 顯示，攜帶 IL28B 基因附近某些遺傳變異[[等位基因]]的 1 型 C 型肝炎患者，比其他人更可能達成持續病毒學抑制反應。後來《自然雜誌》的報導<ref>{{cite journal |vauthors=Thomas DL, Thio CL, Martin MP, Qi Y, Ge D, O'Huigin C, Kidd J, Kidd K, Khakoo SI, Alexander G, Goedert JJ, Kirk GD, Donfield SM, Rosen HR, Tobler LH, Busch MP, McHutchison JG, Goldstein DB, Carrington M | title = Genetic variation in IL28B and spontaneous clearance of hepatitis C virus | journal = Nature | volume = 461 | issue = 7265 | pages = 798–801 | year = 2009 | pmid = 19759533 | pmc = 3172006 | doi = 10.1038/nature08463 | bibcode = 2009Natur.461..798T }}</ref> 證明，相同的遺傳變異也與基因型 1 型 C 型肝炎病毒的自然清除率有關。
==治療==
當感染攻擊身體時，抗感染藥物可用來作感染抑制。根據所針對的感染原類型，市面已有幾種廣泛使用的抗感染藥物 - 包括抗菌劑（抗生素；包括抗結核藥物），[[抗病毒藥物]]，[[抗真菌藥]]，和{{link-en|抗寄生蟲藥|antiparasitic}}（包括{{link-en|抗原蟲藥|antiprotozoal}}，和{{link-en|驅蟲藥|antihelminthic}}）。根據感染的嚴重程度和類型，抗生素可用口服或注射方式，也可以做[[外用藥物]]使用。嚴重的腦部感染通常用[[靜脈注射]]治療。有時，如果患者對一種抗生素有抗藥性，就會同時使用多種抗生素。抗生素僅對細菌有作用，對病毒則無。抗生素的作用是可抑制細菌繁殖，或者殺死細菌。藥物中最常見的抗生素類別包括[[青黴素]]，[[頭孢菌素]]，[[氨基糖苷類抗生素]]，[[大環內酯]]類，{{link-en|喹諾酮類抗生素|quinolone antibiotic}}和[[四環素]]類。[來源請求]
並非所有感染都要治療，有許多{{link-en|自限性|Self-limiting (biology)}}感染，治療可所帶來的副作用會多過好處。良好的{{link-en|抗菌管理| Antimicrobial stewardship}}的概念是，醫護人員應在最短的時間內使用最有效的抗菌藥物，並僅在已知或高度推斷病原體會對投入藥物有反應時才施藥。<ref>{{cite journal|last1=O'Brien|first1=Deirdre J.|last2=Gould|first2=Ian M.|title=Maximizing the impact of antimicrobial stewardship|journal=Current Opinion in Infectious Diseases|date=August 2013|volume=26|issue=4|pages=352–58|doi=10.1097/QCO.0b013e3283631046|pmid=23806898}}</ref>
==流行病學==
[[File:Infectious and parasitic diseases world map-Deaths per million persons-WHO2012.svg|upright=1.3|thumb|2012年，世界各地因為感染性疾病及[[寄生蟲病]]導致每百萬人的死亡人數{{refbegin|3}}{{legend|#ffff20|28-81}}{{legend|#ffe820|82-114}}{{legend|#ffd820|115-171}}{{legend|#ffc020|172-212}}{{legend|#ffa020|213-283}}{{legend|#ff9a20|284-516}}{{legend|#f08015|517-1,193}}{{legend|#e06815|1,194-2,476}}{{legend|#d85010|2,477-3,954}}{{legend|#d02010|3,955-6812}}{{refend}}]]
[[File:Infectious and parasitic diseases world map - DALY - WHO2004.svg|thumb|upright=1.3|2004年，全世界各地因為感染性疾病及寄生蟲病所導致的[[失能調整生命年]]。<ref>{{cite web |url=http://www.who.int/entity/healthinfo/global_burden_disease/gbddeathdalycountryestimates2004.xls |title=Age-standardized DALYs per 100,000 by cause, and Member State, 2004 |author=World Health Organization |authorlink=World Health Organization |date=February 2009}}
</ref>{{refbegin|2}}
{{legend|#b3b3b3|no data}}
{{legend|#ffff65|≤250}}
{{legend|#fff200|250–500}}
{{legend|#ffdc00|500–1000}}
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{{legend|#ff2c00|25,000–50,000}}
{{legend|#cb0000|≥50,000}}
{{refend}}]]
在 2010年，估計全球約有 1,000萬人因感染病而死亡。<ref>{{cite news |url=http://www.cbc.ca/news/1.2802071 |title=Could Ebola rank among the deadliest communicable diseases? |publisher=CBC News |date=20 October 2014}}</ref>
[[世界衛生組織]]按照[[國際疾病與相關健康問題統計分類]]收集全球相關死亡的資訊。下表按死亡率列出 2002年最主要的傳染病。 1993年的數據也包括在內，以利比較。
{| class="wikitable sortable"
|+ '''全世界因感染性疾病而導致的死亡人數'''<ref>{{cite web | title=The World Health Report (Annex Table 2) | url=http://www.who.int/whr/2004/annex/topic/en/annex_2_en.pdf | year=2004}}</ref><ref>{{cite web | url=http://www.who.int/whr/1995/en/whr95_ch1_en.pdf | year=1995 | title=Table 5 }}</ref>
! 排名|| 死因 || 2002年死亡人數<br /> (百萬) || 百分比<br /> 總死亡人數 || 1993年死亡人數<br /> (百萬)|| 1993年排名
|- style="background:#ffdead;"
||N/A|| style="background:#ffdead;"| All infectious diseases || style="background:#ffdead;"|14.7 || style="background:#ffdead; text-align:center;"|25.9% || style="background:#ffdead;"| 16.4 || style="background:#ffdead; text-align:center;"|32.2%
|-
| 1 ||下呼吸道感染<ref>Lower respiratory infections include various [[pneumonia]]s, [[influenza]]s and [[acute bronchitis]].</ref>
||3.9 || style="text-align:center;"|6.9%||4.1||1
|-
| 2 |||愛滋病 ||2.8 || style="text-align:center;"|4.9% || 0.7||7
|-
| 3 ||腹瀉<ref>Diarrheal diseases are caused by many different organisms, including [[cholera]], [[botulism]], and ''[[Escherichia coli|E. coli]]'' <!-- THIS APPEARS TO BE A LIST OF TWO DISEASES and ONE ORGANISM -->to name a few. See also: [[ICD-10 Chapter I: Certain infectious and parasitic diseases#A00–A79 – Bacterial infections, and other intestinal infectious diseases, and STDs|Intestinal infectious diseases]]</ref>||1.8 || style="text-align:center;"|3.2% ||3.0||2
|-
| 4 ||肺結核|| 1.6 || style="text-align:center;"|2.7% ||2.7 ||3
|-
| 5 ||瘧疾 ||1.3 || style="text-align:center;"|2.2% ||2.0 ||4
|-
| 6 || 麻疹 ||0.6 || style="text-align:center;"|1.1% ||1.1 ||5
|-
| 7 ||百日咳 ||0.29|| style="text-align:center;"|0.5% ||0.36 ||7
|-
| 8 ||破傷風 ||0.21 || style="text-align:center;"|0.4% ||0.15 ||12
|-
| 9 ||腦膜炎||0.17 || style="text-align:center;"|0.3% ||0.25 ||8
|-
| 10 ||梅毒||0.16 || style="text-align:center;"|0.3% ||0.19 || 11
|-
| 11 ||[[乙型肝炎|B型肝炎]] ||0.10 || style="text-align:center;"|0.2% ||0.93 || 6
|-
| 12-17 ||6種{{link-en|熱帶疾病|tropical disease}}<ref>Tropical diseases include [[Chagas disease]], [[dengue fever]], [[filariasis|lymphatic filariasis]], [[leishmaniasis]], [[onchocerciasis]], [[schistosomiasis]] and [[trypanosomiasis]].</ref> ||0.13 || style="text-align:center;"|0.2% ||0.53 ||9, 10, 16–18
|-
| style="text-align:left;" colspan=6| {{small|''註記：其他的死因包括孕產婦和圍產期病症 (5.2%), 營養不良 (0.9%)，<br /> 非傳染性病症 (58.8%)，和受傷(9.1%).''}}
|}
===歷史性上的大流行===
[[File:Marseille-peste-Serre.jpg|thumb|1720年的[[馬賽大瘟疫]]造成城內，以及周圍地域有 10萬人喪生]]
由於感染病具有不可預測的，爆炸性的潛在因素，一直在人類歷史上佔有重要地位。<ref name=Fauci2012>{{cite journal |vauthors=Fauci AS, Morens DM |title=The perpetual challenge of infectious diseases |journal=New England Journal of Medicine |volume=366 |issue=5 |pages=454–61 |date=2012 |pmid=22296079 |doi=10.1056/NEJMra1108296 }}</ref> [[大流行]]（或全球[[流行病]]）是一種影響到廣大地理區域內人們的疾病。例如：
*[[查士丁尼大瘟疫]]，從公元 541年到 542年，歐洲有 50％至 60％的人口因而死亡。<ref>[http://eee.uci.edu/clients/bjbecker/PlaguesandPeople/lecture3.html "Infectious and Epidemic Disease in History"] {{webarchive |url=https://archive.today/20120712145547/http://eee.uci.edu/clients/bjbecker/PlaguesandPeople/lecture3.html |date=July 12, 2012 }}</ref>
*發生在 1347年至 1352年的[[黑死病]]，在 5年內歐洲有 2,500萬人死亡。這場在 14世紀的瘟疫讓[[舊大陸|舊世界]]的人口，估計從 4.5億減少到 3.5 至 3.75億。
*在 15和 16世紀，歐洲探險家把[[天花]]，[[麻疹]]和[[斑疹傷寒]]帶進中美洲和南美洲地區，在當地原住民中引起大流行。據說在 1518至 1568年之間，[[墨西哥]]的人口因此從 2,000萬下降到 300萬。<ref name= Dobson>{{cite journal | vauthors = Dobson AP, Carter ER| year = 1996| url = http://www.erin.utoronto.ca/~w3gwynne/BIO418/Dobson1996.pdf | title = Infectious Diseases and Human Population History | journal = BioScience| volume = 46 | issue = 2| doi = 10.2307/1312814 | pages=115–26| jstor = 1312814}}</ref>
*歐洲首次[[流行性感冒]]大流行發生在 1556年至 1560年之間，估計死亡率為 20％。<ref name= Dobson/>
*在 18世紀，天花估計導致 6,000萬歐洲人喪生<ref>[http://www.learnnc.org/lp/editions/nchist-twoworlds/1696 "Smallpox"]. ''North Carolina Digital History.''</ref>（等於每年死亡約 40萬人）。<ref>[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=vacc.chapter.3 Smallpox and Vaccinia]. ''National Center for Biotechnology Information.'' {{webarchive |url=https://web.archive.org/web/20090601172056/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=vacc.chapter.3 |date=June 1, 2009 }}</ref> 高達 30％的受感染者（包括 80％的 5歲以下兒童）死亡，而有三分之一的倖存者失明。<ref>{{cite journal |title=Smallpox: The Triumph over the Most Terrible of the Ministers of Death|first=Nicolau|last=Barquet|date=15 October 1997 |journal=Annals of Internal Medicine|volume=127|issue=8_Part_1|pages=635–42|doi=10.7326/0003-4819-127-8_Part_1-199710150-00010|pmid=9341063}}</ref>
*在 19世紀，結核病殺死歐洲成年人口的四分之一； <ref>[https://www.cdc.gov/TB/pubs/mdrtb/default.htm Multidrug-Resistant "Tuberculosis"]. ''Centers for Disease Control and Prevention.'' {{webarchive |url=https://web.archive.org/web/20100309043219/http://www.cdc.gov/TB/pubs/mdrtb/default.htm |date=March 9, 2010 }}</ref> 到 1918年，法國有六分之一的死亡仍是由結核病所引起。
*1918年的流感大流行（或稱[[1918年流感大流行|西班牙流感]]），有 2千 5千萬人喪生（約佔當時世界人口 17億的 2％）。<ref>{{cite web|url=http://www.history.navy.mil/library/online/influenza_main.htm|archive-url=https://web.archive.org/web/20060220113240/http://www.history.navy.mil/library/online/influenza_main.htm|url-status=dead|archive-date=20 February 2006|title=Influenza of 1918 (Spanish Flu) and the US Navy|author=|date=20 February 2006}}</ref> 今日，流感每年在全球造成 25萬至 50萬人死亡。
===新興疾病===
在大多數情況，微生物透過互利共生或偏利共生與宿主和諧相處。當現有的寄生物成為病原體，或新的致病性寄生物進入新的宿主時，就會產生疾病。
#寄生物與宿主之間的共同進化可能導致宿主對寄生物產生抵抗力，但是當這些寄生物因進化而產生更大的病毒性，就會導致{{link-en|免疫病理|Immunopathology}}疾病。
#人類活動與許多[[新興傳染病]]有關，例如[[生態環境]]變化讓寄生物佔有新的[[生態位]]。發生這種情況，原本只局限限在偏遠生境的病原體可散佈到更廣的範圍，並且成為新的宿主。從非人類宿主躍遷到人類宿主的寄生物被稱為[[人畜共通傳染病]]。當寄生物入侵到新的宿主物種時，可能會成為新的宿主的病原菌，產生疾病。<ref name= Krauss>{{cite book |author=Krauss H |title=Zoonoses: Infectious Diseases Transmissible from Animals to Humans |publisher=ASM Press |location=Washington, D.C. |year=2003 |edition=3rd |isbn=978-1-55581-236-2 |name-list-format=vanc|author2=Weber A |author3=Appel M }}</ref>
人類有些活動，導致人畜共通傳染病的病原體產生，包括病毒，細菌，[[原生動物]]，和[[立克次體]]<ref>{{cite journal | title=Summer buzz | author=Potter P | journal=Emerg Infect Dis |date=July 2013 | volume=19 | issue=3 | doi=10.3201/eid1907.AC1907 | page=1184| pmc=3903457 }}</ref>，以及傳播依靠病媒傳播的疾病<ref name= Krauss /> 。

另請參見[[全球化與疾病]]和{{link-en|野生動物疾病|wildlife disease}}：

*對野生動物[[棲息地]]的侵犯。新農村的興建，和在原是農村地區做住房開發，野生動物被迫生活在人口稠密的地區，提供讓微生物變異和發展的機會。<ref>{{cite journal |author=Peter Daszak |author2=Andrew A. Cunningham |author3=Alex D. Hyatt |title=Emerging Infectious Diseases of Wildlife—Threats to Biodiversity and Human Health |journal=Science |volume=287 |issue=5452 |date=27 January 2000 |pages=443–49 |pmid= 10642539 |doi=10.1126/science.287.5452.443 |bibcode=2000Sci...287..443D }}</ref>
*[[農業]]經營的變化。新農作物的引進，吸引新的病蟲害和新的微生物進入農業區域，使當地人們面臨前所未有的疾病。
*[[雨林]]遭受破壞。隨著各國在森林中修建道路，和開闢林地作為人類定居點或做商業開發，人們會因此遇到的昆蟲和動物，它們身上帶有以前未知的微生物。
*無節制的[[城市化]]。許多發展中的國家，迅速發展的城市，往往讓大量人口集中在衛生條件極差的地區。這會助長感染病的傳播。
*現代的[[運輸]]。往往船舶和貨船會載有意外的“乘客”，這就有機會把疾病傳播到遙遠的地方。目前利用噴射客機旅行，已經受到感染的人，可以在症狀出現之前，就把病原體攜帶到遙遠的土地，或者帶回自己的住家。
==細菌病學理論==
主要文章：{{link-en|疾病菌源理論|Germ theory of disease}}

[[File:Stamps of Germany (DDR) 1980, MiNr Zusammendruck 2534-2537.jpg|thumb|當年在[[東德]]發行的[[郵票]]，顯示四部古董[[顯微鏡]]，[[顯微鏡學]]在早期是促成對感染性疾病研究進展的重要工具。]]
在[[古典時代|上古時期]]，[[古希臘]]歷史學家[[修昔底德]]（生卒約為公元前 460年到 400年）是首度描述[[雅典大瘟疫]]的人，他認為疾病可能會從受感染者傳播到其他的人。<ref>Singer, Charles and Dorothea (1917) "The scientific position of Girolamo Fracastoro [1478?–1553] with especial reference to the source, character and influence of his theory of infection," ''Annals of Medical History'', '''1''' : 1–34; [https://babel.hathitrust.org/cgi/pt?id=mdp.39015016778261;view=1up;seq=28 see p. 14.]</ref><ref>Thucydides with Richard Crawley, trans., ''History of the Peloponnesian War'' (London, England: J.M. Dent & Sons, Ltd., 1910), Book III, § 51, [https://archive.org/stream/pelocrawleyr00thucuoft#page/130/mode/2up pp. 131–32.] From pp. 131–32.</ref> 希臘羅馬（請參考[[古典時代]]）醫師[[蓋倫]]在他論及《關於不同類型的發燒》（約在公元175年）作品中推測，[[瘟疫]]是靠空氣中存在的 “某些瘟疫種子” 而傳播。<ref>Nutton, Vivian (1983) "The seeds of disease: an explanation of contagion and infection from the Greeks to the Renaissance," ''Medical History'', '''27''' (1) : 1–34; see p. 10. Available at: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1139262/?page=23 U.S. National Library of Medicine, National Institutes of Health]</ref> 在梵文古籍《{{link-en|妙聞本集|Sushruta Samhita}}》中，印度醫生[[妙聞]]提出的理論是：“[[麻風病]]，發燒，結核病，眼疾，和其他感染病，是因為人們通過性結合，身體接觸，一起飲食，一起就寢，同坐，還有共穿彼此的衣服，共用彼此的花環，等所造成。” <ref>{{Cite journal|last1=Rastogi|first1=Nalin|last2=Rastogi|first2=R|date=1985-01-01|title=Leprosy in ancient India|url=https://www.researchgate.net/publication/16797371|journal=International Journal of Leprosy and Other Mycobacterial Diseases|volume=52|issue=4|pages=541–3|pmid=6399073}}</ref><ref>{{Cite book|last1=Susruta|url=http://archive.org/details/englishtranslati00susruoft|title=An English translation of the Sushruta samhita, based on original Sanskrit text. Edited and published by Kaviraj Kunja Lal Bhishagratna. With a full and comprehensive introd., translation of different readings, notes, comperative views, index, glossary and plates|last2=Bhishagratna|first2=Kunja Lal|date=1907-1916|publisher=Calcutta|others=Gerstein - University of Toronto}}</ref> 這本書撰寫的年代大約是在公元前六世紀。<ref>{{Cite book|last=Hoernle|first=A. F. Rudolf (August Friedrich Rudolf)|url=http://archive.org/details/studiesinmedicin01hoeruoft|title=Studies in the medicine of ancient India|date=1907|publisher=Oxford : At the Clarendon Press|others=Gerstein - University of Toronto}}</ref>
感染病理論的雛形是由[[波斯]]醫師[[伊本·西納]]（在歐洲被稱為阿維森納（Avicenna））在他的作品《''{{link-en|醫典|The Canon of Medicine}}''》（公元1025年）中提出，這本書後來成為歐洲最具權威的醫學教科書，直到 16世紀為止。在《''醫典''》第四卷，伊本·西納討論到流行病，概述古典的[[瘴氣]]說法，並設法把自己的早期感染理論與之融合。他提到人們可以因呼吸而將疾病傳播給他人，說明肺結核的傳染，並提出疾病可通過水和土壤而傳播。<ref>{{cite book |last1=Byrne |first1=Joseph Patrick |title=Encyclopedia of the Black Death |date=2012 |publisher=[[ABC-CLIO]] |isbn=9781598842531 |page=29 |url=https://books.google.com/books?id=5KtDfvlSrDAC&pg=PA29}}</ref>
後來，[[阿尤布王朝]]的幾位伊斯蘭學者討論到隱形感染的概念，他們稱其為{{link-en|najasat|不潔物}}。[[伊斯蘭教法學]]學者{{link-en|伊本·哈吉·阿卜杜里|Ibn al-Haj al-Abdari}}（生卒約為 1250年至 1336年）在討論[[符合教規的食物 (伊斯蘭教)]]
和{{link-en|伊拉蘭衛生律法|Islamic hygienical jurisprudence }}時，警告人們，感染病會污染飲水，食物，和衣服，並會通過供水傳播，並隱喻感染病是透過看不見的粒子傳播的。<ref>{{cite book |last1=Reid |first1=Megan H. |title=Law and Piety in Medieval Islam |date=2013 |publisher=[[Cambridge University Press]] |isbn=9781107067110 |pages=106, 114, 189–190 |url=https://books.google.com/books?id=5fJ4AAAAQBAJ}}</ref>
當[[黑死病]][[鼠疫]]在 14世紀傳播到[[安達盧斯]]時，阿拉伯醫師 Ibn Khatima（約在 1369年）和{{link-en|Ibn al-Khatib|Ibn al-Khatib}}（生卒約為 1313年到 1374年）假設傳染病是由 “微小的個體” 所引起，並描述感染病可以通過衣服，船隻和耳環傳播。.<ref>{{cite journal |last1=Majeed |first1=Azeem |title=How Islam changed medicine |journal=[[BMJ]] |date=22 December 2005 |volume=331 |issue=7531 |pages=1486–1487 |doi=10.1136/bmj.331.7531.1486 |pmid=16373721 |pmc=1322233 |url=https://www.bmj.com/content/331/7531/1486/rapid-responses |issn=0959-8138}}</ref> 在[[文藝復興]]時期，特別是因為透過義大利醫生[[吉羅拉莫·弗拉卡斯托羅]]的作品，感染病的概念在歐洲變得更為流行。<ref>{{cite journal | author = Beretta M | title = The revival of Lucretian atomism and contagious diseases during the renaissance | journal = Medicina Nei Secoli | volume = 15 | issue = 2 | pages = 129–54 | year = 2003 | pmid = 15309812 }}</ref> {{link-en|安東尼‧范‧雷文霍克|Antonie van Leeuwenhoek}}（生卒，1632年到 1723年）率先利用顯微鏡觀察微生物，從而推動[[顯微鏡學]]的發展。
在 19世紀中葉，[[約翰·斯諾 (醫學家)|約翰·斯諾]]和{{link-en|威廉·布德|William Budd}}兩位醫師證明被污染的水可導致傷寒和霍亂的傳染。兩位醫師在他們居住的小鎮，通過防止水污染的措施，而減少霍亂的流行。<ref>{{cite journal | author = Moorhead Robert | date = November 2002 | title = William Budd and typhoid fever | journal = J R Soc Med | volume = 95 | issue = 11| pages = 561–64 | pmc=1279260 | pmid=12411628 | doi=10.1258/jrsm.95.11.561}}</ref> [[路易·巴斯德]]更確證某些疾病是由感染原所引起，並開發出[[狂犬病]]疫苗。[[羅伯·柯霍]]做出[[柯霍氏法則]]，作為感染病研究的依據。[[愛德華·詹納]]，[[喬納斯·索爾克]]，和[[阿爾伯特·沙賓]]分別開發出[[天花]]和小兒麻痺症疫苗，天花因而被消滅，而小兒麻痺症幾近被消滅。[[亞歷山大·弗萊明]]發現世界上第一種抗生素，青黴素，然後由[[霍華德·弗洛里]]和 [[恩斯特·伯利斯·柴恩]]開發出來。 [[格哈德·多馬克]]開發出[[磺胺類藥物]]，這是第一種廣泛[[化學合成]]的抗生素。
===相關醫學專家===
感染病的治療屬於{{link-en|感染性疾病醫學|Infectious disease (medical specialty)}}
領域，而感染病傳播的研究有時就屬於流行病學領域。通常，感染是由[[初級醫療]]醫生或[[內科學|內科]]醫生做診斷。例如，“單純性”肺炎通常最初由內科醫生或[[胸腔醫學]]醫師治療。因此，感染病專科醫師的工作，需要與患者，以及[[家庭醫學科醫師|普通科醫生]]以及實驗室科學家，[[免疫學]]家，[[細菌學]]家，還有其他專家共同合作。
在以下的情況，可能會動用到感染病小組：
*初次檢查時，無法明確診斷出是哪種感染；
*患者有免疫缺陷（例如，患有愛滋病，或做化學療法之後）；
*病原體具有罕見的性質（例如{{link-en|熱帶疾病|tropical disease}}）；
*感染對所施用的一線抗生素無反應；
*感染對其他患者可能有危險，必須將患者隔離。

==化石記錄==
主條目：[[古病理學]]
動物化石遺跡中的感染證據是[[古病理學]]家研究的題材。在[[肉食動物|肉食性]]恐龍的骨骼中曾發現有感染的跡象。但是，這些感染似乎僅限於身體上的小區域。有早期[[艾雷拉龍屬]]肉食性恐龍的頭骨，顯示出坑狀傷口，周圍有腫脹和多孔的骨頭。傷口周圍骨頭的異常紋理表明感染是短暫的，非致命性的。研究者推測，這是在與另一隻同類恐龍在搏鬥中所所發生。有感染證據的其他肉食性恐龍還包括[[高棘龍屬]]，[[異特龍屬]]，[[暴龍屬]]，和一隻在{{link-en|柯特蘭組地層|Kirtland Formation}}發掘出來的的暴龍化石。這兩隻都在搏鬥中被咬傷，就像艾雷拉龍一樣，受到感染。<ref name="molnar-pathology">Molnar, R. E., 2001, "Theropod paleopathology: a literature survey": In: ''Mesozoic Vertebrate Life'', edited by Tanke, D. H., and Carpenter, K., Indiana University Press, pp. 337–63.</ref>
==外太空==
主要文章：[[太空航行對人體的影響]]，{{link-en|太空飛行期間的醫療|Medical treatment during spaceflight}}，以及{{link-en|太空醫學|Space medicine}}

在 2006年的[[航天飛機|太空梭]]上所做的實驗發現，{{link-en|沙門氏菌亞種 Ⅰ 型|Salmonella enterica subsp. enterica}}（一種引起[[食物中毒]]的細菌），在太空中培養時，病毒性會變得更強。<ref name="ASU-20070923">{{cite web |last=Caspermeyer |first=Joe |title=Space flight shown to alter ability of bacteria to cause disease |url=https://biodesign.asu.edu/news/space-flight-shown-alter-ability-bacteria-cause-disease |date=23 September 2007 |website=[[Arizona State University]] |accessdate=14 September 2017 }}</ref> 2013年 4月 29日，由[[美國國家航空航天局]]提供經費的[[壬色列理工學院]]的科學家報告說，在[[國際空間站]]的太空飛行期間，微生物似乎以“地球上未曾觀察到” 的方式和 “能夠導致增強生長和病毒性”。<ref name="PLos-20130429">{{cite journal |vauthors=Kim W, etal |title=Spaceflight Promotes Biofilm Formation by Pseudomonas aeruginosa |date=April 29, 2013 |journal=[[PLOS ONE]] |volume=8 |issue=4 |page=e6237 |doi=10.1371/journal.pone.0062437 |pmid=23658630 |pmc=3639165 |bibcode=2013PLoSO...862437K }}</ref> 最近，在 2017年，細菌被發現對抗生素具有更強的抵抗力，並且能在近乎[[失重]]的太空環境中繁衍生息。<ref name="GZM-20170913">{{cite web |last=Dvorsky |first=George |title=Alarming Study Indicates Why Certain Bacteria Are More Resistant to Drugs in Space |url=https://gizmodo.com/alarming-study-indicates-why-certain-bacteria-are-more-1805666249 |date=13 September 2017 |website=[[Gizmodo]] |accessdate=14 September 2017 }}</ref> 根據觀察，微生物可以在[[外太空]]的[[真空]]環境中存活。<ref name=Dose>{{cite journal | title=ERA-experiment "space biochemistry" | journal=Advances in Space Research | volume=16 | issue=8 | year=1995 | pages=119–29 | doi=10.1016/0273-1177(95)00280-R | pmid=11542696 | last1=Dose | first1=K. | last2=Bieger-Dose | first2=A. | last3=Dillmann | first3=R. | last4=Gill | first4=M. | last5=Kerz | first5=O. | last6=Klein | first6=A. | last7=Meinert | first7=H. | last8=Nawroth | first8=T. | last9=Risi | first9=S. | last10=Stridde | first10=C. | bibcode=1995AdSpR..16..119D | url=http://publications.ub.uni-mainz.de/opus/volltexte/2008/11364/pdf/11364.pdf }}{{Dead link|date=August 2018 |bot=InternetArchiveBot |fix-attempted=yes }}</ref><ref name='Horneck'>{{cite journal | title=Biological responses to space: results of the experiment "Exobiological Unit" of ERA on EURECA I | journal=Adv. Space Res. | year=1995 | author1=Horneck G. |author2=Eschweiler, U. |author3=Reitz, G. |author4=Wehner, J. |author5=Willimek, R. |author6=Strauch, K. | volume=16 | issue=8 | pages=105–18| pmid=11542695 | bibcode=1995AdSpR..16..105H |doi=10.1016/0273-1177(95)00279-N}}</ref>
==另請參見==
{{div col|colwidth=20em}}

*{{link-en|傳染病生物資訊學資源中心|Bioinformatics Resource Centers}}
*[[生物性危害]]
*{{link-en|血源性疾病|Blood-borne disease}}
*{{link-en|合併感染|Coinfection}}
*{{link-en|哥本哈根共識|Copenhagen Consensus}}
*{{link-en|防疫線|cordon sanitaire}}
*{{link-en|疾病擴散圖|Disease diffusion mapping}}
*[[流行病學轉變]]
*[[食物中毒|食源性疾病]]
*[[基因治療]]
*[[醫學史]]
*[[醫療照顧相關感染]]（舊稱院內感染）
*{{link-en|根除傳染病|Eradication of infectious diseases}}
*[[人類微生物組計劃]]
*{{link-en|感染預防與控制|Infection prevention and control}}
*{{link-en|隔離|Isolation (health care)}}
*{{link-en|細菌性陰道病菌群清單|List of bacterial vaginosis microbiota}}
*[[2002年致死原因及所占比例列表]]
*{{link-en|昆蟲引起的疾病清單|List of diseases caused by insects}}
*{{link-en|流行病清單|List of epidemics}}
*{{link-en|傳染性疾病清單|List of infectious diseases}}
*{{link-en|傳染性疾病的數學模型|Mathematical modelling of infectious disease}}
*{{link-en|膜囊泡運輸|Membrane vesicle trafficking}}
*{{link-en|感染複數|Multiplicity of infection}}
*[[被忽視熱帶病]]
*{{link-en|前哨檢測|Sentinel surveillance}}
*[[保持社交距離]]
*{{link-en|時空流行病學建模器|Spatiotemporal Epidemiological Modeler}}（STEM）
*{{link-en|溢出感染|Spillover infection}}
*{{link-en|宿主閾值密度|Threshold host density}}
*[[傳播途徑]]
*{{link-en|有膿，就抽掉|Ubi pus,ibi evacua}}（拉丁語：“有膿液的地方，請撤離它”）
*{{link-en|疫苗可預防的疾病|Vaccine-preventable diseases}}
*{{link-en|水源性疾病|Waterborne diseases}}
{{div col end}}
==參考文獻==
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==外部連結==

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2020年6月16日 (二) 07:33的版本

感染
假色的電子顯微鏡圖片，顯示瘧原蟲孢子體正穿過老鼠的中腸（英语：midgut）上皮組織
分类和外部资源
醫學專科感染性疾病學（英语：Infectious disease (medical specialty)）
[编辑此条目的维基数据]

感染指的是疾病的病原體侵入生物的組織，然後病原體開始繁殖，以及宿主的組織對這些病原體，及病原體所產生毒素產生的反應。[1][2] 感染性疾病，(infectious disease，也稱為 transmissible disease ，或者 communicable disease），是由感染而引起的疾病。 引起感染的病原體有：

宿主可利用自身的免疫系統來對抗感染。哺乳動物的先天免疫系統先對感染發生反應（通常會有發炎現象），之後會發展出後天免疫系統。[7] 用於治療感染的藥物有抗生素，抗病毒藥物，抗真菌藥，抗原蟲劑（英语：Antiprotozoal），和驅蟲藥。 2013年，全球因感染性疾病所導致的死亡人數為 920萬人（約佔所有當時死亡人數的 17％）。[8] 醫學領域中專注於處置感染的分支被稱為感染性疾病學（英语：Infectious disease (medical specialty)） 。[9]

分類

亞臨床感染 vs 臨床感染（潛伏 vs 明顯）

感染有症狀時，稱為明顯的臨床症狀，而感染活躍，但不產生明顯症狀，可稱為不明顯感染（英文表達字眼有 inapparent, silent, subclinical, 或 occult）。非活躍或蟄伏的感染稱為 潛伏感染 。[10] 潛伏性細菌感染的一個例子是潛伏性肺結核（英语：latent tuberculosis）。一些病毒感染也可能是潛伏性的，被潛伏性病毒（英语：Virus latency）感染的例子是受到皰疹病毒科裡面的任何一種入侵的情況。[11] 感染一詞，用以表示某種特定病原體的存在（無論少到何種程度），但經常指的就是明顯的臨床感染（換句話說，就是感染到傳染病）。[12] 這情況有時會引起歧義，或產生用字上的討論；為了解決這個問題，對醫事人員來說，當他們表示某些病原體存在，但沒有臨床上明顯的感染（無疾病）顯現時，通常會用到移生（英语：colonization），而不用感染來表達。

對於感染，又有不同的名詞。首先是急性感染。急性感染是指一種迅速發展的症狀，過程或者是迅速的，或者是拖得久的。[13] 接下來是慢性感染。慢性感染是指症狀要花幾週，或幾個月，逐漸發展，並且不易治療。[14] 亞急性感染，與急性感染相比，發展時間較長，但又比慢性感染發展的快。潛伏性感染是急性發作後的一種感染；病原體存在，但沒症狀；隔一段時間，疾病又重新出現。局灶性感染的定義是，病原體從感染的初始部位開始，經由血液流傳到身體的其他部位，而發病（請參考：局灶性感染理論（英语：Focal infection theory））。[15]

原發性病原體 vs 機會性病原體

另請參閱：共同感染（英语：Coinfection）

在多種微生物中，只有極少數會對健康的人體引起疾病​​。[16] 傳染病是由這幾種病原體與宿主的防禦系統之間，相互作用所造成。由任何病原體引起的疾病症狀，及嚴重程度，取決於病原體損害宿主的能力，以及宿主抵抗力的有效性。但是，宿主的免疫系統，因為要控制感染，也有可能對宿主本身造成傷害。因此，臨床醫生根據宿主抵抗力狀態，把感染性微生物分類為原發性病原體，或者是機會性病原體：

原發性病原體

原發性病原體在正常且健康的宿主體內存在，或者它們的活動，而引起疾病，其固有的病毒性（引起疾病的嚴重程度）在某種程度上，是病原體繁殖和傳播的必然結果。人類許多常見的原發性病原體僅會感染人類，但是，也有許多嚴重的疾病是人類由從環境中，或者是從非人類的宿主，所碰到的病原體所引起。

機會性病原體

主條目：機會性感染

機會性病原體可以對抵抗力低下（免疫缺陷）的宿主，或者經由異常管道進入身體內部（例如，通過創傷），導致感染性疾病。機會性感染可能是由與宿主接觸的微生物引起（例如消化道或上呼吸道中的病原細菌或者真菌），也可能是從其他宿主得來（無害的）微生物所造成（例如偽膜性結腸炎 ），或由於外傷導致的結果（如手術的傷口感染，或者複合性骨折）。機會性感染會發生在宿主的抵抗力受到損害 - 由於遺傳缺陷（英语：genetic defect）（例如慢性肉芽腫病），接觸到抗菌劑，或者接觸到免疫抑制化學物質（如中毒，或癌症化學療法後），接觸到游離輻射，或者罹患具有免疫抑制活性的傳染病（例如麻疹，瘧疾，或者愛滋病毒）。與抵抗力強的宿主相比，原發性病原體有可能會在抵抗力低下的宿主中，引起更嚴重的疾病。[17]

繼發性感染

原發性感染可被視為個人健康發生問題的根本原因，繼發性感染是這項根本原因的後遺症，或稱併發症。例如，肺結核通常是原發性感染，但是僅由於灼傷或穿透性創傷（根本原因）讓結核菌不尋常地進入深部組織而發生的感染，則是繼發性感染。原發性病原體引起的是原發性感染，也常會引起繼發性感染。通常機會性感染被視為繼發性感染（因為免疫缺陷，或創傷是誘發因素）。

其他類型的感染

其他類型的感染包括混合感染，醫源性感染，醫療照顧相關感染，和社區感染。混合感染是由兩種，或多種病原體引起的感染。一個例子是闌尾炎，它是由脆若性桿菌（英语：Bacteroides fragilis）和大腸桿菌共同所引起。第二是醫源性感染。這是一種從醫護人員傳播給患者的感染。醫療照顧相關感染是在醫療機構中發生的感染，指的是住院期間罹患的感染。最後，社區感染是指從社區之內得到的感染。[15]

有感染性與否

要證明疾病是否具有感染性的一種方法是得符合柯霍氏法則（首度由 羅伯·柯霍 提出），第一，僅在患有特定疾病的患者中有這種感染原，而在健康對照組中則沒有；第二，，接觸到感染病原體的人也會患上這種疾病。這些法則首度使用時，發現分枝桿菌屬是引起結核病的原因。

但是，基於道德上的原因，在現代的做法，不會這樣的採用柯霍氏法則來檢測 - 把純培養的病原體用在健康的個體身上做實驗。反過來，縱然是明顯的感染病也不總是能符合感染的標準。例如，導致梅毒的梅毒螺旋體無法透過試管培養，但可以在兔子的睾丸中培養。與純粹從培養皿培養出來的微生物相比，從動物宿主培養出來的微生物就沒那麼純粹了。

流行病學，用於研究和分析，對誰，為何，在何處，發生疾病，以及什麼是不同人群患有某種疾病的決定因素，是用於了解感染病的另一重要工具。流行病學家可以確定人群中不同組別間的差異，例如某些年齡層的感染率是高，或是低。居住在不同社區的人群是否更容易受到感染；以及其他因素，例如性別和種族。研究人員還可以評估疾病暴發（英语：Disease outbreak），是零星陸續發生，還只是一次偶然事件。地方性流行的意思是區域內經常發生的常規病例；流行病的意思是一個地區中的病例迅速增加，而且異常多；而大流行則是一種全球流行病。如果對於感染病，不知其原因，則可利用流行病學來協助追踪感染源。

傳染性

當疾病很容易經由與病人或其分泌物接觸，而發生傳播時（例如流行性感冒），就被稱為傳染病。因此，傳染病（contagious disease）是特別是具有傳染性或易於傳播的感染性疾病（infectious disease）之下的子集型態。具有更專門感染途徑的其他類型的感染病，例如要透過媒介傳播，或者性行為來傳播的，通常不被視為具有“傳染性（contagious）”，並且通常不需要對患者進行隔離（有時簡稱為隔離檢疫）。但是，在“傳染性（contagious）” 和 “傳染病（contagious disease）”這種詞的特殊含義被大眾使用之時，就沒那麼那麼的有專用性。感染性疾病（ Infectious diseases）通常是通過直接接觸，在人與人之間傳播。而接觸的類型有飛沫傳播。而間接接觸，例如透過空氣，受污染的物體，食物和飲用水等的傳播，人和動物接觸，經由動物宿主，昆蟲叮咬，和自然宿主等，都是感染性疾病傳播的另類別的方式。[18]

按感染部位分類

感染可根據感染部位或生物系統來做分類：

另外，人體很通常發炎的部位有肺部的肺炎，腦部的腦膜炎，和輸卵管的輸卵管炎（英语：salpingitis）。

跡象和症狀

感染的症狀由疾病的類型而定。某些跡象通常會影響到整個身體，例如疲勞，食慾不振，體重減輕，發燒，盜汗，發冷，隱痛，和疼痛。其他的則發生在身體的特定部位，例如皮膚出疹子，咳嗽，或流鼻涕。 在某些情況下，感染性疾病在特定宿主中的大部分甚至全部病程中可能是無症狀（英语：asymptomatic）的。與無症狀者接觸後，繼而患病的人的 “疾病” 才會被定義為生病。感染本身不是感染疾病的同義詞，因為某些感染不會在宿主中發病​​。[17]

細菌性或病毒性

由於細菌和病毒感染均可引起患者相同類型的症狀，因此很難區分是哪種所引起。[19] 但是把兩者區分出來很重要，因為病毒感染無法用抗生素治療，而細菌感染則可。[20]

病毒性感染和細菌性感染比較
性質 病毒性感染 細菌性感染
典型症狀 通常，病毒性感染是全身性的。發生流鼻涕，鼻竇充血，咳嗽，身體疼痛等。有時也會是局部性，如結膜炎（或稱“紅眼症”）和皰疹。只有少數病毒感染會像皰疹一樣讓患者痛苦不堪。病毒性感染所引起的不適通常會被描述成發癢或灼痛。[19] 細菌性感染的典型症狀是身體局部發紅，發熱，腫脹，和疼痛。這種感染的標誌之一是局部疼痛（身體特定部位的疼痛）。例如，如果是割傷而被細菌感染，感染部位會疼痛。細菌性喉嚨痛通常是喉嚨的部位特別疼痛。如果只有一耳發生疼痛，則這種耳朵感染耳炎通常就是細菌性所導致。[19] 會流出膿液和乳白色液體的傷口很可能是受到細菌感染。[澄清請求][21]
導致原因 病毒 病原細菌

病理生理學

對於感染，發展過程是一連串事件的鏈接而成。[22] 所涉及的步驟是 - 傳染原，帶病原宿主，進入易受感染宿主，再傳播給新宿主。每個鏈接會按照時間順序排列而完成感染。醫事人員能夠了解這些步驟，將有助於鎖定感染，然後在第一時間阻止它往下一步發展。[23]

移生

趾甲內生症（英语：ingrown nail），有黃色的膿，以及發炎（趾甲周圍紅腫）。

當病原體成功進入人體，生長並繁殖時，感染即算開始。這稱為移生（colonization）。大多數人不容易受到感染。那些免疫系統受損，或減弱的人，就成了慢性或持續感染的易感個體。免疫系統受到抑制的人特別容易受到機會性感染的侵害。病原體通過宿主的宿主-病原體界面（英语：host-pathogen interaction）進入身體，這些界面通常就是口腔，鼻子，眼睛，生殖器，肛門等身體孔口上的粘膜，或者微生物也可透過開放性傷口進入身體。有少數微生物可以在進入人體的初始位置上生長，但許多生物會遷移，並在不同器官中引起器官系統的感染。一些病原體在宿主細胞內（胞內）生長，而其他病原體則在體液中自由生長。

傷口移生是指傷口之內尚未有複製的微生物，而在感染的傷口上，則存在複製中的微生物，傷口的組織受到損傷。[24] 所有多細胞生物都在某種程度上被外來生物所移生，其中絕大多數與宿主之間存有互利共生的關係，或者是偏利共生的關係。前者的一個例子是厭氧生物菌種，它們定居在哺乳動物的大腸中，後者的例子是人類皮膚上存在各種葡萄球菌屬菌種。這些移生都不被認為是感染。感染和移生之間的差異通常僅是環境不同的問題。在特定條件下，非致病性細菌會成為致病細菌，即使是最具病毒性的微生物也需要在某些環境之下才會導致嚴重的感染。有些移生細菌，例如棒狀桿菌屬（英语：Corynebacterium），和草綠色鏈球菌，可預防病原菌的粘附和移生，因此與宿主具有共生關係，可防止宿主的感染並加速傷口癒合。

[25][26][27] 本圖顯示病原體感染的步驟。

宿主受到病原體入侵之後，能產生最終結果的變數包括：

  • 病原體進入身體的途徑，和通往宿主體內可逗留的區域
  • 特定微生物的既有病毒性
  • 初始入侵微生物的數量
  • 被移生的宿主本身的免疫狀態

例如，幾種葡萄球菌對皮膚無害，但是當它們進入無菌（英语：Asepsis）的空間後，例如說在關節囊或腹膜中，就會大肆繁殖，並造成傷害。

有趣的事是，在近幾十年來，利用氣相色譜法-質譜聯用，16S 核糖體RNA分析，組學和其他先進技術所得的結果，越來越清楚的顯示，就在人類認為幾乎無菌的環境中，微生物的移生也十分普遍。由於細菌移生算是正常，因此很難知道哪些慢性傷口可歸類為已受感染，存有多少惡化的風險。雖然人們在臨床上已處理過大量傷口感染，但可用來評估症狀和跡象的，具有有良好品質的數據，仍然有限。在《美國醫學會》雜誌中的“理性臨床檢查叢書（Rational Clinical Examination Series）”中，對慢性傷口做審查後，把患者身上疼痛的加劇程度予以量化，作為重要的感染指標。[28]這份審查顯示，最有用的發現是疼痛程度的增加[可能性比（likelihood ratio）範圍在 11–20]，則顯示感染的可能性增強，但是沒有疼痛（負面可能性比範圍在 0.64–0.88）也不能排除患者是受到感染（總結可能性比範圍在 0.64–0.88）。

疾病

疾病的發生，是宿主的免疫機制受損，接著病原體對宿主造成損害。微生物可利用釋放多種毒素或破壞性的酶來造成組織損傷。例如，破傷風梭菌會釋放讓肌肉麻痺的毒素，而葡萄球菌屬會釋放產生休克和敗血症的毒素。並非所有傳染原都會引發宿主生病​​。例如，少於 5％的小兒麻痺症感染者會發病。[29] 另一方面，某些傳染源具有高病毒性。譬如引起狂牛症和克雅二氏病的朊毒體，會讓所有被感染的動物，以及人類死亡。 持續性感染的發生是因為初始感染後，身體內病原體無法被清除乾淨。持續性感染的特徵是病原體的持續存在，通常是潛伏性感染狀態，偶爾會復發成為活躍性感染。有些病毒可以透過感染人體的不同細胞來維持持續性感染。曾經進入人體的某些病毒會永遠存在。典型的例子是皰疹病毒，它隱藏在神經中，並在特定情況出現時重新被激活。 持續性感染每年在全球造成數百萬人死亡。[30] 在許多落後的國家中，寄生蟲引起的慢性感染，導致甚高的發病率和死亡率。

傳播

主要文章：傳播途徑

熱帶家蚊 Culex quinquefasciatus（英语：Culex quinquefasciatus）是一種疾病媒介，會傳播西尼羅河熱，禽類瘧疾（英语：avian malaria）等疾病。

感染性微生物為了生存，並引起其他宿主的感染，它們（或其後代）必須離開現有的宿主，到其他地方引起感染。各種潛在的感染傳播途徑有：

  • 飛沫傳播，也稱為呼吸道感染途徑，由此引起的疾病感染可稱為空氣傳播疾病。如果感染者咳嗽，或對者他人打噴嚏，包含在溫暖潮濕的小水滴中的微生物就會通過對方的鼻子，嘴巴或眼睛表面進入人體。
  • 糞口途徑傳播，食物或水受到污染（由於人們在烹調食物前不洗手，或未經處理的污水滲入到飲用水中），而攝取這些食物和飲水的人受到感染。常見的糞口途徑傳播病原體包括，霍亂弧菌，蘭氏賈第鞭毛蟲（英语：Giardia）屬，輪狀病毒，溶組織內阿米巴，大腸桿菌，和絛蟲。[31] 這些病原體大多數會引起腸胃炎。
  • 性行為傳播，由此產生的疾病稱為性行為感染疾病（英语：sexually transmitted disease）。
  • 口腔傳播：透過直接的口腔接觸（例如接吻）或間接接觸（例如共享水杯或香煙）而發生感染。
  • 直接接觸傳播，某些直接接觸傳播的疾病包括香港腳，膿痂疹，和疣。
  • 載體傳播，經由非生物載體（食物，水，土壤）傳播。[32]

病毒性相對於可傳播性之間的關係很複雜。如果疾病有迅速的致命性，宿主可能會在病原體傳給另一宿主之前就已死亡。

診斷

診斷感染病，牽涉到用直接或間接的方式去識別感染原。大多數輕微的感染病，例如疣，皮膚膿瘍，呼吸系統感染，和腹瀉，都是憑臨床症狀來做診斷，並且是在並不知道實際病因的情況下就做治療。判斷病因，會根據患者接觸到特定的病原，社區中存有某種疾病微生物，或者其他流行病學上的可能。雖說只要努力，通常就可找出感染原，鑑定確實病因是有好處，但是通常成本會很高，如果不需用特定的治療方法，或致病原因明顯，或者患者病情不算嚴重，就不需如此做。 對感染病的診斷，都由患者的病史和實際檢查開始。更詳細的鑑定方法則涉及從患者採檢，培養出的傳染原。通過顯微鏡檢查微生物的特徵，檢測病原體產生的物質，以及利用基因型來直接鑑定。其他技術（例如X射線，電腦斷層掃描，正子斷層照影，或者 核磁共振）則用於因為感染原生長引起的內部異常，所產生的圖像。這種圖像方式可有效檢測出例如朊毒體引起的骨骼膿瘍或傳染性海綿狀腦病等病症。

症狀診斷

人在受到感染後，可憑症狀來判斷，但仍需要其他診斷技術來輔助確認。一些體徵具有的特徵，是某些疾病所獨有，叫做特異病徵（英语：pathognomonic），但此並非常見。所有感染並不一定有症狀。[34] 在兒童中，出現發紺，呼吸急促，末梢血液循環不良，或紫癜，則有嚴重感染的風險會增加 5倍以上。[35] 其他重要參考指標包括，父母的擔憂，臨床直覺，和患者體溫高過攝氏 40度。[35]

微生物培養診斷

四個裝載有營養瓊脂的培養皿，培養革蘭氏陰性菌菌落。

微生物培養是用於感染病診斷的主要工具。在微生物培養物時，會使用到培養基。從患者的組織或體液中取得樣本，放在培養基中，看能否發現傳染原。大多數病原細菌很容易在營養瓊脂上生長，營養瓊脂是一種固體培養基，可提供細菌生長所需的碳水化合物和蛋白質，以及充足的水份。單個細菌可在培養皿表面上長成可見的小丘，稱為菌落，與其他菌落分離或融合在一起，形成“菌苔”。細菌的種類，基因組成（分型），以及生長環境，會讓菌落有其特殊的大小，顏色，形狀，和組成。

為幫助識別病原體，會有其他成分添加到培養皿中。培養皿中可能含有只允許某些細菌生長的物質，或因為某些特定細菌的生長而改變顏色的物質。此類的培養方式常見於臨床鑑定用。培養也可以用來鑑定病毒：在這種情況下，培養基是在培養物中生長的細胞，病毒可以感染這些細胞，然後改變，或殺死細胞。在做病毒鑑定時，因病毒生長而死亡的細胞區域，被稱為“噬菌斑（英语：viral plaque）”。真核生物也可以培養，是用來鑑定這類特定病原體的方法。

在缺乏合適的培養皿技術的情況下，某些微生物需要在活體動物中培養。雖然血清學和顯微鏡技術讓運用活體動物培養成為不必要，但細菌（例如痲瘋桿菌和梅毒螺旋體）必須在活體動物中培養。在培養物或動物體內生長之外，也有替代的方法來鑑定病毒。有些病毒可在受精卵中培養。另一種有用的鑑定方法是異種接種診斷法（英语：Xenodiagnosis），使用載體來培養傳染原。恰加斯病異種接種診斷法是個重要的例子，因為不容易直接證明病原體克魯氏錐蟲（英语：Trypanosoma cruzi）在患者體內存在，碰到這種情況，可用異種接種診斷法 - 從疑似受感染者取得的血粉（英语：blood meal）餵食給未受感染的接吻蟲（英语：Triatominae） （克魯氏錐蟲的載體），然後檢查接吻蟲的腸道，看是否有克魯氏錐蟲的存在。

顯微鏡學診斷

診斷感染病的另一個重要工具是顯微鏡。實際上，上面討論的所有培養，都會在某個時點，利用到顯微鏡檢查，來確定感染原。顯微鏡檢查可以用簡單型的，例如複合光學顯微鏡，也可以使用複雜型的，像電子顯微鏡。從患者那裡取得的樣本可以直接在光學顯微鏡下觀察，迅速取得結果。 顯微鏡還可與生物化學染色技術結合使用，在與具有抗體的技術結合使用時，更有特色。例如，使用具有人造螢光的抗體（有螢光標記的抗體）和病原體上存在的特定抗原結合，然後使用螢光顯微鏡檢測，看臨床樣品或培養的細胞內有無螢光標記的抗體。這種技術在病毒性疾病的診斷中特別有用，光學顯微鏡則無法用來直接識別病毒。

其他顯微鏡的使用方式也可識別傳染原。由於帶負電荷的細胞分子與具有的正電荷的染料會互相吸引，幾乎所有細胞都可被染料染色。細胞通常在顯微鏡下是透明的，使用染料可以增加細胞與背景的對比度。用如吉姆薩染液或結晶紫的染料對細胞作染色，可讓顯微鏡學技術人員描述細胞大小，形狀，內部和外部組成，以及與其他細胞的相互關係。細菌對不同染色程序的反應也被用在微生物的生物分類。革蘭氏染色和耐酸性染色（英语：acid-fast stain）兩種，是用在細菌分類和診斷疾病的標準方法。革蘭氏染色可以偵測到厚壁菌門和放線菌門菌群，這些菌群包含許多重要的人類病原體。耐酸性染色程序可辨識出放線菌門屬的分枝桿菌屬和諾卡氏菌屬（英语：Nocardia）的存在。

生化檢驗診斷

用於鑑定感染原的生化檢驗方式，包括檢測特定傳染原代謝或酶產物的存在。由於細菌會用其屬和物種的特定模式來對碳水化合物做發酵，因此可透過檢測發酵產物而找出細菌。當細菌在特定的液體或固體介質中生長時，通常可以檢測到酸，酒精，和氣體。

從受感染的組織中分離出酶，也是診斷出感染的一種方式。例如，人體既不能製造RNA複製酶，也不能產生逆轉錄酶，那麼有這些酶就是有特定類型的病毒感染發生。病毒蛋白血球凝集素將紅血球結合，成為一種可檢測的基質，在生化檢驗中，也表示有病毒感染。嚴格說來，血球凝集素不是酶，也沒有代謝的功能。

血清學檢測方法是高度靈敏，特定的，通常可非常快速檢測出微生物。這些測試是利用抗體特異性結合抗原的能力。抗原通常是由感染原產生的蛋白質或碳水化合物，與抗體結合。然後，這種結合將觸發一系列事件，這些事件可以通過各種方式清楚顯示，就看用的是哪種測試方法。例如，“鏈球菌性咽炎”，用棉籤從患者的喉嚨中取得樣本，檢測出"化膿性鏈球菌"的抗原時，很快就確診。血清學檢測通常是鑑定的首選方法，但是檢測的成本很高，並且檢測使用的試劑通常需要冷藏。有些血清學方法非常昂貴，但有些經常使用的，例如“ 鏈球菌快速檢測”，就很便宜。[17]

複雜的血清學檢驗已經發展成為所謂的免疫測定法（英语：Immunoassay）。免疫測定法可以使用基本的抗體-抗原結合時所產生電磁學或粒子輻射信號，可利用儀器檢測到。不明的信號可以與已有標準作比較，從而可對特定抗原做量化。為了幫助診斷感染病，免疫測定法可以檢測或測量來自感染原的抗原，或被感染生物體對外來物質產生的蛋白質抗原。例如，免疫測定法 A 可以檢測來自病毒顆粒的表面蛋白的存在。另一方面，免疫測定法 B 可以檢測或測量由生物體免疫系統產生的抗體，這些抗體可以中和並破壞病毒。

這種儀器在讀取抗體-抗原結合時，相關的次級反應所產生出來的極小信號。儀器可以對採樣，反應物的使用，反應的時間，信號的檢測，計算結果這些方面做控制，並做數據管理，以產生具有成本效益的自動化感染病檢驗流程。

聚合酶連鎖反應診斷

由於好幾樣原因，聚合酶連鎖反應診斷技術可能會在不久後成為處處可見的診斷標準。首先，感染原的目錄已經發展到幾乎包括所有人類重要的感染原。其次，感染源必須在人體內生長才會引起疾病。本質上，它必須擴增自己的核酸才能致病。感染組織中核酸的擴增，提供利用聚合酶連鎖反應檢測的機會。第三，導引聚合酶連鎖反應的基本工具，引物，就是從感染原的基因組衍生而來，那些基因組，長久而言，終究會被人們所解密。 因此，當前已經具備能迅速且具體的檢測感染原的能力。使用聚合酶連鎖反應方法，作為標準用法的唯一障礙是在成本，但也並非無法克服。某些疾病的診斷,例如一些梭菌病屬（英语：clostridial）疾病（破傷風和肉毒桿菌中毒）。就無法透過聚合酶連鎖反應來達成。這些疾病是由少量會產生極強神經毒素的細菌所引起的生化中毒。這類感染原不會顯著的增殖，因此聚合酶連鎖反應方法檢測的能力在此受到限制。

宏基因組學測序診斷

鑑於造成身體虛弱和威脅生命的細菌，病毒和其他病原體種類繁多，因此擁有快速的確定感染原因的能力變得很重要，但不一定容易達成。例如，雖然使用最先進的臨床實驗室方法做測試，但仍有超過一半的腦炎沒被診斷出來。宏基因組學目前正被用在臨床研究，有望成為一種靈敏，而且能迅速診斷出感染的單一全能方法。這種測試與當前的聚合酶連鎖反應測試相似；但是，利用擴增的遺傳材料，而不是使用特定感染因子的引物來做測試，不容易產生誤差。在利用擴增遺傳材料之後，再使用包含數千個生物和病毒基因組的大型數據庫，來做更新一代的測序和序列比對，結果會更準確。

當患者有免疫缺陷時，使用宏基因組測序來做診斷特別有用。有廣泛的傳染原會對有免疫能力缺陷的人造成嚴重傷害，因此臨床篩檢更須廣泛的運用。另外，患者症狀通常是不一定是典型，易查覺的，這會讓憑症狀來檢測的臨床診斷更加困難。第三，依賴檢測抗體的診斷方法不容易成功。因此，對於病原體進行廣泛，更靈敏的檢測，以檢測出感染性物質（而非抗體）的需求就更殷切。

測試結果指證

診斷能協助制定有效的治療，或採取預防措施，但是在發展出療程或者預防措施之前，增進對疾病進程的了解，會產生對傳染原特定診斷的指證（英语：Indication (medicine)）。例如，在 1980年代初期，在利用齊多夫定治療愛滋病之前，利用密切監測疾病的進程，檢驗患者的血液樣本成分，縱然所得結果無法為患者提供任何進一步的治療。但是對於愛滋病出現在特定社群中的研究，在某種程度上發展出病毒傳播途徑的假說。了解疾病的傳播方式，就可以把資源投往風險最大的社群，以減少新的感染病例。

針對愛滋病的特異性血清學診斷鑑定，以及後來的基因型，或分子鑑定，讓人們能夠建立關於病毒的時間和地理學起源的假說，以及其他甚多的假說。[17] 利用分子診斷的發展，讓醫生和研究人員能夠監測抗反轉錄病毒藥物的治療成效。現在，分子診斷法通常早在疾病發作之前，就已用於一般健康人群中鑑定是否有愛滋病毒的感染，並已證明是有人群，他們對病毒感染是具有遺傳的抗性。因此，雖然目前仍然無法根治愛滋病，但對於感染者做鑑定病毒和監測他們血液中的病毒水準，仍對患者本身以及社區，都具有巨大的醫療和預測的效益。

預防

主要文章：公共衛生與感染預防與控制（英语：Infection prevention and control）

洗手，可以有效防止感染性疾病的傳播。[36]

洗手，穿著防護衣，戴口罩等，可以防止人與人之間的感染。在 19世紀後期，無菌技術被引入醫學和外科手術中，大幅降低因手術所引起的感染發生率。經常洗手仍然是最重要的防止感染擴散預防手段。[37] 其他的預防措施，例如避免使用違禁藥物，使用避孕套，戴手套，以及保持均衡飲食，和定期運動的健康生活方式。熟食，和避免吃長期曝露在外的食物也很重要。 用於防止感染傳播的抗菌物（英语：Antimicrobial）包括：

  • 消毒藥水，應用於活體組織/皮膚
  • 消毒劑，可消滅非生物體上的微生物。
  • 抗生素，在做感染預防時被稱為預防劑。但是，長期使用抗生素會產生細菌的耐藥性。人類無法對抗生素產生免疫力，但細菌卻可以。因此，避免非必要性的長時間使用抗生素，有助於防止細菌形成耐藥性的突變。

要預防或減慢感染病傳播的方法之一，是去了解各種疾病的不同特徵。[38] 應評估的一些關鍵特徵包括病毒性，患者的活動範圍，以及感染性。例如，伊波拉病毒極快的讓受害者病倒，並很快死亡。結果，受害者沒機會遠離他們最初的感染地點。[39] 而且，這種病毒必須通過皮膚的病變，或者諸如眼睛的可滲透膜傳播。伊波拉病毒的初始階段感染性不高，受害者僅發生內部出血。由於前述特徵，伊波拉病毒的傳播雖然非常迅速，但是通常只發生在相對狹小的地理範圍之內。相反的，愛滋病病毒透過攻擊受害者的免疫系統，緩慢地殺死受害者。[17] 結果，它的許多受害者甚至在沒有意識到自己罹患這種疾病之前就將病毒傳播給其他人。而且，愛滋病相對較低的病毒性讓受害者能夠長途跋涉，增加成為流行病的機率。

降低感染病傳播率的另一種有效方法是，認識到小世界網路的影響。[38] 在流行病中，感染者的地理集點或群體之內通常互動頻繁，而且和離散集點內的易感個體有其他互動。雖然離散集點之間的互動不強，但疾病仍可以跳傳給離散集點中易感的人。因此，如果把受感染集點內個人間的互動消除，小世界網絡中的感染率就可降低。但是，如果把重點放在防止集點間的疾病跳傳，則可大幅降低感染率。在患有愛滋病吸毒者密度高的地區，使用換新針頭的措施，是成功實施這種降低傳染措施的一個示例。 [完整來源請求] 另一個例子是在 2001年英國諾森伯蘭郡，對鄰近農場中的潛在易感牲畜撲殺或作疫苗接種，以防止口蹄疫病毒的傳播。[40] 防止病媒傳播病原體的一般做法是做病蟲害防治。 如果僅僅是懷疑有感染，可以做個體隔離檢疫，直到疾病潛伏期過去，讓疾病發生，或者證明個體仍然健康無恙為止。團體可能要做檢疫隔離，如果是發生在社區，就會劃定防疫線（英语：cordon sanitaire），限制社區居民的行動，以防止感染擴散到社區之外，或者用保護性隔離（英语：protective sequestration），防止在社區內傳播。公共衛生當局可以實施其他形式的保持社交距離，例如關閉學校，以控制，不讓流行病形成。

免疫

瑪莉·馬龍（又稱傷寒瑪麗），是傷寒病菌的帶原者。在她擔任廚子的期間，把傷寒傳染給 53人，其中 3人因而過世。

導致感染的大多數病原體不會導致宿主死亡，並且在疾病痊癒後，侵害性生物最終會被清除。[16] 這個過程需要免疫系統來殺死病原體，或者利用疫苗接種來鈍化病原體的作用。對感染性疾病的特定性免疫可以透過抗體和/或T細胞介導而取得。這兩個介導的免疫力可表現為：

  • 對病原體的直接影響，例如抗體引發的補體系統依賴性溶菌作用，調理素作用，吞噬作用，和殺滅作用，對某些細菌有用，
  • 中和病毒，讓這些生物無法進入細胞，
  • 或者是讓 T細胞把被微生物寄生的細胞殺死。

免疫系統對微生物的反應，通常會引起諸如發高燒和發炎等症狀，有時候這些反應比微生物引起的損害更具破壞性。[17]

對疾病的抵抗力（免疫力）可透過幾種方式獲得 - 疾病痊癒後，成為病原體的帶原者，通過攜帶具有相似結構的生物（交叉反應（英语：Cross-reactivity）），或者接種疫苗。人類目前對主要病原體的保護性抗原，和特定獲得宿主免疫因子的知識，所了解的程度，比對機會性病原體的更為完整。還有一種群體免疫的現象 - 當足夠多的人口已經具有對某些感染的免疫力時，就可以為那些本來就很脆弱的人們提供一定程度的保護。 當宿主遇到病原體時，對感染病的免疫抵抗力就需要達到臨界高度的抗原特異性抗體和/或 T細胞來提供。雖然某些人很少或根本沒有接觸過某些病原體的表面多醣，但他們仍會產生針對這些病原體表面多醣的天然血清抗體，這些天然抗體可提供成年人特異性保護，這種被動免疫會傳播給新生兒。

宿主遺傳因素

受到特定感染原所感染的生物稱為宿主。宿主身上的病原體處於成熟或性活躍階段的，稱為最終宿主。中間宿主體內的病原體是在在幼蟲階段。宿主可以是任何活著的東西，並讓病原體做無性和有性繁殖。[41] 患者體內病原體的清除，無論是經過治療的，還是人體自發的，都會受到各個患者自身遺傳變異的影響。

例如，對於用聚乙二醇化干擾素-α-2a（英语：Pegylated interferon alfa-2a），或者聚乙二醇化干擾素-α-2b（英语：Pegylated interferon-alpha-2b）（前者商標名為 Pegasys，後者商標名 PegIntron）與利巴韋林合併治療的基因型1型 C 型肝炎，已證明人類 IL28B 基因附近的遺傳多態性干擾素λ3編碼（英语：interferon lambda 3），會在治療時對病毒的清除率有顯著的差異。最初在《自然雜誌》上發表的這一發現[42] 顯示，攜帶 IL28B 基因附近某些遺傳變異等位基因的 1 型 C 型肝炎患者，比其他人更可能達成持續病毒學抑制反應。後來《自然雜誌》的報導[43] 證明，相同的遺傳變異也與基因型 1 型 C 型肝炎病毒的自然清除率有關。

治療

當感染攻擊身體時，抗感染藥物可用來作感染抑制。根據所針對的感染原類型，市面已有幾種廣泛使用的抗感染藥物 - 包括抗菌劑（抗生素；包括抗結核藥物），抗病毒藥物，抗真菌藥，和抗寄生蟲藥（英语：antiparasitic）（包括抗原蟲藥（英语：antiprotozoal），和驅蟲藥）。根據感染的嚴重程度和類型，抗生素可用口服或注射方式，也可以做外用藥物使用。嚴重的腦部感染通常用靜脈注射治療。有時，如果患者對一種抗生素有抗藥性，就會同時使用多種抗生素。抗生素僅對細菌有作用，對病毒則無。抗生素的作用是可抑制細菌繁殖，或者殺死細菌。藥物中最常見的抗生素類別包括青黴素，頭孢菌素，氨基糖苷類抗生素，大環內酯類，喹諾酮類抗生素（英语：quinolone antibiotic）和四環素類。[來源請求] 並非所有感染都要治療，有許多自限性感染，治療可所帶來的副作用會多過好處。良好的抗菌管理（英语：Antimicrobial stewardship）的概念是，醫護人員應在最短的時間內使用最有效的抗菌藥物，並僅在已知或高度推斷病原體會對投入藥物有反應時才施藥。[44]

流行病學

2012年，世界各地因為感染性疾病及寄生蟲病導致每百萬人的死亡人數
  28-81
  82-114
  115-171
  172-212
  213-283
  284-516
  517-1,193
  1,194-2,476
  2,477-3,954
  3,955-6812
2004年，全世界各地因為感染性疾病及寄生蟲病所導致的失能調整生命年。[45]
  no data
  ≤250
  250–500
  500–1000
  1000–2000
  2000–3000
  3000–4000
  4000–5000
  5000–6250
  6250–12,500
  12,500–25,000
  25,000–50,000
  ≥50,000

在 2010年，估計全球約有 1,000萬人因感染病而死亡。[46] 世界衛生組織按照國際疾病與相關健康問題統計分類收集全球相關死亡的資訊。下表按死亡率列出 2002年最主要的傳染病。 1993年的數據也包括在內，以利比較。

全世界因感染性疾病而導致的死亡人數[47][48]
排名 死因 2002年死亡人數
(百萬)		 百分比
總死亡人數		 1993年死亡人數
(百萬)		 1993年排名
N/A All infectious diseases 14.7 25.9% 16.4 32.2%
1 下呼吸道感染[49] 3.9 6.9% 4.1 1
2 愛滋病 2.8 4.9% 0.7 7
3 腹瀉[50] 1.8 3.2% 3.0 2
4 肺結核 1.6 2.7% 2.7 3
5 瘧疾 1.3 2.2% 2.0 4
6 麻疹 0.6 1.1% 1.1 5
7 百日咳 0.29 0.5% 0.36 7
8 破傷風 0.21 0.4% 0.15 12
9 腦膜炎 0.17 0.3% 0.25 8
10 梅毒 0.16 0.3% 0.19 11
11 B型肝炎 0.10 0.2% 0.93 6
12-17 6種熱帶疾病（英语：tropical disease）[51] 0.13 0.2% 0.53 9, 10, 16–18
註記：其他的死因包括孕產婦和圍產期病症 (5.2%), 營養不良 (0.9%)，
非傳染性病症 (58.8%)，和受傷(9.1%).

歷史性上的大流行

1720年的馬賽大瘟疫造成城內，以及周圍地域有 10萬人喪生

由於感染病具有不可預測的，爆炸性的潛在因素，一直在人類歷史上佔有重要地位。[52] 大流行（或全球流行病）是一種影響到廣大地理區域內人們的疾病。例如：

  • 查士丁尼大瘟疫，從公元 541年到 542年，歐洲有 50％至 60％的人口因而死亡。[53]
  • 發生在 1347年至 1352年的黑死病，在 5年內歐洲有 2,500萬人死亡。這場在 14世紀的瘟疫讓舊世界的人口，估計從 4.5億減少到 3.5 至 3.75億。
  • 在 15和 16世紀，歐洲探險家把天花，麻疹和斑疹傷寒帶進中美洲和南美洲地區，在當地原住民中引起大流行。據說在 1518至 1568年之間，墨西哥的人口因此從 2,000萬下降到 300萬。[54]
  • 歐洲首次流行性感冒大流行發生在 1556年至 1560年之間，估計死亡率為 20％。[54]
  • 在 18世紀，天花估計導致 6,000萬歐洲人喪生[55]（等於每年死亡約 40萬人）。[56] 高達 30％的受感染者（包括 80％的 5歲以下兒童）死亡，而有三分之一的倖存者失明。[57]
  • 在 19世紀，結核病殺死歐洲成年人口的四分之一； [58] 到 1918年，法國有六分之一的死亡仍是由結核病所引起。
  • 1918年的流感大流行（或稱西班牙流感），有 2千 5千萬人喪生（約佔當時世界人口 17億的 2％）。[59] 今日，流感每年在全球造成 25萬至 50萬人死亡。

新興疾病

在大多數情況，微生物透過互利共生或偏利共生與宿主和諧相處。當現有的寄生物成為病原體，或新的致病性寄生物進入新的宿主時，就會產生疾病。

  1. 寄生物與宿主之間的共同進化可能導致宿主對寄生物產生抵抗力，但是當這些寄生物因進化而產生更大的病毒性，就會導致免疫病理（英语：Immunopathology）疾病。
  2. 人類活動與許多新興傳染病有關，例如生態環境變化讓寄生物佔有新的生態位。發生這種情況，原本只局限限在偏遠生境的病原體可散佈到更廣的範圍，並且成為新的宿主。從非人類宿主躍遷到人類宿主的寄生物被稱為人畜共通傳染病。當寄生物入侵到新的宿主物種時，可能會成為新的宿主的病原菌，產生疾病。[60]

人類有些活動，導致人畜共通傳染病的病原體產生，包括病毒，細菌，原生動物，和立克次體[61]，以及傳播依靠病媒傳播的疾病[60] 。

另請參見全球化與疾病和野生動物疾病（英语：wildlife disease）：

  • 對野生動物棲息地的侵犯。新農村的興建，和在原是農村地區做住房開發，野生動物被迫生活在人口稠密的地區，提供讓微生物變異和發展的機會。[62]
  • 農業經營的變化。新農作物的引進，吸引新的病蟲害和新的微生物進入農業區域，使當地人們面臨前所未有的疾病。
  • 雨林遭受破壞。隨著各國在森林中修建道路，和開闢林地作為人類定居點或做商業開發，人們會因此遇到的昆蟲和動物，它們身上帶有以前未知的微生物。
  • 無節制的城市化。許多發展中的國家，迅速發展的城市，往往讓大量人口集中在衛生條件極差的地區。這會助長感染病的傳播。
  • 現代的運輸。往往船舶和貨船會載有意外的“乘客”，這就有機會把疾病傳播到遙遠的地方。目前利用噴射客機旅行，已經受到感染的人，可以在症狀出現之前，就把病原體攜帶到遙遠的土地，或者帶回自己的住家。

細菌病學理論

主要文章：疾病菌源理論（英语：Germ theory of disease）

File:Stamps of Germany (DDR) 1980, MiNr Zusammendruck 2534-2537.jpg
當年在東德發行的郵票，顯示四部古董顯微鏡，顯微鏡學在早期是促成對感染性疾病研究進展的重要工具。

在上古時期，古希臘歷史學家修昔底德（生卒約為公元前 460年到 400年）是首度描述雅典大瘟疫的人，他認為疾病可能會從受感染者傳播到其他的人。[63][64] 希臘羅馬（請參考古典時代）醫師蓋倫在他論及《關於不同類型的發燒》（約在公元175年）作品中推測，瘟疫是靠空氣中存在的 “某些瘟疫種子” 而傳播。[65] 在梵文古籍《妙聞本集（英语：Sushruta Samhita）》中，印度醫生妙聞提出的理論是：“麻風病，發燒，結核病，眼疾，和其他感染病，是因為人們通過性結合，身體接觸，一起飲食，一起就寢，同坐，還有共穿彼此的衣服，共用彼此的花環，等所造成。” [66][67] 這本書撰寫的年代大約是在公元前六世紀。[68] 感染病理論的雛形是由波斯醫師伊本·西納（在歐洲被稱為阿維森納（Avicenna））在他的作品《醫典（英语：The Canon of Medicine）》（公元1025年）中提出，這本書後來成為歐洲最具權威的醫學教科書，直到 16世紀為止。在《醫典》第四卷，伊本·西納討論到流行病，概述古典的瘴氣說法，並設法把自己的早期感染理論與之融合。他提到人們可以因呼吸而將疾病傳播給他人，說明肺結核的傳染，並提出疾病可通過水和土壤而傳播。[69] 後來，阿尤布王朝的幾位伊斯蘭學者討論到隱形感染的概念，他們稱其為najasat（英语：不潔物）。伊斯蘭教法學學者伊本·哈吉·阿卜杜里（英语：Ibn al-Haj al-Abdari）（生卒約為 1250年至 1336年）在討論符合教規的食物 (伊斯蘭教) 和伊拉蘭衛生律法（英语：Islamic hygienical jurisprudence）時，警告人們，感染病會污染飲水，食物，和衣服，並會通過供水傳播，並隱喻感染病是透過看不見的粒子傳播的。[70]

當黑死病鼠疫在 14世紀傳播到安達盧斯時，阿拉伯醫師 Ibn Khatima（約在 1369年）和Ibn al-Khatib（英语：Ibn al-Khatib）（生卒約為 1313年到 1374年）假設傳染病是由 “微小的個體” 所引起，並描述感染病可以通過衣服，船隻和耳環傳播。.[71] 在文藝復興時期，特別是因為透過義大利醫生吉羅拉莫·弗拉卡斯托羅的作品，感染病的概念在歐洲變得更為流行。[72] 安東尼‧范‧雷文霍克（英语：Antonie van Leeuwenhoek）（生卒，1632年到 1723年）率先利用顯微鏡觀察微生物，從而推動顯微鏡學的發展。

在 19世紀中葉，約翰·斯諾和威廉·布德（英语：William Budd）兩位醫師證明被污染的水可導致傷寒和霍亂的傳染。兩位醫師在他們居住的小鎮，通過防止水污染的措施，而減少霍亂的流行。[73] 路易·巴斯德更確證某些疾病是由感染原所引起，並開發出狂犬病疫苗。羅伯·柯霍做出柯霍氏法則，作為感染病研究的依據。愛德華·詹納，喬納斯·索爾克，和阿爾伯特·沙賓分別開發出天花和小兒麻痺症疫苗，天花因而被消滅，而小兒麻痺症幾近被消滅。亞歷山大·弗萊明發現世界上第一種抗生素，青黴素，然後由霍華德·弗洛里和 恩斯特·伯利斯·柴恩開發出來。 格哈德·多馬克開發出磺胺類藥物，這是第一種廣泛化學合成的抗生素。

相關醫學專家

感染病的治療屬於感染性疾病醫學（英语：Infectious disease (medical specialty)） 領域，而感染病傳播的研究有時就屬於流行病學領域。通常，感染是由初級醫療醫生或內科醫生做診斷。例如，“單純性”肺炎通常最初由內科醫生或胸腔醫學醫師治療。因此，感染病專科醫師的工作，需要與患者，以及普通科醫生以及實驗室科學家，免疫學家，細菌學家，還有其他專家共同合作。

在以下的情況，可能會動用到感染病小組：

  • 初次檢查時，無法明確診斷出是哪種感染；
  • 患者有免疫缺陷（例如，患有愛滋病，或做化學療法之後）；
  • 病原體具有罕見的性質（例如熱帶疾病（英语：tropical disease））；
  • 感染對所施用的一線抗生素無反應；
  • 感染對其他患者可能有危險，必須將患者隔離。


化石記錄

主條目：古病理學 動物化石遺跡中的感染證據是古病理學家研究的題材。在肉食性恐龍的骨骼中曾發現有感染的跡象。但是，這些感染似乎僅限於身體上的小區域。有早期艾雷拉龍屬肉食性恐龍的頭骨，顯示出坑狀傷口，周圍有腫脹和多孔的骨頭。傷口周圍骨頭的異常紋理表明感染是短暫的，非致命性的。研究者推測，這是在與另一隻同類恐龍在搏鬥中所所發生。有感染證據的其他肉食性恐龍還包括高棘龍屬，異特龍屬，暴龍屬，和一隻在柯特蘭組地層（英语：Kirtland Formation）發掘出來的的暴龍化石。這兩隻都在搏鬥中被咬傷，就像艾雷拉龍一樣，受到感染。[74]

外太空

主要文章：太空航行對人體的影響，太空飛行期間的醫療（英语：Medical treatment during spaceflight），以及太空醫學（英语：Space medicine）

在 2006年的太空梭上所做的實驗發現，沙門氏菌亞種 Ⅰ 型（英语：Salmonella enterica subsp. enterica）（一種引起食物中毒的細菌），在太空中培養時，病毒性會變得更強。[75] 2013年 4月 29日，由美國國家航空航天局提供經費的壬色列理工學院的科學家報告說，在國際空間站的太空飛行期間，微生物似乎以“地球上未曾觀察到” 的方式和 “能夠導致增強生長和病毒性”。[76] 最近，在 2017年，細菌被發現對抗生素具有更強的抵抗力，並且能在近乎失重的太空環境中繁衍生息。[77] 根據觀察，微生物可以在外太空的真空環境中存活。[78][79]

另請參見

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